Gen
SAMHD1
SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1
- HGNC 15925↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000101347↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 25939↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 20q11.23
- Współrzędne
- Chromosom 20: 36 890 229–36 951 708 (GRCh38)
- Eksony
- 16 eksonów na odcinku 61,5 kb
- Białko
- 626 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące Autosomalne recesywne
- Znany również jako
- SBBI88, Mg11, HDDC1, MOP-5, AGS5
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000646673.2NM_015474.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SAMHD1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Zespół Aicardiego-Goutières
- Interferonopatia typu 1 związana z SAMHD1Autosomalne recesywne
Warianty SAMHD1 powodujące zespół Aicardiego-Goutières'a, czasami z towarzyszącą mózgową wasculopatią.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 7 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Autosomalne recesywne
Zespół Aicardiego-Goutières (AGS) to dziedziczna, podostra encefalopatia, która charakteryzuje się współwystępowaniem zwapnienia jąder podstawy mózgu, leukodystrofii oraz limfocytozy w płynie mózgowo-rdzeniowym (CSF).
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Choroba moyamoya
Postępujące zwężenie tętnic u podstawy mózgu, związane ze zmianami w genach RNF213 (genie predyspozycji o obniżonej penetrancji, szczególnie częstym w populacjach wschodnioazjatyckich), ACTA2 lub GUCY1A1, które mogą prowadzić do udarów lub mini-udarów.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Świadomość tej choroby sprzyja wczesnej ocenie objawów, takich jak przejściowe osłabienie, oraz dostępowi do specjalistycznej profilaktyki udarów i leczenia chirurgicznego.
Rzadkie jednogenowe choroby autozapalne
- Autozapalenie i autoimmunizacja związane z PTPN2Autosomalne dominujące
Wczesna choroba zapalna i autoimmunologiczna, w tym zapalenie okrężnicy i zapalenie stawów, spowodowana wariantami w genie PTPN2.
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Szersze grupy
Inne wrodzone błędy odporności
- Wrodzone zaburzenie odporności
Jeden z 114 powiązanych z nim genów
Dziedziczne zaburzenia układu odpornościowego spowodowane zmianami w pojedynczych genach, wpływające na zdolność organizmu do zwalczania zakażeń lub regulowania stanu zapalnego.
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Inne dziedziczne leukodystrofie
- Leukodystrofia (inne i nieokreślone typy)
Jeden z 80 powiązanych z nim genów
Dziedziczne schorzenia, które uszkadzają lub uniemożliwiają prawidłowe tworzenie mieliny, czyli istoty białej mózgu i rdzenia kręgowego. Różne typy dziedziczą się autosomalnie recesywnie, autosomalnie dominująco lub sprzężone z chromosomem X, w zależności od zaangażowanego genu.
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Poznanie konkretnej przyczyny genetycznej może zakończyć poszukiwania diagnostyczne, ukierunkować opiekę wspomagającą i kontrolę stanu zdrowia, wskazać, czy istnieje konkretne leczenie, oraz umożliwić badanie krewnych.
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu SAMHD1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,6 kb z 61,5 kb genu; 1881 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SAMHD1
122
pozycje w SAMHD1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 61,5 kb genu SAMHD1, łącznie z intronami, a nie tylko 4,6 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ADARadenosine deaminase RNA specificWspólnych schorzeń: 4
- IFIH1interferon induced with helicase C domain 1Wspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Aribonuclease H2 subunit AWspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Bribonuclease H2 subunit BWspólnych schorzeń: 4
- RNASEH2Cribonuclease H2 subunit CWspólnych schorzeń: 4
- RNU7-1RNA, U7 small nuclear 1Wspólnych schorzeń: 4
- TREX1three prime repair exonuclease 1Wspólnych schorzeń: 4
- SKIC2SKI2 subunit of superkiller complexWspólnych schorzeń: 2
- SKIC3SKI3 subunit of superkiller complexWspólnych schorzeń: 2
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialWspólne schorzenie: 1
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SAMHD1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SAMHD1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Arrhinencephaly
- Cavity within brain
- IQ less than 20
- Leukodystrophy
- Multifocal cerebral white matter abnormalities
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
Pokaż jeszcze 18 cech
- Brain degeneration
- Chronic CSF lymphocytosis
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Irritability
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Paralysis or weakness of one side of body
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal pyramidal sign
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Headache
- Tremor
- Degeneration of the striatum
- Deep white matter hypodensities
- Leukoencephalopathy
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/samhd1
Dante Labs. Gen SAMHD1: SAM and HD domain containing deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 1 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/samhd1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni