Gene
SAMHD1
SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1
- HGNC 15925↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000101347↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 25939↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 20q11.23
- Coordinate
- Cromosoma 20: 36.890.229–36.951.708 (GRCh38)
- Esoni
- 16 esoni su 61,5 kb
- Proteina
- 626 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante Autosomica recessiva
- Noto anche come
- SBBI88, Mg11, HDDC1, MOP-5, AGS5
- Trascritto MANE Select
- ENST00000646673.2NM_015474.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Sindrome di Aicardi-Goutières
- Interferonopatia di tipo 1 correlata a SAMHD1Autosomica recessiva
Varianti di SAMHD1 che causano la sindrome di Aicardi-Goutières, a volte accompagnata da vasculopatia cerebrale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 7 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Autosomica recessiva
La sindrome di Aicardi-Goutières (AGS) è un'encefalopatia subacuta ereditaria caratterizzata dalla presenza congiunta di calcificazioni dei gangli della base, leucodistrofia e linfocitosi nel liquido cerebrospinale (CSF).
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Malattia di Moyamoya
Restringimento progressivo delle arterie alla base del cervello, associato a variazioni del gene RNF213 (un gene di predisposizione con penetranza ridotta, particolarmente diffuso nelle popolazioni dell'Asia orientale), ACTA2 o GUCY1A1, che possono causare ictus o mini-ictus.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere questa condizione favorisce la tempestiva valutazione di sintomi come una debolezza transitoria e l'accesso a una prevenzione dell'ictus e a trattamenti chirurgici specialistici.
Malattie autoinfiammatorie monogeniche rare
- Autoinfiammazione e autoimmunità correlate a PTPN2Autosomica dominante
Malattia infiammatoria e autoimmune a esordio precoce, inclusi colite e artrite, causata da varianti in PTPN2.
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Immunodeficienza primaria
Uno di 114 geni collegati ad esso
Malattie ereditarie del sistema immunitario causate da alterazioni di singoli geni, che influiscono sul modo in cui l'organismo combatte le infezioni o regola l'infiammazione.
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Altre leucodistrofie ereditarie
- Leucodistrofia (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 80 geni collegati ad esso
Patologie ereditarie che danneggiano o impediscono la normale formazione della mielina, la sostanza bianca del cervello e del midollo spinale. A seconda del gene coinvolto, i diversi tipi seguono un'ereditarietà autosomica recessiva, autosomica dominante o legata al cromosoma X.
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere la specifica causa genetica può porre fine a una ricerca diagnostica, guidare le cure di supporto e il monitoraggio, indicare se esiste un trattamento specifico e consentire il test dei familiari.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di SAMHD1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 4,6 kb dei 61,5 kb del gene; 1881 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SAMHD1
122
posizioni in SAMHD1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 61,5 kb di SAMHD1, introni inclusi, non solo i 4,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADARadenosine deaminase RNA specificCondivide 4 condizioni
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Condivide 4 condizioni
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ACondivide 4 condizioni
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BCondivide 4 condizioni
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CCondivide 4 condizioni
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Condivide 4 condizioni
- TREX1three prime repair exonuclease 1Condivide 4 condizioni
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexCondivide 2 condizioni
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexCondivide 2 condizioni
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Condivide 1 condizione
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialCondivide 1 condizione
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Condivide 1 condizione
Tratti collegati a SAMHD1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SAMHD1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Leukodystrophy
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Mostra altri 18 tratti
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Deep white matter hypodensities
- Leukoencephalopathy
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/samhd1
Dante Labs. Gene SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/samhd1
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