Gen
TREX1
three prime repair exonuclease 1
- HGNC 12269↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000213689↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 11277↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 3p21.31
- Koordinater
- Kromosom 3: 48.466.230–48.467.645 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner fordelt over 1,4 kb
- Protein
- 314 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kendt som
- DRN3
- Tidligere symboler
- AGS1
- MANE Select-transkript
- ENST00000625293.3NM_033629.6
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Læs TREX1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Aicardi-Goutieres syndrom
- TREX1-relateret type 1-interferonopati
TREX1-varianter, der forårsager Aicardi-Goutières syndrom og beslægtet interferondrevet sygdom.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Autosomal recessiv
Aicardi-Goutieres syndrom (AGS) er en arvelig, subakut encefalopati, kendetegnet ved en kombination af forkalkning i basalganglierne, leukodystrofi og lymfocytose i cerebrospinalvæsken (CSF).
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Autoimmun sygdom
En lidelse, der skyldes tab af funktion eller vævsnedbrydning i et organ eller flere organer, og som opstår ved humorale eller cellulære immunreaktioner hos det enkelte individ mod egne vævsbestanddele. Den kan være systemisk (f.eks. systemisk lupus erythematosus) eller organspecifik (f.eks. thyreoiditis).
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sjældne monogene autoinflammatoriske sygdomme
- PTPN2-relateret autoinflammation og autoimmunitetAutosomal dominant
Inflammatorisk og autoimmun sygdom med debut tidligt i livet, herunder colitis og artritis, forårsaget af varianter i PTPN2.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Systemisk lupus erythematosus
En autoimmun sygdom i flere organer, typisk forbundet med vaskulopati og produktion af autoantistoffer. De fleste patienter har antinukleære antistoffer (ANA). Tilstedeværelse af anti-dsDNA- eller anti-Smith-antistoffer er meget specifik.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Standard SLE: hydroxyklorokin, mycophenolat, belimumab, anifrolumab; komplementdefekt lupus: erstatning med FFP; interferonopati: anifrolumab, JAK-hæmmere; alle: solbeskyttelse, håndtering af kardiovaskulær risiko, graviditetsplanlægning
Type I-interferonopatier
- Retinal vaskulopati med cerebral leukoencefalopati (RVCL-S)Autosomal dominant
Voksendebuterende skade på små blodkar i øjet, hjernen, nyrerne og leveren forårsaget af specifikke varianter i TREX1.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Familiær frostbetændelseslupusAutosomal dominant
Smertefulde, kuldeudløste hudlæsioner på fingre, tæer, ører og næse, der begynder i barndommen, forårsaget af varianter i TREX1 eller SAMHD1.
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Andre medfødte immunsvigt
- Medfødt immundefekt
Et af 114 gener, der er knyttet til det
Arvelige sygdomme i immunsystemet, forårsaget af ændringer i enkelte gener, som påvirker kroppens evne til at bekæmpe infektioner eller regulere inflammation.
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Andre arvelige leukodystrofier
- Leukodystrofi (andre og uspecificerede typer)
Et af 80 gener, der er knyttet til det
Arvelige tilstande, der beskadiger eller forhindrer den normale dannelse af myelin, hjernens og rygmarvens hvide substans. De forskellige typer følger autosomal recessiv, autosomal dominant eller X-bundet arvegang, afhængigt af det involverede gen.
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Kendskab til den specifikke genetiske årsag kan afslutte en diagnostisk søgen, vejlede understøttende behandling og opfølgning, vise, om en specifik behandling findes, og gøre det muligt at teste slægtninge.
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er TREX1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,1 kb af genets 1,4 kb; 945 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest TREX1
65
positioner i TREX1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 1,4 kb af TREX1, inklusive introner, og ikke kun de 1,1 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeler 4 sygdomme
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Deler 4 sygdomme
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit ADeler 4 sygdomme
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BDeler 4 sygdomme
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CDeler 4 sygdomme
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Deler 4 sygdomme
- SAMHD1SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1Deler 4 sygdomme
- C1QAcomplement C1q A chainDeler 3 sygdomme
- PRKCDprotein kinase C deltaDeler 3 sygdomme
- CASP10caspase 10Deler 2 sygdomme
- CASP8caspase 8Deler 2 sygdomme
- CTLA4cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til TREX1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, TREX1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Chronic CSF lymphocytosis
- CNS demyelination
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Global developmental delay
- Inability to walk
- Self-mutilation
Vis 53 træk mere
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Cognitive impairment
- Dementia
- Epilepsy
- Irritability
- Leukodystrophy
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Anxiety
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Depression
- Difficulty finding words
- Focal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Focal hypointensity of cerebral white matter on MRI
- Focal sensory seizure with somatosensory features
- Generalized-onset seizure
- Headache
- Lack of feeling, emotion, interest
- Memory impairment
- Migraine with aura
- Migraine without aura
- Psychosis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Worsening neurological symptoms
- Chorea
- Degeneration of the striatum
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal pyramidal tract morphology
- Apraxia
- Central nervous system degeneration
- Deep white matter hypodensities
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty articulating speech
- Forgetfullness
- Leukoencephalopathy
- Overactive lower leg reflex
- Poor concentration
- Progressive brain disease
Abnormality of the immune system
- Antinuclear antibody positivity
- Chilblains
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Autoimmunity
- Decreased circulating complement C3 concentration
Vis 19 træk mere
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Increased circulating interferon-gamma concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Infection in blood stream
- Inflammation of fat tissue
- Pneumonia
- Serositis
- Antiphospholipid antibody positivity
- Muscle inflammation
- Skin rash
- Systemic lupus erythematosus
Abnormality of the cardiovascular system
- Inflammation of blood vessel
- Redness of skin or mucous membrane
- Abnormality of retina blood vessels
- Raynaud phenomenon
- Abnormality of liver blood vessels
- Enlarged liver and spleen
- High blood pressure
- Vasculitis in the skin
Vis 14 træk mere
- Cutis marmorata
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Increased spleen size
- Retinal neovascularization
- Spider veins
- Swollen lymph nodes
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Calcification of the aorta
- Enlarged and thickened heart muscle
- Moyamoya phenomenon
- Punctate vasculitis skin lesions
- Stroke
- Swelling or irritation of membrane around heart
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Petechiae
- Decreased blood leukocyte number
- Low platelet count
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Gastrointestinal bleeding
- Hemolytic anemia
- Neonatal alloimmune thrombocytopenia
Vis 3 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). TREX1-genet: three prime repair exonuclease 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/trex1
Dante Labs. TREX1-genet: three prime repair exonuclease 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/trex1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger