Gen
SMAD4
SMAD family member 4
- HGNC 6770↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000141646↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 4089↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 18q21.2
- Koordinater
- Kromosom 18: 51.030.213–51.085.042 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner fordelt over 54,8 kb
- Protein
- 552 aminosyrer
- Også kendt som
- DPC4
- Tidligere symboler
- MADH4
- MANE Select-transkript
- ENST00000342988.8NM_005359.6
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/smad4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs SMAD4 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Hereditær hæmoragisk teleangiektasi
- Juvenil polypose/hereditært hæmoragisk teleangiektasi-syndromAutosomal dominant
En tilstand forårsaget af ændringer i SMAD4, som kombinerer polypper i fordøjelseskanalen med de karabnormiteter, der ses ved hereditært hæmoragisk teleangiektasi.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
▶Handlingsrelevans
Kendskab til tilstanden understøtter screening for karmisdannelser i lunger og hjerne samt regelmæssig overvågning af tarm og mave.
Juvenil polypose-syndrom
- Juvenil polypose/hereditær hæmorragisk telangiektasi-syndromAutosomal dominant
SMAD4-relateret juvenil polypose kombineret med træk fra hereditær hæmorragisk telangiektasi, såsom næseblod og unormale blodkar i lungerne, hjernen eller leveren.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
▶Handlingsrelevans
Ud over tarmovervågning anbefales screening for arteriovenøse malformationer i lungerne og hjernen.
- Autosomal dominant
Flere hamartomatøse (juvenile) polypper i mave-tarm-kanalen med øget risiko for tyk- og endetarmskræft og mavekræft.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
▶Handlingsrelevans
Regelmæssig koloskopi og øvre endoskopi, normalt fra de tidlige teenageår, med fjernelse af polypper; slægtninge kan tilbydes test.
Bredere grupperinger
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er SMAD4 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 8,8 kb af genets 54,8 kb; 1.659 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af SMAD4
254
positioner i SMAD4, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 54,8 kb af SMAD4, inklusive introner, og ikke kun de 8,8 kb eksoner.
Varianter med en side (15)
Her vises de SMAD4-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.424+1G>A | Intron 3 | 51.048.861 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | |
| D351V | c.1052A>T | Exon 9 | 51.065.519 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| D415Efs*20 | c.1245_1248del | Exon 10 | 51.067.120 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| G299Dfs*37 | c.894del | Exon 7 | 51.058.443 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| G352R | c.1054G>A | Exon 9 | 51.065.521 | Patogen/sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| I500T | c.1499T>C | Exon 12 | 51.078.307 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| I500V | c.1498A>G | Exon 12 | 51.078.306 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| P342Lfs*42 | c.1023del | Exon 9 | 51.065.488 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| R361C | c.1081C>T | Exon 9 | 51.065.548 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
| R361H | c.1082G>A | Exon 9 | 51.065.549 | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 sygdom
Træk knyttet til SMAD4
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SMAD4 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the cardiovascular system
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Cutis marmorata
- Mucoid extracellular matrix accumulation
- Mucosal telangiectasiae
- Spider veins
- Telangiectasia of the skin
- Abnormal cardiac septum morphology
- Abnormal cardiovascular system physiology
Vis 41 træk mere
- Abnormal left ventricular function
- Aortic regurgitation
- Arteriovenous malformation
- Ascending aortic dissection
- Descending aortic dissection
- Enlarged heart
- Hepatic arteriovenous malformation
- High blood pressure
- Patent ductus arteriosus
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Portal hypertension
- Pulmonary arteriovenous malformation
- Swollen lymph nodes
- Visceral angiomatosis
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormality of the cerebral blood vessels
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Blood clot in artery of lung
- Brain aneurysm
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Carotid artery dilatation
- Cerebral arteriovenous malformation
- Depleted blood volume
- Descending thoracic aorta aneurysm
- Enlarged liver and spleen
- Gastrointestinal arteriovenous malformation
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Ischemic stroke
- Mini stroke
- Narrowing of pulmonic valve
- Peripheral arterial stenosis
- Peripheral arteriovenous fistula
- Retinal telangiectasia
- Stroke
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Fluid around heart
- Narrowing of aorta
- Narrowing of aortic valve
Abnormality of head or neck
- Big lower jaw
- Highly arched eyebrow
- Increased thickness of skull cap
- Long eyelashes
- Midface retrusion
- Short philtrum
- Decreased size of maxilla
- Decreased volume of lip
Vis 26 træk mere
- Enlargement of craniofacial bones
- Narrow eyelid opening
- Narrow mouth
- Spider veins of mucosa of nose
- Spider veins of the lip
- Spider veins of the tongue
- Thin red part of the upper lip
- Abnormal lip
- Narrow opening between the eyelids
- Short opening between the eyelids
- Bifid uvula
- Big calvaria
- Cleft lip
- Cleft palate
- Gingival cleft
- High, narrow palate
- One sided cleft upper lip
- Receding chin
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Submucous cleft hard palate
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormally small head
- Prominent nasal bridge
- Short neck
- Thick eyebrow
- Zygomatic flattening
Abnormality of the digestive system
- Juvenile colonic polyposis
- Juvenile gastrointestinal polyposis
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Adenomatous colonic polyposis
Vis 26 træk mere
- Diarrhea
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Multiple gastric polyps
- Rectal polyposis
- Colon cancer
- Duodenal adenocarcinoma
- Duodenal stenosis
- Enlarged vein in esophagus
- Femoral hernia
- Growths in inner lining of intestine
- Inguinal hernia
- Intermittent diarrhea
- Intussusception
- Liver cancer
- Liver failure
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Rectum protrudes through anus
- Scar tissue replaces healthy tissue in the liver
- Stomach tumor
- Duodenal polyposis
- Small intestinal polyposis
- Cancer of the pancreas
Abnormality of the musculoskeletal system
- Enlarged vertebral pedicles
- Excessive inward curvature of lower spine
- Generalized increase in muscle cell size
- Hunched back
- Hypoplastic iliac wing
- Increased skeletal muscle cells
- Joint stiffness
- Limitation of joint mobility
Vis 17 træk mere
- Short long bone
- Spasticity and rigidity of muscles
- Abnormality of connective tissue
- Abnormality of the pubic bone
- Abnormality of the ribs
- Back pain
- Flattened vertebrae
- Large iliac wing
- Abnormal shape of end part of bone
- Broad ribs
- Cone-shaped end part of bone
- Delayed bone maturation
- EMG abnormality
- Abnormality of the sternum
- Scoliosis
- Permanent flexion of the finger or toe
- Vertebral fusion
Growth abnormality
- Prenatal growth deficiency
- Severe short stature
- Short stature
- Weight loss
- Birth length less than 3rd percentile
- Faltering weight
- Obesity
- Small for gestational age
Vis 2 træk mere
Abnormality of the eye
- Abnormality of the iris
- Drooping upper eyelid
- Severe farsightedness
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Wide-set eyes
- Deeply set eye
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SMAD4-genet: SMAD family member 4. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/smad4
Dante Labs. SMAD4-genet: SMAD family member 4 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/smad4
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger