Gene
HLA-DRB1
major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
- HGNC 4948↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000196126↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 3123↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 6p21.32
- Coordenadas
- Cromossoma 6: 32 578 775–32 589 848 (GRCh38)
- Exões
- 6 exões ao longo de 11,1 kb
- Proteína
- 266 aminoácidos
- Símbolos anteriores
- HLA-DR1B
- Transcrito MANE Select
- ENST00000360004.6NM_002124.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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url <- "https://dantelabs.com/genes/hla-drb1.json"
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page$gene$nameAnalise HLA-DRB1, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Nenhum relatório do Genome Test analisa HLA-DRB1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como HLA-DRB1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 1,2 kb dos 11,1 kb do gene; 801 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de HLA-DRB1
64Difícil
Grau de dificuldade de sequenciar HLA-DRB1 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Grande parte de HLA-DRB1 se situa em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.
O que acresce: a proporção dos exões de HLA-DRB1 em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTroços onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 100.6,7%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.100%
- Partilhado com o chrYAs regiões pseudoautossómicas e a região transposta do X, onde o chrX e o chrY têm a mesma sequência ou uma quase idêntica, pelo que uma leitura de um pode ser posicionada no outro. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 50.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, em que as leituras escorregam e podem não as abranger. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 30.0%
- Conteúdo em GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma deficiente. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 20.21%
Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de HLA-DRB1 que se encontram nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em zonas onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
1
posição em HLA-DRB1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Destas, 1 (100%) situam-se numa região que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- MHCThe major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference. (1 local)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 local)
Um genoma completo cobre todos os 11,1 kb de HLA-DRB1, incluindo os intrões, e não apenas os 1,2 kb de exões.
ClinVar pathogenic variants (1)
The HLA-DRB1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Provavelmente patogénica 1
| Variante | Conditions | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_002124.4(HLA-DRB1):c.764-2A>G (opens in a new tab) | multiple sclerosis, susceptibility to | Provavelmente patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
Características associadas a HLA-DRB1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que HLA-DRB1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the nervous system
- Cataplexy
- Cognitive impairment
- CSF pleocytosis
- Difficulty sleeping
- Difficulty staying or falling asleep
- Excessive daytime sleepiness
- Hallucinations
- Headache
Mostrar mais 28 características
- Transient global amnesia
- Abnormal rapid eye movement sleep
- Anxiety
- Attention deficit
- Depression
- Hypnagogic hallucination
- Hypnopompic hallucination
- NREM parasomnia
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal cerebrospinal fluid morphology
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Difficulty articulating speech
- Difficulty finding words
- Epilepsy
- Migraine
- Pauses in breathing while sleeping
- Peripheral neuropathy
- Pins and needles feeling
- Restlessness
- Sleep paralysis
- Slurred speech
- Visual hallucinations
- Chorea
- Psychosis
- Can't control feelings
- CNS demyelination
- Incoordination
Abnormality of the cardiovascular system
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- Hives
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Abnormal systemic blood pressure
- Foam cells
Mostrar mais 26 características
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Jaw pain while chewing
- Mucosal telangiectasiae
- Raynaud phenomenon
- Telangiectasia of the skin
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormal cardiac ventricular function
- Abnormal heart rate
- Abnormal lymph node histology
- Absent superficial temporal artery pulse
- Cardiac failure
- Double outlet right ventricle with subpulmonary ventricular septal defect without pulmonary stenosis
- Fainting spell
- Heart block
- Hypertensive crisis
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- increased pulmonary artery pressure
- Livedo reticularis
- Portal hypertension
- Sudden cardiac death
- Swelling or irritation of membrane around heart
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Ventricular tachycardia
- Fluid around heart
- Generalized swelling of lymph nodes
Abnormality of the eye
- Abnormal pupillary function
- Blurred vision
- Chorioretinal hypopigmentation
- Clouding of the lens of the eye
- High eye pressure
- Iridocyclitis
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal detachment
Mostrar mais 22 características
- Retinal nerve fiber edema
- Uveitis
- Visual impairment
- Weakness of muscles controlling eye movement
- Amaurosis fugax
- Anterior uveitis
- Blindness
- Corneal keratic precipitates
- Dalen-Fuchs nodules
- Damaged optic nerve
- Double vision
- Drooping upper eyelid
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Glaucoma
- Increased tears
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Partial loss of field of vision
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Visual loss
- Noninflammatory retina disease
- Chorioretinitis
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Autoimmunity
- Eczema
- Recurrent infections
- Skin rash
- Anti-BP180 antibody positivity
- Anti-BP230 antibody positivity
- Anti-complement component C1q antibody positivity
Mostrar mais 22 características
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmune antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Erythema nodosum
- Increased circulating interleukin 6 concentration
- Malar rash
- Psoriasiform dermatitis
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Maculopapular exanthema
- Meningitis
- Non-infectious meningitis
- Serositis
Abnormality of head or neck
- Abnormal eyelashes
- Abnormality of the eyebrow
- Chewing difficulties
- Sparse scalp hair
- Conjunctival hyperemia
- Decreased salivary flow
- Dental cavities
- Drooling
Mostrar mais 18 características
- Nuchal rigidity
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormal conjunctiva morphology
- Abnormality of mucosa of nose
- Abnormality of salivation
- Bell's palsy
- Dacryocystitis
- Dry eye syndrome
- Enlarged tear gland
- Enlargement of parotid gland
- Inflammation of the lips
- Inflammation of the tongue
- Mouth sore
- Oral mucosal blisters
- Parotitis
- Recurrent sore throat
- Scalp tenderness
- Abnormality of the salivary glands
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Intraalveolar phospholipid accumulation
- Lung infiltrates
- Abnormal pleura morphology
- Abnormality of lung structure
- Abnormality of the upper respiratory tract
- Cough
- Decreased DLCO
Mostrar mais 14 características
- Low blood oxygen level
- Pulmonary scarring
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Collapsed lung
- Crackles
- Crazy paving pattern
- Dry cough
- Emphysema
- Permanent enlargement of the airways of the lungs
- Upper airway obstruction
- Coughing up blood
- Mediastinal mass
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid lymphocyte proportion
Laboratory abnormality
- Diabetes mellitus
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Fever
- High ESR
- High urine protein levels
- Joint swelling
- Blood in urine
- Blood protein disease
Mostrar mais 13 características
- Elevated circulating alpha-globulin concentration
- Elevated circulating calprotectin concentration
- Elevated circulating osteopontin concentration
- Fluid around lungs
- High urine neutrophil count
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Chylothorax
- Elevated serum ferritin
- Elevated urine calcium levels
- High blood calcium levels
- Increased CSF protein concentration
- Swelling caused by excess lymph fluid under skin
- Hypothermia
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Anorexia
- Constipation
- Decreased liver function
- Malabsorption
- Nausea and vomiting
- Poor swallowing
- Abdominal pain
Mostrar mais 10 características
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Cancer of lymphatic system
- Decreased blood leukocyte number
- Elevated circulating D-dimer concentration
- Hyperfibrinogenemia
- Increased total T cell count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Blood clot in artery
Mostrar mais 5 características
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene HLA-DRB1: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1. Consultado em 20 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/hla-drb1
Dante Labs. Gene HLA-DRB1: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1 [Internet]. [consultado em 20 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/hla-drb1
Um teste. Respostas para toda a vida.
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