Gen
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000213689↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 11277↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3p21.31
- Współrzędne
- Chromosom 3: 48 466 230–48 467 645 (GRCh38)
- Eksony
- 2 eksonów na odcinku 1,4 kb
- Białko
- 314 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące Autosomalne recesywne
- Znany również jako
- DRN3
- Poprzednie symbole
- AGS1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj TREX1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Zespół Aicardiego-Goutières
- Interferonopatia typu 1 związana z TREX1
Warianty TREX1 powodujące zespół Aicardiego-Goutières'a i pokrewne choroby napędzane interferonem.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Autosomalne recesywne
Zespół Aicardiego-Goutières (AGS) to dziedziczna, podostra encefalopatia, która charakteryzuje się współwystępowaniem zwapnienia jąder podstawy mózgu, leukodystrofii oraz limfocytozy w płynie mózgowo-rdzeniowym (CSF).
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Choroba autoimmunologiczna
Zaburzenie wynikające z utraty funkcji lub niszczenia tkanki jednego narządu bądź wielu narządów, powstające na skutek odpowiedzi humoralnej lub komórkowej układu odpornościowego danej osoby na własne składniki tkankowe. Może mieć charakter układowy (np. toczeń rumieniowaty układowy) lub dotyczyć konkretnego narządu (np. zapalenie tarczycy).
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Rzadkie jednogenowe choroby autozapalne
- Autozapalenie i autoimmunizacja związane z PTPN2Autosomalne dominujące
Wczesna choroba zapalna i autoimmunologiczna, w tym zapalenie okrężnicy i zapalenie stawów, spowodowana wariantami w genie PTPN2.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Toczeń rumieniowaty układowy
Autoimmunologiczna choroba wielonarządowa, zwykle związana z zapaleniem naczyń i wytwarzaniem autoprzeciwciał. U większości pacjentów wykrywa się przeciwciała przeciwjądrowe (ANA). Obecność przeciwciał anty-dsDNA lub anty-Smith jest bardzo swoista.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Toczeń standardowy: hydroksychlorochina, mykofenolan, belimumab, anifrolumab; Toczeń z niedoborem dopełniacza: uzupełnianie osocza świeżo mrożonego (FFP); Interferonopatia: anifrolumab, inhibitory JAK; Wszystkie postacie: ochrona przed słońcem, kontrola ryzyka sercowo-naczyniowego, planowanie ciąży
Interferonopatie typu I
- Naczyniopatia siatkówki z leukoencefalopatią mózgową (RVCL-S)Autosomalne dominujące
Rozpoczynające się w wieku dorosłym uszkodzenie małych naczyń krwionośnych oka, mózgu, nerek i wątroby, spowodowane określonymi wariantami TREX1.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Rodzinny toczeń odmrożeniowyAutosomalne dominujące
Bolesne zmiany skórne na palcach rąk i nóg, uszach i nosie, wywoływane zimnem, rozpoczynające się w dzieciństwie, spowodowane wariantami TREX1 lub SAMHD1.
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Szersze grupy
Inne wrodzone błędy odporności
- Wrodzone zaburzenie odporności
Jeden z 114 powiązanych z nim genów
Dziedziczne zaburzenia układu odpornościowego spowodowane zmianami w pojedynczych genach, wpływające na zdolność organizmu do zwalczania zakażeń lub regulowania stanu zapalnego.
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Inne dziedziczne leukodystrofie
- Leukodystrofia (inne i nieokreślone typy)
Jeden z 80 powiązanych z nim genów
Dziedziczne schorzenia, które uszkadzają lub uniemożliwiają prawidłowe tworzenie mieliny, czyli istoty białej mózgu i rdzenia kręgowego. Różne typy dziedziczą się autosomalnie recesywnie, autosomalnie dominująco lub sprzężone z chromosomem X, w zależności od zaangażowanego genu.
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Poznanie konkretnej przyczyny genetycznej może zakończyć poszukiwania diagnostyczne, ukierunkować opiekę wspomagającą i kontrolę stanu zdrowia, wskazać, czy istnieje konkretne leczenie, oraz umożliwić badanie krewnych.
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu TREX1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,1 kb z 1,4 kb genu; 945 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje TREX1
65
pozycje w TREX1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 1,4 kb genu TREX1, łącznie z intronami, a nie tylko 1,1 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADARadenosine deaminase RNA specificWspólnych schorzeń: 4
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Wspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit AWspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BWspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CWspólnych schorzeń: 4
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Wspólnych schorzeń: 4
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Wspólnych schorzeń: 4
- C1QAcomplement C1q A chainWspólnych schorzeń: 3
- PRKCDprotein kinase C deltaWspólnych schorzeń: 3
- CASP10caspase 10Wspólnych schorzeń: 2
- CASP8caspase 8Wspólnych schorzeń: 2
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Wspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem TREX1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać TREX1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Pokaż jeszcze 53 cech
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Pokaż jeszcze 19 cech
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Pokaż jeszcze 14 cech
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Pokaż jeszcze 3 cech
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Cleft eyelid
- Mouth sore
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Asymmetry of the posterior head
- Inflammation of the lips
Pokaż jeszcze 2 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen TREX1: three prime repair exonuclease 1. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/trex1
Dante Labs. Gen TREX1: three prime repair exonuclease 1 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/trex1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni