Gen
SLC25A20
solute carrier family 25 member 20
- HGNC 1421↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000178537↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 788↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3p21.31
- Współrzędne
- Chromosom 3: 48 856 926–48 898 882 (GRCh38)
- Eksony
- 9 eksonów na odcinku 42 kb
- Białko
- 301 aminokwasów
- Znany również jako
- CAC
- Poprzednie symbole
- CACT
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000319017.5NM_000387.6
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a20.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SLC25A20 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zaburzenia utleniania kwasów tłuszczowych i cyklu karnityny
- Zaburzenia utleniania kwasów tłuszczowych i ketogenezyAutosomalne recesywne
Grupa defektów enzymów i transporterów, w tym niedobór MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD i HADH, pierwotny niedobór karnityny oraz niedobór translokazy karnityna-acylokarnityna, które mogą powodować niski poziom cukru we krwi, rozpad mięśni oraz problemy serca i wątroby w okresach głodzenia lub choroby.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 5 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Znajomość schorzenia pozwala unikać długotrwałego głodzenia, przygotować plan postępowania na wypadek choroby oraz, jeśli to właściwe, modyfikować podaż karnityny lub tłuszczu w diecie, co może zapobiegać epizodom zagrażającym życiu.
Budowa genu SLC25A20
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,8 kb z 42 kb genu; 906 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SLC25A20
2Niski
Jak trudno sekwencjonować SLC25A20 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych SLC25A20 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.3,5%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.11%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
74
pozycje w SLC25A20, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 42 kb SLC25A20, łącznie z intronami, a nie tylko 1,8 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Wspólne schorzenie: 1
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainWspólne schorzenie: 1
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainWspólne schorzenie: 1
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainWspólne schorzenie: 1
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaWspólne schorzenie: 1
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseWspólne schorzenie: 1
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseWspólne schorzenie: 1
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- HMGCL3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyaseWspólne schorzenie: 1
- HMGCS23-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2Wspólne schorzenie: 1
- SLC22A5solute carrier family 22 member 5Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SLC25A20
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLC25A20. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Laboratory abnormality
- Fatty infiltration of liver
- Low blood sugar in newborn
- Reduced circulating 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase activity
- Reduced tissue carnitine-acylcarnitine translocase activity
- Elevated circulating fatty acylcarnitine concentration
- Elevated creatine kinase after exercise
- Elevated urinary dicarboxylic acid level
- High blood ammonia levels
Abnormality of the cardiovascular system
- Heart stops beating
- Abnormal heart rate
- Disease of the heart muscle
- Low blood pressure
- Ventricular tachycardia
- Extra heart beat
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Slow heartbeats
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC25A20: solute carrier family 25 member 20. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slc25a20
Dante Labs. Gen SLC25A20: solute carrier family 25 member 20 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slc25a20
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni