Gène
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000213689↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 11277↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 3p21.31
- Coordonnées
- Chromosome 3 : 48 466 230–48 467 645 (GRCh38)
- Exons
- 2 exons sur 1,4 kb
- Protéine
- 314 acides aminés
- Hérédité
- Autosomique dominant Autosomique récessif
- Aussi appelé
- DRN3
- Symboles précédents
- AGS1
- Transcrit MANE Select
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.
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Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Syndrome d'Aicardi-Goutières
- Interféronopathie de type 1 liée à TREX1
Variants de TREX1 provoquant le syndrome d'Aicardi-Goutières et d'autres maladies apparentées, dues à l'interféron.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 6 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Autosomique récessif
Le syndrome d'Aicardi-Goutières (AGS) est une encéphalopathie subaiguë héréditaire caractérisée par l'association de calcifications des ganglions de la base, d'une leucodystrophie et d'une lymphocytose du liquide céphalo-rachidien (LCR).
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Maladie auto-immune
Affection résultant d'une perte de fonction ou de la destruction tissulaire d'un ou de plusieurs organes, provoquée par des réponses immunitaires humorales ou cellulaires de l'organisme dirigées contre ses propres constituants tissulaires. Elle peut être systémique (par exemple, le lupus érythémateux disséminé) ou spécifique d'un organe (par exemple, la thyroïdite).
- 3 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Maladies auto-inflammatoires monogéniques rares
- Auto-inflammation et auto-immunité liées à PTPN2Autosomique dominant
Maladie inflammatoire et auto-immune à début précoce, notamment colite et arthrite, causée par des variants de PTPN2.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 6 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Lupus érythémateux disséminé
Maladie auto-immune multisystémique généralement associée à une atteinte vasculaire et à la production d'auto-anticorps. La plupart des patients présentent des anticorps antinucléaires (AAN). La présence d'anticorps anti-ADN natif (anti-dsDNA) ou anti-Smith est hautement spécifique.
- 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
LED standard : hydroxychloroquine, mycophénolate, belimumab, anifrolumab ; lupus par déficit en complément : substitution par PFC ; interféronopathie : anifrolumab, inhibiteurs de JAK ; pour tous : protection solaire, prise en charge du risque cardiovasculaire, planification des grossesses
Interféronopathies de type I
- Vasculopathie rétinienne avec leucoencéphalopathie cérébrale (RVCL-S)Autosomique dominant
Atteinte des petits vaisseaux sanguins de l'œil, du cerveau, des reins et du foie à l'âge adulte, causée par des variants spécifiques de TREX1.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Lupus engelure familialAutosomique dominant
Lésions cutanées douloureuses déclenchées par le froid sur les doigts, les orteils, les oreilles et le nez, apparaissant dès l'enfance, causées par des variants de TREX1 ou de SAMHD1.
- 3 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Regroupements plus larges
Autres erreurs innées de l'immunité
- Erreur innée de l'immunité
L'un des 114 gènes qui lui sont liés
Maladies héréditaires du système immunitaire causées par des modifications de gènes uniques, qui affectent la manière dont l'organisme combat les infections ou régule l'inflammation.
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Autres leucodystrophies héréditaires
- Leucodystrophie (autres types et types non précisés)
L'un des 80 gènes qui lui sont liés
Maladies héréditaires qui altèrent ou empêchent la formation normale de la myéline, la substance blanche du cerveau et de la moelle épinière. Selon le gène concerné, les différents types suivent une hérédité autosomique récessive, autosomique dominante ou liée à l'X.
- 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Connaître la cause génétique précise peut mettre fin à une recherche diagnostique, guider les soins de soutien et la surveillance, indiquer s'il existe un traitement spécifique et permettre le dépistage des apparentés.
Transmission
- Autosomique dominant
- Une copie modifiée, provenant de l'un ou l'autre parent, suffit. Un parent qui en porte une la transmet à chacun de ses enfants avec une probabilité de une sur deux.
- Autosomique récessif
- Il faut une copie modifiée provenant de chacun des parents. Avec une seule, vous êtes porteur et généralement non atteint ; lorsque les deux parents sont porteurs, chaque enfant a une chance sur quatre d'hériter de deux copies.
Structure de TREX1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,1 kb sur les 1,4 kb du gène ; 945 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit TREX1
65
positions dans TREX1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 1,4 kb de TREX1, introns compris, et pas seulement les 1,1 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ADARadenosine deaminase RNA specificPartage 4 affections
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Partage 4 affections
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit APartage 4 affections
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BPartage 4 affections
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CPartage 4 affections
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Partage 4 affections
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Partage 4 affections
- C1QAcomplement C1q A chainPartage 3 affections
- PRKCDprotein kinase C deltaPartage 3 affections
- CASP10caspase 10Partage 2 affections
- CASP8caspase 8Partage 2 affections
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Partage 2 affections
Traits associés à TREX1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TREX1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Afficher 53 traits supplémentaires
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Afficher 19 traits supplémentaires
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Afficher 14 traits supplémentaires
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of the eye
- Abnormality of eye movement
- Developmental glaucoma
- Drooping upper eyelid
- Glaucoma
- Hemianopia
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Macular edema
- Partial loss of field of vision
Afficher 6 traits supplémentaires
Laboratory abnormality
- Increased CSF interferon alpha
- Fever
- High urine protein levels
- Blood in urine
- Elevated alkaline phosphatase
- Elevated creatinine
- Elevated gamma-glutamyltransferase level
- High ESR
Afficher 5 traits supplémentaires
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Afficher 3 traits supplémentaires
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Cleft eyelid
- Mouth sore
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Asymmetry of the posterior head
- Inflammation of the lips
Afficher 2 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène TREX1 : three prime repair exonuclease 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trex1
Dante Labs. Gène TREX1 : three prime repair exonuclease 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trex1
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