Gen
HLA-DRB1
major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
- HGNC 4948↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000196126↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 3123↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 6p21.32
- Koordinater
- Kromosom 6: 32 578 775–32 589 848 (GRCh38)
- Eksoner
- 6 eksoner over 11,1 kb
- Protein
- 266 aminosyrer, 30 kDa
- Tidligere symboler
- HLA-DR1B
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000360004.6NM_002124.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Share this page
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hla-drb1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes HLA-DRB1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser HLA-DRB1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er HLA-DRB1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,2 kb av genets 11,1 kb, og 801 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av HLA-DRB1
64Vanskelig
Hvor vanskelig HLA-DRB1 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Mye av HLA-DRB1 ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til HLA-DRB1 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.6,7 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.100 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.0 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.21 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til HLA-DRB1 i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
1
posisjon i HLA-DRB1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
1 av dem (100 %) ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
- MHCThe major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference. (1 posisjon)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 posisjon)
Et helgenomsekvensering dekker alle 11,1 kb av HLA-DRB1, inkludert introner, ikke bare de 1,2 kb med eksoner.
ClinVar-patogene varianter (1)
Variantene i HLA-DRB1 som ClinVar klassifiserer som patogene eller sannsynlig patogene for en hvilken som helst tilstand, vurdert av minst én innsender med kriterier, samt de mest vurderte av dem. Dette er ClinVars offentlige oversikt over genet, aldri et resultat.
- Sannsynligvis patogen 1
| Variant | Tilstander | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_002124.4(HLA-DRB1):c.764-2A>G | multiple sclerosis, susceptibility to | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Egenskaper knyttet til HLA-DRB1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene HLA-DRB1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Cataplexy
- Cognitive impairment
- CSF pleocytosis
- Difficulty sleeping
- Difficulty staying or falling asleep
- Excessive daytime sleepiness
- Hallucinations
- Headache
Vis 28 egenskaper til
- Transient global amnesia
- Abnormal rapid eye movement sleep
- Anxiety
- Attention deficit
- Depression
- Hypnagogic hallucination
- Hypnopompic hallucination
- NREM parasomnia
- Willis-Ekbom disease
- Abnormal cerebrospinal fluid morphology
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Difficulty articulating speech
- Difficulty finding words
- Epilepsy
- Migraine
- Pauses in breathing while sleeping
- Peripheral neuropathy
- Pins and needles feeling
- Restlessness
- Sleep paralysis
- Slurred speech
- Visual hallucinations
- Chorea
- Psychosis
- Can't control feelings
- CNS demyelination
- Incoordination
Abnormality of the cardiovascular system
- Disruption of blood oxygen supply to brain
- Hives
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Swollen lymph nodes
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Abnormal systemic blood pressure
- Foam cells
Vis 26 egenskaper til
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Jaw pain while chewing
- Mucosal telangiectasiae
- Raynaud phenomenon
- Telangiectasia of the skin
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormal cardiac ventricular function
- Abnormal heart rate
- Abnormal lymph node histology
- Absent superficial temporal artery pulse
- Cardiac failure
- Double outlet right ventricle with subpulmonary ventricular septal defect without pulmonary stenosis
- Fainting spell
- Heart block
- Hypertensive crisis
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- increased pulmonary artery pressure
- Livedo reticularis
- Portal hypertension
- Sudden cardiac death
- Swelling or irritation of membrane around heart
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Ventricular tachycardia
- Fluid around heart
- Generalized swelling of lymph nodes
Abnormality of the eye
- Abnormal pupillary function
- Blurred vision
- Chorioretinal hypopigmentation
- Clouding of the lens of the eye
- High eye pressure
- Iridocyclitis
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal detachment
Vis 22 egenskaper til
- Retinal nerve fiber edema
- Uveitis
- Visual impairment
- Weakness of muscles controlling eye movement
- Amaurosis fugax
- Anterior uveitis
- Blindness
- Corneal keratic precipitates
- Dalen-Fuchs nodules
- Damaged optic nerve
- Double vision
- Drooping upper eyelid
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Glaucoma
- Increased tears
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Partial loss of field of vision
- Posterior synechiae of the anterior chamber
- Visual loss
- Noninflammatory retina disease
- Chorioretinitis
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Autoimmunity
- Eczema
- Recurrent infections
- Skin rash
- Anti-BP180 antibody positivity
- Anti-BP230 antibody positivity
- Anti-complement component C1q antibody positivity
Vis 22 egenskaper til
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmune antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Erythema nodosum
- Increased circulating interleukin 6 concentration
- Malar rash
- Psoriasiform dermatitis
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Maculopapular exanthema
- Meningitis
- Non-infectious meningitis
- Serositis
Abnormality of head or neck
- Abnormal eyelashes
- Abnormality of the eyebrow
- Chewing difficulties
- Sparse scalp hair
- Conjunctival hyperemia
- Decreased salivary flow
- Dental cavities
- Drooling
Vis 18 egenskaper til
- Nuchal rigidity
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormal conjunctiva morphology
- Abnormality of mucosa of nose
- Abnormality of salivation
- Bell's palsy
- Dacryocystitis
- Dry eye syndrome
- Enlarged tear gland
- Enlargement of parotid gland
- Inflammation of the lips
- Inflammation of the tongue
- Mouth sore
- Oral mucosal blisters
- Parotitis
- Recurrent sore throat
- Scalp tenderness
- Abnormality of the salivary glands
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Intraalveolar phospholipid accumulation
- Lung infiltrates
- Abnormal pleura morphology
- Abnormality of lung structure
- Abnormality of the upper respiratory tract
- Cough
- Decreased DLCO
Vis 14 egenskaper til
- Low blood oxygen level
- Pulmonary scarring
- Stiff lung or chest wall causing decreased lung volume
- Collapsed lung
- Crackles
- Crazy paving pattern
- Dry cough
- Emphysema
- Permanent enlargement of the airways of the lungs
- Upper airway obstruction
- Coughing up blood
- Mediastinal mass
- Abnormality in area between air sacs in lung
- Elevated bronchoalveolar lavage fluid lymphocyte proportion
Laboratory abnormality
- Diabetes mellitus
- Elevated circulating C-reactive protein concentration
- Fever
- High ESR
- High urine protein levels
- Joint swelling
- Blood in urine
- Blood protein disease
Vis 13 egenskaper til
- Elevated circulating alpha-globulin concentration
- Elevated circulating calprotectin concentration
- Elevated circulating osteopontin concentration
- Fluid around lungs
- High urine neutrophil count
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Chylothorax
- Elevated serum ferritin
- Elevated urine calcium levels
- High blood calcium levels
- Increased CSF protein concentration
- Swelling caused by excess lymph fluid under skin
- Hypothermia
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Anorexia
- Constipation
- Decreased liver function
- Malabsorption
- Nausea and vomiting
- Poor swallowing
- Abdominal pain
Vis 10 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.21-311f020e.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). HLA-DRB1-genet: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1. Hentet 21. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hla-drb1
Dante Labs. HLA-DRB1-genet: major histocompatibility complex, class II, DR beta 1 [Internett]. [sitert 21. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hla-drb1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker