Gen
SCN2A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 2
- HGNC 10588↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000136531↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6326↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2q24.3
- Souřadnice
- Chromozom 2: 165 239 414–165 392 304 (GRCh38)
- Exony
- 27 exonů na 152,9 kb
- Protein
- 2 005 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- Nav1.2, HBSCII, HBSCI
- Předchozí symboly
- SCN2A1, SCN2A2
- Transkript MANE Select
- ENST00000375437.7NM_001040142.2
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SCN2A i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hereditary Episodic Ataxias
- Hereditary Episodic AtaxiaAutozomálně dominantní
A group of dominantly inherited ataxias with attacks of imbalance, including EA1 (KCNA1), EA2 (CACNA1A) and EA6 (SLC1A3).
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Episodic ataxia type 2 often responds to acetazolamide or 4-aminopyridine, and avoiding known triggers can reduce attacks.
Širší skupiny
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
Jeden z 171 genů spojených s touto vazbou
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je SCN2A uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 8,8 kb z 152,9 kb genu; 6 018 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SCN2A
433
pozic v genu SCN2A, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 36 (8,3 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (36 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Celý genom pokrývá všech 152,9 kb genu SCN2A, včetně intronů, nikoli jen 8,8 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 2 onemocnění
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Sdílí 2 onemocnění
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ASdílí 2 onemocnění
- FGF13fibroblast growth factor 13Sdílí 2 onemocnění
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 1Sdílí 2 onemocnění
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2BSdílí 2 onemocnění
- KCNA1potassium voltage-gated channel subfamily A member 1Sdílí 2 onemocnění
- MECP2methyl-CpG binding protein 2Sdílí 2 onemocnění
- NACC1nucleus accumbens associated 1Sdílí 2 onemocnění
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunitSdílí 2 onemocnění
- OTUD6BOTU deubiquitinase 6BSdílí 2 onemocnění
- PCDH19protocadherin 19Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s SCN2A
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SCN2A. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Cerebellar edema
- Delayed ability to stand
- Dystonia
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
Zobrazit ještě 116 rysů
- Episodic ataxia
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Severe global developmental delay
- Tonic seizure
- Cognitive impairment
- Episodic hemiplegia
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Multifocal epileptiform discharges
- Neonatal seizure
- Neurodevelopmental delay
- Normal interictal EEG
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormality of the nervous system
- Anxiety
- Ataxia
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- EEG with focal spikes
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal clonic seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness autonomic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Increased reflexes
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Lethargy
- Myoclonic seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Paroxysmal dyskinesia
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Tetraparesis
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Action tremor
- Aggressive behavior
- Atypical absence status epilepticus
- Balance impairment
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Clonic seizure
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Epileptic spasm
- Experiential epileptic aura
- Eyelid myoclonia seizure
- Fewer and broader ridges in brain
- Focal head nodding automatism seizure
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Headache
- Impulsivity
- Incoordination
- Limb myoclonus
- More active than typical
- Neonatal electro-clinical seizure with behavior arrest
- Poor fine motor coordination
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Slurred speech
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Worsening neurological symptoms
- Continuous spike and waves during slow sleep
- Mental deterioration
- Simple febrile seizure
- Brain imaging abnormality
- Psychomotor deterioration
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Facial tics
- Limited neck range of motion
- Decreased facial muscle tone
- Downturned corners of mouth
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- High forehead
Zobrazit ještě 5 rysů
Abnormality of the digestive system
- Vomiting
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Feeding difficulties
Zobrazit ještě 5 rysů
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Dilated pupil
- Inward turning cross eyed
- Outward facing eye ball
- Ocular flutter
- Oculomotor apraxia
- Staring gaze
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Functional motor deficit
- Cogwheel rigidity
- Decreased muscle tone in infant
- Low muscle tone
- Poor head control
- Rigidity
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Scoliosis
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Limited knee straightening
- Pes valgus
- Skewfoot
- Tibial torsion
- Broad finger
- Short finger
- Talipes valgus
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN2A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/scn2a
Dante Labs. Gen SCN2A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/scn2a
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů