Gene
SCN2A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 2
- HGNC 10588↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000136531↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6326↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 2q24.3
- Coordinate
- Cromosoma 2: 165.239.414–165.392.304 (GRCh38)
- Esoni
- 27 esoni su 152,9 kb
- Proteina
- 2005 amminoacidi
- Noto anche come
- Nav1.2, HBSCII, HBSCI
- Simboli precedenti
- SCN2A1, SCN2A2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000375437.7NM_001040142.2
- Tipo di locus
- Protein-coding
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Atassie episodiche ereditarie
- Atassia episodica ereditariaAutosomica dominante
Un gruppo di atassie ereditarie a trasmissione autosomica dominante con attacchi di perdita dell'equilibrio, tra cui EA1 (KCNA1), EA2 (CACNA1A) e EA6 (SLC1A3).
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
▶Azionabilità
L'atassia episodica di tipo 2 risponde spesso ad acetazolamide o 4-aminopiridina, e evitare i fattori scatenanti noti può ridurre gli attacchi.
Raggruppamenti più ampi
Epilessia (Pannello completo)
- Epilessia
Uno di 171 geni collegati ad esso
Un disturbo cerebrale caratterizzato da episodi di scarica neuronale eccessiva e anomala, che causano manifestazioni transitorie di disfunzione neurologica sensoriale, motoria o psichica. Questi episodi possono o meno essere accompagnati da perdita di coscienza o convulsioni.
- 3 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
Disabilità intellettiva
Uno di 233 geni collegati ad esso
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
Struttura di SCN2A
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 8,8 kb dei 152,9 kb del gene; 6018 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di SCN2A
433
posizioni in SCN2A in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
36 di queste (8,3%) ricadono in regioni che le letture corte faticano a leggere.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (36 siti)
Un genoma intero copre tutti i 152,9 kb di SCN2A, introni compresi, non solo i 8,8 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Condivide 2 condizioni
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Condivide 2 condizioni
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ACondivide 2 condizioni
- FGF13fibroblast growth factor 13Condivide 2 condizioni
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 1Condivide 2 condizioni
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2BCondivide 2 condizioni
- KCNA1potassium voltage-gated channel subfamily A member 1Condivide 2 condizioni
- MECP2methyl-CpG binding protein 2Condivide 2 condizioni
- NACC1nucleus accumbens associated 1Condivide 2 condizioni
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunitCondivide 2 condizioni
- OTUD6BOTU deubiquitinase 6BCondivide 2 condizioni
- PCDH19protocadherin 19Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a SCN2A
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SCN2A può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Cerebellar edema
- Delayed ability to stand
- Dystonia
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
Mostra altri 116 tratti
- Episodic ataxia
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Severe global developmental delay
- Tonic seizure
- Cognitive impairment
- Episodic hemiplegia
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Multifocal epileptiform discharges
- Neonatal seizure
- Neurodevelopmental delay
- Normal interictal EEG
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormality of the nervous system
- Anxiety
- Ataxia
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- EEG with focal spikes
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal clonic seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness autonomic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Increased reflexes
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Lethargy
- Myoclonic seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Paroxysmal dyskinesia
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Tetraparesis
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Action tremor
- Aggressive behavior
- Atypical absence status epilepticus
- Balance impairment
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Clonic seizure
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Epileptic spasm
- Experiential epileptic aura
- Eyelid myoclonia seizure
- Fewer and broader ridges in brain
- Focal head nodding automatism seizure
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Headache
- Impulsivity
- Incoordination
- Limb myoclonus
- More active than typical
- Neonatal electro-clinical seizure with behavior arrest
- Poor fine motor coordination
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Slurred speech
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Worsening neurological symptoms
- Continuous spike and waves during slow sleep
- Mental deterioration
- Simple febrile seizure
- Brain imaging abnormality
- Psychomotor deterioration
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Facial tics
- Limited neck range of motion
- Decreased facial muscle tone
- Downturned corners of mouth
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- High forehead
Mostra altri 5 tratti
Abnormality of the digestive system
- Vomiting
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Feeding difficulties
Mostra altri 5 tratti
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Dilated pupil
- Inward turning cross eyed
- Outward facing eye ball
- Ocular flutter
- Oculomotor apraxia
- Staring gaze
Mostra altri 2 tratti
Abnormality of the musculoskeletal system
- Functional motor deficit
- Cogwheel rigidity
- Decreased muscle tone in infant
- Low muscle tone
- Poor head control
- Rigidity
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Scoliosis
Mostra altri 2 tratti
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Limited knee straightening
- Pes valgus
- Skewfoot
- Tibial torsion
- Broad finger
- Short finger
- Talipes valgus
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-17: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SCN2A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/scn2a
Dante Labs. Gene SCN2A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/scn2a
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