Gen
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000213689↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 11277↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 3p21.31
- Koordinater
- Kromosom 3: 48 466 230–48 467 645 (GRCh38)
- Eksoner
- 2 eksoner over 1,4 kb
- Protein
- 314 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kjent som
- DRN3
- Tidligere symboler
- AGS1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Lokustype
- gene with protein product
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les TREX1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Aicardi-Goutières syndrom
- TREX1-relatert type 1-interferonopati
TREX1-varianter som forårsaker Aicardi-Goutières syndrom og beslektet interferondrevet sykdom.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Autosomal recessiv
Aicardi-Goutières syndrom (AGS) er en arvelig, subakutt encefalopati preget av kalkavleiring i basalgangliene, leukodystrofi og lymfocytose i cerebrospinalvæsken (CSF).
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Autoimmun sykdom
En lidelse som skyldes tap av funksjon eller vevsskade i ett organ eller flere organer, og som oppstår når individets humorale eller cellulære immunrespons retter seg mot egne vevsbestanddeler. Sykdommen kan være systemisk (f.eks. systemisk lupus erythematosus) eller organspesifikk (f.eks. tyreoiditt).
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Sjeldne monogene autoinflammatoriske sykdommer
- PTPN2-relatert autoinflammasjon og autoimmunitetAutosomal dominant
Inflammatorisk og autoimmun sykdom med debut tidlig i livet, blant annet kolitt og artritt, forårsaket av varianter i PTPN2.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Systemisk lupus erythematosus
En autoimmun sykdom som rammer flere organer og som typisk er forbundet med karsykdom og produksjon av autoantistoffer. De fleste pasienter har antinukleære antistoffer (ANA). Tilstedeværelse av anti-dsDNA- eller anti-Smith-antistoffer er svært spesifikt.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Standard SLE: hydroksyklorokin, mykofenolat, belimumab, anifrolumab; Komplementmangelassosiert lupus: erstatning med FFP; Interferonopati: anifrolumab, JAK-hemmere; Alle: solbeskyttelse, håndtering av kardiovaskulær risiko, graviditetsplanlegging
Type I-interferonopatier
- Retinal vaskulopati med cerebral leukoencefalopati (RVCL-S)Autosomal dominant
Skade på små blodkar i øye, hjerne, nyre og lever med debut i voksen alder, forårsaket av bestemte varianter i TREX1.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Familiær frostbitt-lignende lupusAutosomal dominant
Smertefulle, kuldeutløste hudlesjoner på fingre, tær, ører og nese som starter i barndommen, forårsaket av varianter i TREX1 eller SAMHD1.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsviktsykdommer
- Medfødt immunsviktsykdom
Ett av 114 gener knyttet til den
Arvelige sykdommer i immunsystemet forårsaket av endringer i enkeltgener, som påvirker hvordan kroppen bekjemper infeksjoner eller regulerer betennelse.
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Andre arvelige leukodystrofier
- Leukodystrofi (andre og uspesifiserte typer)
Ett av 80 gener knyttet til den
Arvelige tilstander som skader eller hindrer normal dannelse av myelin, den hvite substansen i hjernen og ryggmargen. De ulike typene arves autosomalt recessivt, autosomalt dominant eller X-bundet, avhengig av genet som er involvert.
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Kjennskap til den spesifikke genetiske årsaken kan avslutte en diagnostisk leting, veilede støttende behandling og oppfølging, vise om en spesifikk behandling finnes, og gjøre det mulig å teste slektninger.
Arv
- Autosomal dominant
- Én endret kopi, fra enten forelder, er nok. En forelder som har én, gir den videre til hvert barn med en sjanse på én av to.
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er TREX1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,1 kb av genets 1,4 kb, og 945 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test TREX1
65
posisjoner i TREX1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 1,4 kb av TREX1, inkludert introner, og ikke bare de 1,1 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeler 4 tilstander
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deler 4 tilstander
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeler 4 tilstander
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BDeler 4 tilstander
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CDeler 4 tilstander
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Deler 4 tilstander
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Deler 4 tilstander
- C1QAcomplement C1q A chainDeler 3 tilstander
- PRKCDprotein kinase C deltaDeler 3 tilstander
- CASP10caspase 10Deler 2 tilstander
- CASP8caspase 8Deler 2 tilstander
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til TREX1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TREX1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Vis 53 egenskaper til
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Vis 19 egenskaper til
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Vis 14 egenskaper til
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Vis 3 egenskaper til
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Cleft eyelid
- Mouth sore
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Asymmetry of the posterior head
- Inflammation of the lips
Vis 2 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). TREX1-genet: three prime repair exonuclease 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/trex1
Dante Labs. TREX1-genet: three prime repair exonuclease 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/trex1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker