Gen
SCN2A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 2
- HGNC 10588↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000136531↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6326↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q24.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 165.239.414–165.392.304 (GRCh38)
- Exons
- 27 exons over 152,9 kb
- Eiwit
- 2.005 aminozuren
- Ook bekend als
- Nav1.2, HBSCII, HBSCI
- Eerdere symbolen
- SCN2A1, SCN2A2
- MANE Select-transcript
- ENST00000375437.7NM_001040142.2
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scn2a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SCN2A en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Erfelijke episodische ataxieën
- Erfelijke episodische ataxieAutosomaal dominant
Een groep dominant erfelijke ataxieën met aanvallen van evenwichtsstoornissen, waaronder EA1 (KCNA1), EA2 (CACNA1A) en EA6 (SLC1A3).
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Episodische ataxie type 2 reageert vaak goed op acetazolamide of 4-aminopyridine, en het vermijden van bekende uitlokkende factoren kan het aantal aanvallen verminderen.
Bredere groeperingen
Epilepsie (volledig panel)
- Epilepsie
Een van 171 genen die hiermee verband houden
Een hersenaandoening die wordt gekenmerkt door episodes van abnormaal verhoogde neuronale ontlading, die leiden tot tijdelijke episodes van sensorische of motorische neurologische stoornissen, of psychische stoornissen. Deze episodes kunnen al dan niet gepaard gaan met bewustzijnsverlies of convulsies.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Intellectuele beperking
Een van 233 genen die hiermee verband houden
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Opbouw van SCN2A
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 8,8 kb van de 152,9 kb van het gen; 6.018 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SCN2A
433
posities in SCN2A waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
36 daarvan (8,3%) vallen in gebieden waar korte reads moeilijk zijn.
- Low mappability (36 locaties)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een whole genome dekt alle 152,9 kb van SCN2A, inclusief intronen, en niet alleen de 8,8 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deelt 2 aandoeningen
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Deelt 2 aandoeningen
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeelt 2 aandoeningen
- FGF13fibroblast growth factor 13Deelt 2 aandoeningen
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 1Deelt 2 aandoeningen
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2BDeelt 2 aandoeningen
- KCNA1potassium voltage-gated channel subfamily A member 1Deelt 2 aandoeningen
- MECP2methyl-CpG binding protein 2Deelt 2 aandoeningen
- NACC1nucleus accumbens associated 1Deelt 2 aandoeningen
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunitDeelt 2 aandoeningen
- OTUD6BOTU deubiquitinase 6BDeelt 2 aandoeningen
- PCDH19protocadherin 19Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan SCN2A
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SCN2A kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Cerebellar edema
- Delayed ability to stand
- Dystonia
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Epileptic encephalopathy
Toon 116 kenmerken meer
- Episodic ataxia
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Grand mal seizures
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Repeated seizures without recovery between them
- Severe global developmental delay
- Tonic seizure
- Cognitive impairment
- Episodic hemiplegia
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- Hypsarrhythmia
- Inability to walk
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Multifocal epileptiform discharges
- Neonatal seizure
- Neurodevelopmental delay
- Normal interictal EEG
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormality of the nervous system
- Anxiety
- Ataxia
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- EEG with focal spikes
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal clonic seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness autonomic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Increased reflexes
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Lethargy
- Myoclonic seizure
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Paroxysmal dyskinesia
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Tetraparesis
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Action tremor
- Aggressive behavior
- Atypical absence status epilepticus
- Balance impairment
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Clonic seizure
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Epileptic spasm
- Experiential epileptic aura
- Eyelid myoclonia seizure
- Fewer and broader ridges in brain
- Focal head nodding automatism seizure
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Headache
- Impulsivity
- Incoordination
- Limb myoclonus
- More active than typical
- Neonatal electro-clinical seizure with behavior arrest
- Poor fine motor coordination
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Slurred speech
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Worsening neurological symptoms
- Continuous spike and waves during slow sleep
- Mental deterioration
- Simple febrile seizure
- Brain imaging abnormality
- Psychomotor deterioration
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Facial tics
- Limited neck range of motion
- Decreased facial muscle tone
- Downturned corners of mouth
- Drooling
- Exaggerated cupid's bow
- High forehead
Toon 5 kenmerken meer
Abnormality of the digestive system
- Vomiting
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Feeding difficulties
Toon 5 kenmerken meer
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Dilated pupil
- Inward turning cross eyed
- Outward facing eye ball
- Ocular flutter
- Oculomotor apraxia
- Staring gaze
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of the musculoskeletal system
- Functional motor deficit
- Cogwheel rigidity
- Decreased muscle tone in infant
- Low muscle tone
- Poor head control
- Rigidity
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Scoliosis
Toon 2 kenmerken meer
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Limited knee straightening
- Pes valgus
- Skewfoot
- Tibial torsion
- Broad finger
- Short finger
- Talipes valgus
Toon 1 kenmerk meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SCN2A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/scn2a
Dante Labs. SCN2A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/scn2a
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken