Gen
SMAD4
SMAD family member 4
- HGNC 6770↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000141646↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 4089↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 18q21.2
- Souřadnice
- Chromozom 18: 51 030 213–51 085 042 (GRCh38)
- Exony
- 12 exonů na 54,8 kb
- Protein
- 552 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- DPC4
- Předchozí symboly
- MADH4
- Transkript MANE Select
- ENST00000342988.8NM_005359.6
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SMAD4 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia
- Juvenile Polyposis/Hereditary Haemorrhagic Telangiectasia SyndromeAutozomálně dominantní
A condition caused by changes in SMAD4 that combines polyps in the digestive tract with the blood vessel abnormalities of hereditary haemorrhagic telangiectasia.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Knowing about it supports screening for blood vessel malformations in the lungs and brain, and regular bowel and stomach surveillance.
Juvenile Polyposis Syndrome
- Juvenile polyposis/hereditary haemorrhagic telangiectasia syndromeAutozomálně dominantní
SMAD4-related juvenile polyposis combined with features of hereditary haemorrhagic telangiectasia, such as nosebleeds and abnormal blood vessels in the lungs, brain or liver.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
In addition to bowel surveillance, screening for arteriovenous malformations in the lungs and brain is recommended.
- Autozomálně dominantní
Multiple hamartomatous (juvenile) polyps of the gastrointestinal tract with an increased risk of colorectal and gastric cancer.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Regular colonoscopy and upper endoscopy, usually from the early teens, with polyp removal; relatives can be offered testing.
Širší skupiny
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je SMAD4 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 8,8 kb z 54,8 kb genu; 1 659 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SMAD4
254
pozic v genu SMAD4, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 54,8 kb genu SMAD4, včetně intronů, nikoli jen 8,8 kb exonů.
Varianty se stránkou (15)
Varianty genu SMAD4 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| c.424+1G>A | Intron 3 | 51 048 861 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů | |
| D351V | c.1052A>T | Exon 9 | 51 065 519 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| D415Efs*20 | c.1245_1248del | Exon 10 | 51 067 120 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| G299Dfs*37 | c.894del | Exon 7 | 51 058 443 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| G352R | c.1054G>A | Exon 9 | 51 065 521 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| I500T | c.1499T>C | Exon 12 | 51 078 307 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| I500V | c.1498A>G | Exon 12 | 51 078 306 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| P342Lfs*42 | c.1023del | Exon 9 | 51 065 488 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| R361C | c.1081C>T | Exon 9 | 51 065 548 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| R361H | c.1082G>A | Exon 9 | 51 065 549 | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADKadenosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxSdílí 1 onemocnění
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Sdílí 1 onemocnění
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Sdílí 1 onemocnění
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ANK3ankyrin 3Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SMAD4
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SMAD4. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the cardiovascular system
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Cutis marmorata
- Mucoid extracellular matrix accumulation
- Mucosal telangiectasiae
- Spider veins
- Telangiectasia of the skin
- Abnormal cardiac septum morphology
- Abnormal cardiovascular system physiology
Zobrazit ještě 41 rysů
- Abnormal left ventricular function
- Aortic regurgitation
- Arteriovenous malformation
- Ascending aortic dissection
- Descending aortic dissection
- Enlarged heart
- Hepatic arteriovenous malformation
- High blood pressure
- Patent ductus arteriosus
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Portal hypertension
- Pulmonary arteriovenous malformation
- Swollen lymph nodes
- Visceral angiomatosis
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormality of the cerebral blood vessels
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Blood clot in artery of lung
- Brain aneurysm
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Carotid artery dilatation
- Cerebral arteriovenous malformation
- Depleted blood volume
- Descending thoracic aorta aneurysm
- Enlarged liver and spleen
- Gastrointestinal arteriovenous malformation
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Ischemic stroke
- Mini stroke
- Narrowing of pulmonic valve
- Peripheral arterial stenosis
- Peripheral arteriovenous fistula
- Retinal telangiectasia
- Stroke
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Fluid around heart
- Narrowing of aorta
- Narrowing of aortic valve
Abnormality of head or neck
- Big lower jaw
- Highly arched eyebrow
- Increased thickness of skull cap
- Long eyelashes
- Midface retrusion
- Short philtrum
- Decreased size of maxilla
- Decreased volume of lip
Zobrazit ještě 26 rysů
- Enlargement of craniofacial bones
- Narrow eyelid opening
- Narrow mouth
- Spider veins of mucosa of nose
- Spider veins of the lip
- Spider veins of the tongue
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal lip
- Narrow opening between the eyelids
- Short opening between the eyelids
- Bifid uvula
- Big calvaria
- Cleft lip
- Cleft palate
- Gingival cleft
- High, narrow palate
- One sided cleft upper lip
- Receding chin
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Submucous cleft hard palate
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormally small head
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Thick eyebrow
- Zygomatic flattening
Abnormality of the digestive system
- Juvenile colonic polyposis
- Juvenile gastrointestinal polyposis
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Adenomatous colonic polyposis
Zobrazit ještě 26 rysů
- Diarrhea
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Multiple gastric polyps
- Rectal polyposis
- Colon cancer
- Duodenal adenocarcinoma
- Duodenal stenosis
- Enlarged vein in esophagus
- Femoral hernia
- Growths in inner lining of intestine
- Inguinal hernia
- Intermittent diarrhea
- Intussusception
- Liver cancer
- Liver failure
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Rectum protrudes through anus
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Stomach tumor
- Duodenal polyposis
- Small intestinal polyposis
- Cancer of the pancreas
Abnormality of the musculoskeletal system
- Enlarged vertebral pedicles
- Excessive inward curvature of lower spine
- Generalized increase in muscle cell size
- Hunched back
- Hypoplastic iliac wing
- Increased skeletal muscle cells
- Joint stiffness
- Limitation of joint mobility
Zobrazit ještě 17 rysů
- Short long bone
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormality of connective tissue
- Abnormality of the pubic bone
- Abnormality of the ribs
- Back pain
- Flattened vertebrae
- Large iliac wing
- Abnormal shape of end part of bone
- Broad ribs
- Cone-shaped end part of bone
- Delayed bone maturation
- EMG abnormality
- Abnormality of the sternum
- Scoliosis
- Permanent flexion of the finger or toe
- Vertebral fusion
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Speech articulation difficulties
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Specific learning disability
- Migraine
- Ataxia
- Autism
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Bleeding in brain
- Low blood cell count
- Bleeding tendency
- Bloody nose
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Recurring nosebleed
- Rectal bleeding
- Blood clot in vein
Zobrazit ještě 3 rysů
Growth abnormality
- Prenatal growth deficiency
- Severe short stature
- Short stature
- Weight loss
- Birth length less than 3rd percentile
- Faltering weight
- Obesity
- Small for gestational age
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the eye
- Abnormality of the iris
- Drooping upper eyelid
- Severe farsightedness
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Wide-set eyes
- Deeply set eye
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SMAD4: SMAD family member 4. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/smad4
Dante Labs. Gen SMAD4: SMAD family member 4 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/smad4
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů