Gene
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000213689↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 11277↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 3p21.31
- Coordinate
- Cromosoma 3: 48.466.230–48.467.645 (GRCh38)
- Esoni
- 2 esoni su 1,4 kb
- Proteina
- 314 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante Autosomica recessiva
- Noto anche come
- DRN3
- Simboli precedenti
- AGS1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Sindrome di Aicardi-Goutières
- Interferonopatia di tipo 1 correlata a TREX1
Varianti di TREX1 che causano la sindrome di Aicardi-Goutières e malattie correlate, guidate dall'interferone.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Autosomica recessiva
La sindrome di Aicardi-Goutières (AGS) è un'encefalopatia subacuta ereditaria caratterizzata dalla presenza congiunta di calcificazioni dei gangli della base, leucodistrofia e linfocitosi nel liquido cerebrospinale (CSF).
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Malattia autoimmune
Un disturbo derivante dalla perdita di funzione o dalla distruzione tissutale di uno o più organi, causato da risposte immunitarie umorali o cellulari dell'individuo dirette contro i costituenti dei propri tessuti. Può essere sistemico (ad es. lupus eritematoso sistemico) oppure organo-specifico (ad es. tiroidite).
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Malattie autoinfiammatorie monogeniche rare
- Autoinfiammazione e autoimmunità correlate a PTPN2Autosomica dominante
Malattia infiammatoria e autoimmune a esordio precoce, inclusi colite e artrite, causata da varianti in PTPN2.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Lupus eritematoso sistemico
Una malattia autoimmune multiorgano tipicamente associata a vasculopatia e produzione di autoanticorpi. La maggior parte dei pazienti presenta anticorpi antinucleo (ANA). La presenza di anticorpi anti-dsDNA o anti-Smith è altamente specifica.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
LES standard: idrossiclorochina, micofenolato, belimumab, anifrolumab; Lupus da deficit del complemento: reintegro con PFC; Interferonopatia: anifrolumab, inibitori delle JAK; Per tutti: protezione solare, gestione del rischio cardiovascolare, pianificazione della gravidanza
Interferonopatie di tipo I
- Vasculopatia retinica con leucoencefalopatia cerebrale (RVCL-S)Autosomica dominante
Danno ad esordio in età adulta dei piccoli vasi sanguigni di occhio, cervello, rene e fegato, causato da specifiche varianti in TREX1.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Lupus pernio familiareAutosomica dominante
Lesioni cutanee dolorose indotte dal freddo su dita delle mani e dei piedi, orecchie e naso, che iniziano nell'infanzia, causate da varianti in TREX1 o SAMHD1.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Immunodeficienza primaria
Uno di 114 geni collegati ad esso
Malattie ereditarie del sistema immunitario causate da alterazioni di singoli geni, che influiscono sul modo in cui l'organismo combatte le infezioni o regola l'infiammazione.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Altre leucodistrofie ereditarie
- Leucodistrofia (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 80 geni collegati ad esso
Patologie ereditarie che danneggiano o impediscono la normale formazione della mielina, la sostanza bianca del cervello e del midollo spinale. A seconda del gene coinvolto, i diversi tipi seguono un'ereditarietà autosomica recessiva, autosomica dominante o legata al cromosoma X.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere la specifica causa genetica può porre fine a una ricerca diagnostica, guidare le cure di supporto e il monitoraggio, indicare se esiste un trattamento specifico e consentire il test dei familiari.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di TREX1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 1,1 kb dei 1,4 kb del gene; 945 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge TREX1
65
posizioni in TREX1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 1,4 kb di TREX1, introni inclusi, non solo i 1,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADARadenosine deaminase RNA specificCondivide 4 condizioni
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Condivide 4 condizioni
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ACondivide 4 condizioni
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BCondivide 4 condizioni
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CCondivide 4 condizioni
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Condivide 4 condizioni
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Condivide 4 condizioni
- C1QAcomplement C1q A chainCondivide 3 condizioni
- PRKCDprotein kinase C deltaCondivide 3 condizioni
- CASP10caspase 10Condivide 2 condizioni
- CASP8caspase 8Condivide 2 condizioni
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a TREX1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che TREX1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Mostra altri 53 tratti
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Mostra altri 19 tratti
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Mostra altri 14 tratti
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Mostra altri 3 tratti
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Cleft eyelid
- Mouth sore
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Asymmetry of the posterior head
- Inflammation of the lips
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene TREX1: three prime repair exonuclease 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/trex1
Dante Labs. Gene TREX1: three prime repair exonuclease 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/trex1
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