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Gene

TNXB

tenascin XB

Resumo

Localização citogenética
6p21.33-p21.32
Coordenadas
Cromossoma 6: 32 041 153–32 109 338 (GRCh38)
Exões
44 exões ao longo de 68,2 kb
Proteína
4244 aminoácidos
Também conhecido como
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Símbolos anteriores
TNXB1, TNXB2
Transcrito MANE Select
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Tipo de locus
gene with protein product

Relatório com curadoria relevante para este gene

Como TNXB está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 6, com um parêntese onde se situa TNXB. TNXB e 64 genes próximos no cromossoma 6, de 31 575 246 a 32 575 245.Cromossoma 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF: 31 575 558–31 578 336, fita diretaLTB: 31 580 525–31 582 522, fita inversaLST1: 31 581 065–31 588 911, fita diretaLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, fita inversaNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, fita diretaAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, fita diretaPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, fita direta: 31 623 874–31 625 499, fita diretaBAG6: 31 638 543–31 652 747, fita inversaAPOM: 31 652 416–31 658 214, fita diretaC6orf47: 31 658 298–31 660 778, fita inversaGPANK1: 31 661 228–31 666 283, fita inversaCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, fita direta: 31 666 102–31 673 546, fita diretaLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, fita diretaLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, fita inversaLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, fita inversaLY6G6F: 31 706 863–31 710 801, fita diretaLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, fita diretaLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, fita diretaLY6G6DMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, fita diretaLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, fita inversaDDAH2: 31 726 586–31 730 617, fita inversaCLIC1: 31 730 579–31 740 558, fita inversaMSH5: 31 739 677–31 762 678, fita diretaMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, fita diretaSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, fita diretaVWA7: 31 765 590–31 777 328, fita inversaVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 975, fita inversaLSM2: 31 797 019–31 806 992, fita inversaLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, fita inversaHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, fita diretaHSPA1AHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, fita diretaHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, fita inversaNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, fita inversaSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, fita inversaEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, fita diretaC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, fita inversaZBTB12: 31 927 698–31 952 048, fita diretaCFB: 31 945 650–31 952 086, fita diretaNELFE: 31 952 087–31 959 079, fita inversaSKIC2: 31 959 025–31 969 852, fita diretaSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, fita inversaDXOWHR1: 31 971 091–31 982 821, fita diretaWHR1C4A: 31 981 991–32 005 247, fita diretaC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, fita diretaC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, fita diretaCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 109 338, fita inversaTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, fita inversaATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, fita inversaFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, fita diretaPRRT1: 32 147 292–32 153 083, fita inversaPRRT1: 32 150 495–32 154 373, fita inversaPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, fita diretaEGFL8: 32 163 918–32 171 980, fita diretaAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, fita inversaRNF5: 32 178 391–32 184 769, fita diretaAGER: 32 180 963–32 184 365, fita inversaPBX2: 32 184 733–32 190 278, fita inversaGPSM3: 32 190 766–32 195 523, fita inversaNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, fita inversaNOTCH4TSBP1: 32 288 526–32 371 907, fita inversaTSBP1BTNL2: 32 391 481–32 407 181, fita inversaBTNL2HLA-DRA: 32 439 870–32 445 181, fita diretaHLA-DRAHLA-DRB5: 32 516 622–32 530 369, fita inversaHLA-DRB5Diagrama de TNXB: 44 exões na cadeia inversa do cromossoma 6Exão 43: 1 local conhecido associado a doençaExão 42: 1 local conhecido associado a doençaExão 41: 1 local conhecido associado a doençaExão 40: 1 local conhecido associado a doençaExão 36: 1 local conhecido associado a doençaExão 35: 1 local conhecido associado a doençaExão 33: 1 local conhecido associado a doençaExão 32: 3 locais conhecidos associados a doençaExão 31: 11 locais conhecidos associados a doençaExão 30: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 29: 10 locais conhecidos associados a doençaExão 28: 9 locais conhecidos associados a doençaExão 27: 4 locais conhecidos associados a doençaExão 26: 9 locais conhecidos associados a doençaExão 25: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 24: 11 locais conhecidos associados a doençaExão 23: 12 locais conhecidos associados a doençaExão 22: 2 locais conhecidos associados a doençaExão 21: 1 local conhecido associado a doençaExão 20: 4 locais conhecidos associados a doençaExão 19: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 18: 8 locais conhecidos associados a doençaExão 17: 4 locais conhecidos associados a doençaExão 16: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 15: 5 locais conhecidos associados a doençaExão 14: 5 locais conhecidos associados a doençaExão 13: 10 locais conhecidos associados a doençaExão 12: 4 locais conhecidos associados a doençaExão 11: 8 locais conhecidos associados a doençaExão 10: 11 locais conhecidos associados a doençaExão 9: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 8: 11 locais conhecidos associados a doençaExão 7: 8 locais conhecidos associados a doençaExão 6: 5 locais conhecidos associados a doençaExão 5: 7 locais conhecidos associados a doençaExão 4: 2 locais conhecidos associados a doençaExão 3: 50 locais conhecidos associados a doençaExão 2: 6 locais conhecidos associados a doençaExão 44: 32 041 153–32 041 450, 298 basesExão 43: 32 041 771–32 041 934, 164 basesExão 42: 32 042 012–32 042 173, 162 basesExão 41: 32 042 266–32 042 362, 97 basesExão 40: 32 042 455–32 042 606, 152 basesExão 39: 32 042 699–32 042 831, 133 basesExão 38: 32 042 951–32 043 081, 131 basesExão 37: 32 043 175–32 043 318, 144 basesExão 36: 32 043 437–32 043 556, 120 basesExão 35: 32 043 749–32 043 892, 144 basesExão 34: 32 044 007–32 044 129, 123 basesExão 33: 32 044 381–32 044 716, 336 basesExão 32: 32 045 006–32 045 326, 321 basesExão 31: 32 046 175–32 046 456, 282 basesExão 30: 32 047 734–32 048 012, 279 basesExão 29: 32 048 363–32 048 650, 288 basesExão 28: 32 049 270–32 049 587, 318 basesExão 27: 32 049 998–32 050 321, 324 basesExão 26: 32 052 670–32 052 993, 324 basesExão 25: 32 053 388–32 053 711, 324 basesExão 24: 32 055 851–32 056 174, 324 basesExão 23: 32 056 586–32 056 903, 318 basesExão 22: 32 058 058–32 058 390, 333 basesExão 21: 32 061 397–32 061 720, 324 basesExão 20: 32 062 157–32 062 483, 327 basesExão 19: 32 064 821–32 065 117, 297 basesExão 18: 32 067 661–32 067 984, 324 basesExão 17: 32 068 390–32 068 707, 318 basesExão 16: 32 068 822–32 069 136, 315 basesExão 15: 32 069 553–32 069 861, 309 basesExão 14: 32 070 127–32 070 414, 288 basesExão 13: 32 071 990–32 072 298, 309 basesExão 12: 32 073 647–32 073 952, 306 basesExão 11: 32 079 033–32 079 365, 333 basesExão 10: 32 081 368–32 081 673, 306 basesExão 9: 32 082 036–32 082 326, 291 basesExão 8: 32 084 413–32 084 709, 297 basesExão 7: 32 085 750–32 086 118, 369 basesExão 6: 32 088 785–32 089 048, 264 basesExão 5: 32 089 223–32 089 379, 157 basesExão 4: 32 095 076–32 095 191, 116 basesExão 3: 32 095 611–32 097 449, 1839 basesExão 2: 32 097 796–32 098 206, 411 basesExão 1: 32 109 181–32 109 338, 158 bases442515′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 13,1 kb dos 68,2 kb do gene; 12 735 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê TNXB

273

posições em TNXB onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

273 delas (100%) situam-se em regiões onde as leituras curtas têm dificuldade.

  • Low mappability (51 locais)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • MHC (273 locais)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
  • Segmental duplications (71 locais)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Um genoma completo abrange todos os 68,2 kb de TNXB, incluindo os intrões, e não apenas os 13,1 kb de exões.

Genes associados às mesmas condições

Características associadas a TNXB

A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que TNXB pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.

Ligações externas

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
  • A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene TNXB: tenascin XB. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. Gene TNXB: tenascin XB [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/tnxb

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