AtlasGen
HLA-DRB1
major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
- HGNC 4948↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000196126↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 3123↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 6p21.32
- Coordenadas
- Cromosoma 6: 32.578.775–32.589.848 (GRCh38)
- Exones
- 6 exones en 11,1 kb
- Proteína
- 266 aminoácidos
- Símbolos anteriores
- HLA-DR1B
- Transcrito MANE Select
- ENST00000360004.6NM_002124.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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url <- "https://dantelabs.com/genes/hla-drb1.json"
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page$gene$nameAnalice HLA-DRB1 y el resto de su genoma con una sola prueba.
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Obtener mi Genome TestInformes revisados relevantes para este gen
Ningún informe de Genome Test lee aún HLA-DRB1. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de HLA-DRB1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 1,2 kb de los 11,1 kb del gen; 801 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de HLA-DRB1
64Difícil
Dificultad de secuenciar HLA-DRB1 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Gran parte de HLA-DRB1 se encuentra donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.
Lo que lo agrava: la proporción de exones de HLA-DRB1 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 100.6,7 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con un 90 % de identidad o más. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.100 %
- Compartido con chrYLas regiones pseudoautosómicas y la región transpuesta de X, donde chrX y chrY tienen la misma secuencia o casi la misma, por lo que una lectura de uno puede ubicarse en el otro. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 50.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlos. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 30.0 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma escasa. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 20.21 %
Una puntuación de Dante Labs basada en investigación propia, construida sobre los mapas de regiones de difícil secuenciación Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de exones de HLA-DRB1 que están en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo puede por sí solo hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
1
posición en HLA-DRB1 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
1 de ellos (100 %) cae en una región en la que las lecturas cortas tienen dificultades.
- MHCThe major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference. (1 sitio)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 sitio)
Un genoma completo cubre los 11,1 kb de HLA-DRB1, con intrones incluidos, y no solo los 1,2 kb de exones.
Variantes patogénicas de ClinVar (1)
Las variantes del gen HLA-DRB1 que ClinVar clasifica como patogénicas o probablemente patogénicas para cualquier afección, revisadas por al menos un remitente con criterios, y las más revisadas de ellas. Es el registro público de ClinVar sobre el gen, nunca un resultado.
- Probablemente patogénica 1
| Variante | Afecciones | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|
| NM_002124.4(HLA-DRB1):c.764-2A>G (se abre en una pestaña nueva) | multiple sclerosis, susceptibility to | Probablemente patogénica | ★★★★1 estrella de 4 criterios proporcionados, un solo remitente |
Rasgos asociados a HLA-DRB1
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que HLA-DRB1 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the nervous system
- Cataplexy
- Cognitive impairment
- CSF pleocytosis
- Difficulty sleeping
- Difficulty staying or falling asleep
- Excessive daytime sleepiness
- Hallucinations
- Headache
Mostrar 28 rasgos más
- Transient global amnesia
- Abnormal rapid eye movement sleep
- Anxiety
- Attention deficit
- Depression
- Hypnagogic hallucination
- Hypnopompic hallucination
- NREM parasomnia
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal cerebrospinal fluid morphology
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Difficulty articulating speech
- Difficulty finding words
- Epilepsy
- Migraine
- Pauses in breathing while sleeping
- Peripheral neuropathy
- Pins and needles feeling
- Restlessness
- Sleep paralysis
- Slurred speech
- Visual hallucinations
- Chorea
- Psychosis
- Can't control feelings
- CNS demyelination
- Incoordination
Abnormality of the cardiovascular system
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- Hives
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Abnormal systemic blood pressure
- Foam cells
Mostrar 26 rasgos más
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Jaw pain while chewing
- Mucosal telangiectasiae
- Raynaud phenomenon
- Telangiectasia of the skin
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormal cardiac ventricular function
- Abnormal heart rate
- Abnormal lymph node histology
- Absent superficial temporal artery pulse
- Cardiac failure
- Double outlet right ventricle with subpulmonary ventricular septal defect without pulmonary stenosis
- Fainting spell
- Heart block
- Hypertensive crisis
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- increased pulmonary artery pressure
- Livedo reticularis
- Portal hypertension
- Sudden cardiac death
- Swelling or irritation of membrane around heart
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Ventricular tachycardia
- Fluid around heart
- Generalized swelling of lymph nodes
Abnormality of the eye
- Abnormal pupillary function
- Blurred vision
- Chorioretinal hypopigmentation
- Clouding of the lens of the eye
- High eye pressure
- Iridocyclitis
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal detachment
Mostrar 22 rasgos más
- Retinal nerve fiber edema
- Uveitis
- Visual impairment
- Weakness of muscles controlling eye movement
- Amaurosis fugax
- Anterior uveitis
- Blindness
- Corneal keratic precipitates
- Dalen-Fuchs nodules
- Damaged optic nerve
- Double vision
- Drooping upper eyelid
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Glaucoma
- Increased tears
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Partial loss of field of vision
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Visual loss
- Noninflammatory retina disease
- Chorioretinitis
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Autoimmunity
- Eczema
- Recurrent infections
- Skin rash
- Anti-BP180 antibody positivity
- Anti-BP230 antibody positivity
- Anti-complement component C1q antibody positivity
Mostrar 22 rasgos más
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmune antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Erythema nodosum
- Increased circulating interleukin 6 concentration
- Malar rash
- Psoriasiform dermatitis
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Maculopapular exanthema
- Meningitis
- Non-infectious meningitis
- Serositis
Abnormality of head or neck
- Abnormal eyelashes
- Abnormality of the eyebrow
- Chewing difficulties
- Sparse scalp hair
- Conjunctival hyperemia
- Decreased salivary flow
- Dental cavities
- Drooling
Mostrar 18 rasgos más
- Nuchal rigidity
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormal conjunctiva morphology
- Abnormality of mucosa of nose
- Abnormality of salivation
- Bell's palsy
- Dacryocystitis
- Dry eye syndrome
- Enlarged tear gland
- Enlargement of parotid gland
- Inflammation of the lips
- Inflammation of the tongue
- Mouth sore
- Oral mucosal blisters
- Parotitis
- Recurrent sore throat
- Scalp tenderness
- Abnormality of the salivary glands
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Intraalveolar phospholipid accumulation
- Lung infiltrates
- Abnormal pleura morphology
- Abnormality of lung structure
- Abnormality of the upper respiratory tract
- Cough
- Decreased DLCO
Mostrar 14 rasgos más
- Low blood oxygen level
- Pulmonary scarring
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Collapsed lung
- Crackles
- Crazy paving pattern
- Dry cough
- Emphysema
- Permanent enlargement of the airways of the lungs
- Upper airway obstruction
- Coughing up blood
- Mediastinal mass
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid lymphocyte proportion
Laboratory abnormality
- Diabetes mellitus
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Fever
- High ESR
- High urine protein levels
- Joint swelling
- Blood in urine
- Blood protein disease
Mostrar 13 rasgos más
- Elevated circulating alpha-globulin concentration
- Elevated circulating calprotectin concentration
- Elevated circulating osteopontin concentration
- Fluid around lungs
- High urine neutrophil count
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Chylothorax
- Elevated serum ferritin
- Elevated urine calcium levels
- High blood calcium levels
- Increased CSF protein concentration
- Swelling caused by excess lymph fluid under skin
- Hypothermia
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Anorexia
- Constipation
- Decreased liver function
- Malabsorption
- Nausea and vomiting
- Poor swallowing
- Abdominal pain
Mostrar 10 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de los datos 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen HLA-DRB1: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1. Consultado el 20 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/hla-drb1
Dante Labs. Gen HLA-DRB1: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1 [Internet]. [citado 20 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/hla-drb1
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