Gén
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000213689↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 11277↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3p21.31
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 48 466 230–48 467 645 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 1,4 kb
- Fehérje
- 314 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális domináns Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- DRN3
- Korábbi jelölések
- AGS1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a TREX1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Aicardi-Goutieres Syndrome
- TREX1-related type 1 interferonopathy
TREX1 variants causing Aicardi-Goutieres syndrome and related interferon-driven disease.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Autoszomális recesszív
Aicardi-Goutieres syndrome (AGS) is an inherited, subacute encephalopathy characterized by the association of basal ganglia calcification, leukodystrophy and cerebrospinal fluid (CSF) lymphocytosis.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Autoimmune Disease
A disorder resulting from loss of function or tissue destruction of an organ or multiple organs, arising from humoral or cellular immune responses of the individual to their own tissue constituents. It may be systemic (e.g., systemic lupus erythematosus), or organ specific, (e.g., thyroiditis).
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Rare Monogenic Autoinflammatory Diseases
- PTPN2-related autoinflammation and autoimmunityAutoszomális domináns
Early-onset inflammatory and autoimmune disease, including colitis and arthritis, caused by variants in PTPN2.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Systemic Lupus Erythematosus
An autoimmune multi-organ disease typically associated with vasculopathy and autoantibody production. Most patients have antinuclear antibodies (ANA). The presence of anti-dsDNA or anti-Smith antibodies are highly-specific.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Standard SLE: hydroxychloroquine, mycophenolate, belimumab, anifrolumab; Complement-deficient lupus: FFP replacement; Interferonopathy: anifrolumab, JAK inhibitors; All: sun protection, cardiovascular risk management, pregnancy planning
Type I Interferonopathies
- Retinal vasculopathy with cerebral leukoencephalopathy (RVCL-S)Autoszomális domináns
Adult-onset damage to small blood vessels of the eye, brain, kidney and liver caused by specific TREX1 variants.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Familial chilblain lupusAutoszomális domináns
Painful, cold-induced skin lesions on the fingers, toes, ears and nose beginning in childhood, caused by variants in TREX1 or SAMHD1.
- 3 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Átfogóbb csoportosítások
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
A 114 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
A 80 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Öröklődési mód
- Autoszomális domináns
- Egy megváltozott másolat bármelyik szülőtől is származik, elegendő. Az a szülő, akinek van ilyen másolata, minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A TREX1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 1,4 kb-jából 1,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 945 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) TREX1 gént
65
pozíció a(z) TREX1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a TREX1 gén mind a 1,4 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 1,1 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ADARadenosine deaminase RNA specific4 betegséget oszt meg
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 14 betegséget oszt meg
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit A4 betegséget oszt meg
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit B4 betegséget oszt meg
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit C4 betegséget oszt meg
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 14 betegséget oszt meg
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 14 betegséget oszt meg
- C1QAcomplement C1q A chain3 betegséget oszt meg
- PRKCDprotein kinase C delta3 betegséget oszt meg
- CASP10caspase 102 betegséget oszt meg
- CASP8caspase 82 betegséget oszt meg
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 42 betegséget oszt meg
A(z) TREX1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) TREX1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Még 53 tulajdonság megjelenítése
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Még 19 tulajdonság megjelenítése
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Még 14 tulajdonság megjelenítése
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of the eye
- Abnormality of eye movement
- Developmental glaucoma
- Drooping upper eyelid
- Glaucoma
- Hemianopia
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Macular edema
- Partial loss of field of vision
Még 6 tulajdonság megjelenítése
Laboratory abnormality
- Increased CSF interferon alpha
- Fever
- High urine protein levels
- Blood in urine
- Elevated alkaline phosphatase
- Elevated creatinine
- Elevated gamma-glutamyltransferase level
- High ESR
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Cleft eyelid
- Mouth sore
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Asymmetry of the posterior head
- Inflammation of the lips
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). TREX1 gén: three prime repair exonuclease 1. Lekérve: 2026. október 16., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/trex1
Dante Labs. TREX1 gén: three prime repair exonuclease 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 16.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/trex1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt