Gen
BRAF
B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase
- HGNC 1097↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000157764↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 673↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 7q34
- Souřadnice
- Chromozom 7: 140 730 665–140 924 929 (GRCh38)
- Exony
- 18 exonů na 194,3 kb
- Protein
- 766 aminokyselin, 84,4 kDa
- Další názvy
- BRAF1, BRAF-1
- Transkript MANE Select
- ENST00000646891.2NM_004333.6
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Sdílet tuto stránku
Tato stránka jako data
Chcete-li ji načíst jako JSON, přidejte na konec adresy stránky .json nebo si vyžádejte application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/braf.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si BRAF i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Noonan Syndrome
- Autozomálně dominantní
Noonan Syndrome (NS) is characterized by short stature, typical facial dysmorphism and congenital heart defects.
- ClinGen středníClinGen hodnotí vazbu: střední
- GenCC 44 zadavatelů GenCC jej hodnotí jako definitivní nebo silný
▶Akcionabilita
Cardiac surveillance, developmental support, growth hormone therapy, genetic counseling, MEK inhibitor trials
- Noonan Syndrome and Noonan-Related Syndromes
A group of RAS pathway conditions, including Noonan, Costello, cardiofaciocutaneous and Legius syndromes, with variable heart defects, short stature and distinctive facial features.
- ClinGen průkaznáClinGen hodnotí vazbu: průkazná
- GenCC 66 zadavatelů GenCC jej hodnotí jako definitivní nebo silný
▶Akcionabilita
Knowing about it supports heart, growth and developmental assessment.
Širší skupiny
Hypertrophic Cardiomyopathy
- Autozomálně dominantní
Jeden z 62 genů spojených s touto vazbou
A condition in which the myocardium is hypertrophied without an obvious cause. The hypertrophy is generally asymmetric and may be associated with obstruction of the ventricular outflow tract.
- ClinGen průkaznáClinGen hodnotí vazbu: průkazná
- GenCC 66 zadavatelů GenCC jej hodnotí jako definitivní nebo silný
▶Akcionabilita
Beta-blockers, non-dihydropyridine calcium channel blockers, activity restriction, genetic counseling
Přečtěte si BRAF i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestJak je BRAF uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6,5 kb z 194,3 kb genu; 2 301 těchto bází kódují protein.
Sekvenování BRAF
29Střední
Jak obtížně se BRAF sekvenuje krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Některé exony genu BRAF leží tam, kde krátká čtení mohou změnu přehlédnout nebo ji zařadit na špatné místo.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu BRAF v každém druhu obtížné oblasti
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 100.3,9 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.38 %
- Sdíleno s chrYPseudoautozomální oblasti a oblast X-transponovaná, kde chrX a chrY nesou stejnou nebo téměř stejnou sekvenci, takže čtení z jednoho může být umístěno na druhém. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 60.0 %
- Pokrytí referenční sekvenceMezery v referenční sestavě v okolí, kde pro čtení není sekvence, na kterou by se mohla zarovnat. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 50.0 %
- RepeticeTandemové repetice a série jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přečíst celé. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 30.6 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá řídce. Gen zcela v tomto druhu oblasti by samostatně získal skóre 20.17 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, vycházející z map obtížně sekvenovatelných oblastí NIST Genome in a Bottle.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu BRAF v daném druhu obtížné oblasti. Každý druh sám o sobě může gen učinit obtížným a každý další přidává méně: 0, pokud žádná báze nespadá do žádné z oblastí, 100, pokud každá báze leží tam, kde čtení nelze jednoznačně umístit.
78
pozic v BRAF, kde ClinVar řadí změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
4 z nich (5,1 %) spadají do oblastí, které krátká čtení obtížně zachytí.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (1 místo)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (3 míst)
Celogenomové sekvenování pokrývá všech 194,3 kb genu BRAF, včetně intronů, nejen 6,5 kb exonů.
Varianty se stránkou (10)
Varianty genu BRAF se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A246P | c.736G>C | Exon 6 | 140 801 536 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.735A>T | Exon 6 | 140 801 537 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.739T>C | Exon 6 | 140 801 533 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| F247L | c.741T>G | Exon 6 | 140 801 531 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| F247S | c.740T>C | Exon 6 | 140 801 532 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| F247V | c.739T>G | Exon 6 | 140 801 533 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| L245F | c.735A>C | Exon 6 | 140 801 537 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| N581D | c.1741A>G | Exon 14 | 140 754 187 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| Q257R | c.770A>G | Exon 6 | 140 801 502 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| T244P | c.730A>C | Exon 6 | 140 801 542 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Patogenní varianty ClinVar (108)
Varianty genu BRAF, které ClinVar klasifikuje jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní u libovolné choroby, s hodnocením alespoň jednoho zadavatele podle kritérií, a nejlépe hodnocené z nich. Jde o veřejný záznam ClinVar o genu, nikoli o výsledek.
- Patogenní 66
- Patogenní/pravděpodobně patogenní 4
- Pravděpodobně patogenní 38
| Varianta | Choroby | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_004333.6(BRAF):c.1799T>G (p.Val600Gly) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1796C>G (p.Thr599Arg) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1796C>T (p.Thr599Ile) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1787G>T (p.Gly596Val) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1785T>G (p.Phe595Leu) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1781A>T (p.Asp594Val) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1741A>G (p.Asn581Asp) | cardiofaciocutaneous syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1455G>C (p.Leu485Phe) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1455G>T (p.Leu485Phe) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1406G>A (p.Gly469Glu) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1391G>A (p.Gly464Glu) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.770A>G (p.Gln257Arg) | cardiofaciocutaneous syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.741T>G (p.Phe247Leu) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.739T>C (p.Phe247Leu) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.736G>C (p.Ala246Pro) | cardiofaciocutaneous syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.735A>C (p.Leu245Phe) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.735A>T (p.Leu245Phe) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.730A>C (p.Thr244Pro) | cardiofaciocutaneous syndrome | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.722C>A (p.Thr241Lys) | RASopathy | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1595G>A (p.Cys532Tyr) | RASopathy | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1454T>C (p.Leu485Ser) | RASopathy | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.793G>C (p.Gly265Arg) | RASopathy | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.740T>C (p.Phe247Ser) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.739T>G (p.Phe247Val) | Noonan syndrome and Noonan-related syndrome | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| NM_004333.6(BRAF):c.1914T>G (p.Asp638Glu) | Noonan syndrome 7 a 4 dalších | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ERFETS2 repressor factorSdílí 3 onemocnění
- KRASKRas proto-oncogene, GTPaseSdílí 3 onemocnění
- LZTR1leucine zipper like post translational regulator 1Sdílí 3 onemocnění
- MAPK1mitogen-activated protein kinase 1Sdílí 3 onemocnění
- MRASmuscle RAS oncogene homologSdílí 3 onemocnění
- NRASNRAS proto-oncogene, GTPaseSdílí 3 onemocnění
- PPP1CBprotein phosphatase 1 catalytic subunit betaSdílí 3 onemocnění
- PTPN11protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11Sdílí 3 onemocnění
- RAF1Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinaseSdílí 3 onemocnění
- RIT1Ras like without CAAX 1Sdílí 3 onemocnění
- RRAS2RAS related 2Sdílí 3 onemocnění
- SHOC2SHOC2 leucine rich repeat scaffold proteinSdílí 3 onemocnění
Rysy spojené s BRAF
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit BRAF. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Big calvaria
- Broad neck
- Bulbous nose
- Coarse facial features
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full lower lip
- Long philtrum
Zobrazit ještě 51 rysů
- Long, narrow head
- Low hairline at back of neck
- Narrow forehead
- Palpebral thickening
- Prominent forehead
- Short neck
- Short nose
- Sparse eyebrow
- Webbed neck
- Abnormal eyelashes
- Absent eyebrow
- Broad opening between the eyelids
- Cystic hygroma
- Flattened bony protrusion above eyes
- Full cheeks
- High forehead
- High palate
- Little lower jaw
- Long face
- Midface retrusion
- Nasal tip, upturned
- Sparse or absent eyebrows
- Sparse scalp hair
- Thickened skin folds of neck
- Triangular face
- Abnormality of the chin
- Abnormality of the face
- Broad forehead
- Cheekbone underdevelopment
- Dark color of gums
- Decreased width of the skull
- Deep philtrum
- Eye folds
- Frontal bossing
- Full lips
- Moon face
- Sparse or absent eyelashes
- Wide nasal bridge
- Big sella turcica
- Broad head shape
- Cleft palate
- Submucous cleft hard palate
- Abnormality of the bone of the forehead
- Abnormality of the nasal bone
- Abnormal dentition
- Absent eyelashes
- Bad bite
- High, narrow palate
- Open bite
- Open mouth
- Relatively large head
Abnormality of the integument
- Curly hair
- Dry skin
- Few cafe-au-lait spots
- Hyperkeratosis
- Liver spots
- Numerous moles
- Abnormal skin pigmentation
- Beauty mark
Zobrazit ještě 42 rysů
- Brittle hair
- Excessive sweating
- Excessive wrinkled skin
- Fine hair
- Firm lump under the skin
- Freckling
- Giant pigmented mole
- Hyperelastic skin
- Mole
- Papule
- Abnormal blistering of the skin
- Abnormal fingerprints
- Abnormal hair quantity
- Buffalo hump
- Chicken skin
- Coarse hair
- Excessive hairiness
- Generalized hyperpigmentation
- Ichthyosis
- Lack of sweating
- Lentigo maligna melanoma
- Multiple birthmarks
- Patchy darkened skin
- Plethora
- Poor fingernail formation
- Poor wound healing
- Slow-growing hair
- Sparse hair
- Stretch marks
- Thin skin
- Afro-textured hair
- Birthmark
- Cutaneous melanoma
- Excessive hair growth
- Flushing
- Itching
- Loose redundant skin
- Nevus sebaceous
- Open skin sore
- Patchy loss of skin color
- Atypical mole
- Atypical nevi in non-sun exposed areas
Abnormality of the nervous system
- Abnormal shape of hypothalamus
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebrum
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- Severe global developmental delay
- Abnormal speech pattern
Zobrazit ještě 35 rysů
- Difficulty articulating speech
- Global developmental delay
- Intracranial cystic lesion
- Autism
- Behavioral abnormality
- Can't control feelings
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- Excessive daytime sleepiness
- Headache
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Cancer of early nerve cells
- Depression
- Increased appetite
- Intellectual disability, mild
- Memory impairment
- Pauses in breathing while sleeping
- Peripheral axonal neuropathy
- Pressure on spinal cord
- Psychotic episodes
- Rise in pressure inside skull
- Specific learning disability
- Spina bifida occulta
- Suicidal ideation
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Coma
- Dementia
- Panic attack
- Paranoia
- Psychosis
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Cognitive impairment
- Tongue thrusting
- Underdeveloped frontal lobe
Abnormality of the cardiovascular system
- Increased spleen size
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal EKG
- Abnormal heart rate
- Abnormal heart valve morphology
- Abnormal pulmonary valve morphology
- Abnormality of lung artery
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
Zobrazit ještě 25 rysů
- Bundle branch block
- Enlarged and thickened heart muscle
- Narrowing of lung artery
- Narrowing of pulmonic valve
- Abnormal mitral valve morphology
- Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of the lymphatic system
- Abnormality of the spleen
- Capillary fragility
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Disease of the heart muscle
- High blood pressure
- Hole in center of heart
- Mitral valve prolapse
- Tetralogy of Fallot
- Abnormal endocardium morphology
- Aneurysm
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- Heart attack
- Livedo reticularis
- Narrowing of aorta
- Stroke
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Patent ductus arteriosus
- Abnormal aortic valve morphology
Abnormality of the musculoskeletal system
- Delayed bone maturation
- Funnel chest
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Scoliosis
- Shield chest
- Wide rib cage
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Double-Jointed
Zobrazit ještě 19 rysů
- Generalized decreased muscle tone
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Pigeon chest
- Fatiguable weakness of proximal limb muscles
- High shoulder blade
- Osteoporosis
- Wasting of muscles near the body
- Abnormality of the sternum
- Compression fracture of a vertebral body
- Increased susceptibility to fractures
- Osteopenia
- Death of bone due to decreased blood supply
- Hypophosphatemic rickets
- Kyphoscoliosis
- Pectus excavatum of inferior sternum
- Spasticity and rigidity of muscles
- Superior pectus carinatum
- Synovitis
Abnormality of the eye
- Blue eyes
- Bulging eye
- Farsightedness
- Wide-set eyes
- Abnormality of the eye
- Abnormality of vision
- Drooping upper eyelid
- Abnormal visual field test
Zobrazit ještě 16 rysů
- Bitemporal hemianopia
- Close sighted
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Papilledema
- Progressive visual field defects
- Slow decrease in sharpness of vision
- Cerebral visual impairment
- Optic atrophy
- Optic nerve compression
- Partial loss of field of vision
- Sudden decrease in vision
- Oculomotor apraxia
- Optic nerve dysplasia
- Progressive loss of vision
- Uveal melanoma
Abnormality of the endocrine system
- Enlarged pituitary gland
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Hypopituitarism
- Increased circulating cortisol level
- Neoplasm of the anterior pituitary
- Paradoxical increased cortisol secretion on dexamethasone suppression test
- Pituitary corticotropic cell adenoma
- Central adrenal insufficiency
Zobrazit ještě 9 rysů
Growth abnormality
- Growth delay
- Short stature
- Faltering weight
- Faltering weight in infancy
- Prenatal growth deficiency
- Abdominal obesity
- Birth weight > 90th percentile
- Increased body weight
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the ear
- Ears rotated toward back of head
- Low-set ears
- Sensorineural hearing impairment
- Thickened helices
- Severe sensorineural hearing impairment
- Large earlobe
- Large ears
- Aplasia of the semicircular canal
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a poloha.
- MANE Select v1.5, od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-23: se kterými onemocněními je gen spojen a jak silně.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachytí.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Model AlphaFold DB AF-P15056-F1, verze 6, od Google DeepMind a EMBL-EBI (CC BY 4.0): struktura proteinu tak, jak ji předpovídá AlphaFold, nikoli naměřená, a jeho spolehlivost v každé části.
- Vydání dat 2026.10.23-dc0c0517.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen BRAF: B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase. Staženo 24. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/braf
Dante Labs. Gen BRAF: B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase [Internet]. [citováno 24. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/braf
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů