Gen
TP53
tumor protein p53
- HGNC 11998↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000141510↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 7157↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 17p13.1
- Koordinatlar
- Kromozom 17: 7.668.421–7.687.490 (GRCh38)
- Eksonlar
- 19,1 kb boyunca 11 ekson
- Protein
- 393 amino asit
- Diğer adları
- p53, LFS1
- MANE Select transkripti
- ENST00000269305.9NM_000546.6
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tp53.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameTP53 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Böbrek Kanseri
Böbreği tutan primer veya metastatik malign neoplazi.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Li-Fraumeni Sendromu
- Otozomal dominant
Erken yaşta sarkomlar, meme kanseri, beyin tümörleri, adrenokortikal karsinom ve lösemi ile seyreden, TP53 ilişkili bir kanser yatkınlığı sendromudur.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 5 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
- ACMG ikincil bulgular listesinde
▶Eyleme geçirilebilirlik
Tüm vücut MR ile izlem, radyasyon maruziyetinin en aza indirilmesi, adrenokortikal kanser taraması, kaskad testi, prenatal/preimplantasyon genetik tanı
Malign Endokrin Neoplazi
Endokrin bezleri etkileyen malign bir neoplazi. Tipik örnekler arasında tiroid bezi karsinomu, paratiroid bezi karsinomu, hipofiz bezi karsinomu ve adrenal korteks karsinomu yer alır.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Üriner ve Renal Sistem Tümörü
- Üriner Sistem Neoplazisi
Üriner sistemi etkileyen, iyi huylu veya kötü huylu, primer veya metastatik bir neoplazi.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
TP53 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 19,1 kb uzunluğunun 2,5 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.182 tanesi proteini kodlar.
TP53 dizilemesi
0Düşük
100 üzerinden, TP53 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, TP53 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%2
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%0
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
596
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin TP53 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, TP53 genin tamamı olan 19,1 kb'yi kapsar; yalnızca 2,5 kb'lik ekzonları değil.
Sayfası olan varyantlar (162)
Burada sayfası bulunan TP53 varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| A138P | c.412G>C | Ekzon 5 | 7.675.200 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A138V | c.413C>T | Ekzon 5 | 7.675.199 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A161_Y163delinsD | c.482_487del | Ekzon 5 | 7.675.124 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A347D | c.1040C>A | Ekzon 10 | 7.670.669 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| c.-29+1G>T | İntron 1 | 7.687.376 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.97-1G>A | İntron 3 | 7.676.273 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.375+5G>A | İntron 4 | 7.675.989 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.919+1G>A | İntron 8 | 7.673.700 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.993+1del | İntron 9 | 7.673.533 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| C124X | c.372C>A | Ekzon 4 | 7.675.997 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 12 durumu paylaşıyor
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 42 durumu paylaşıyor
- FLCNfolliculin2 durumu paylaşıyor
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase2 durumu paylaşıyor
- PAX6paired box 62 durumu paylaşıyor
- RETret proto-oncogene2 durumu paylaşıyor
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A2 durumu paylaşıyor
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 22 durumu paylaşıyor
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B2 durumu paylaşıyor
- TRIM28tripartite motif containing 282 durumu paylaşıyor
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressor2 durumu paylaşıyor
- CDC73cell division cycle 731 durumu paylaşıyor
TP53 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, TP53 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Choroid plexus carcinoma
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Pins and needles feeling
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Anxiety
- Behavioral abnormality
22 özellik daha göster
- Can't control feelings
- Difficulty staying or falling asleep
- Grand mal seizures
- Headache
- Irritability
- Migraine
- Panic attack
- Astrocytoma
- Cognitive impairment
- Depression
- Ependymoma
- Epilepsy
- Glioblastoma multiforme
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Psychotic episodes
- Suicidal ideation
- Tumors of the central nervous system
- Dementia
- Medulloblastoma
- Paranoia
- Psychosis
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Erythroid hypoplasia
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Pure red cell aplasia
- Abnormal shape of platelets
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bone marrow disease
- Increased megakaryocyte count
21 özellik daha göster
- Increased number of platelets in blood
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased total eosinophil count
- Elevated white blood count
- Acute blood cancer
- Blood cancer
- Blood clot in liver vein
- Blood spots
- Cancer of lymphatic system
- Ecchymosis
- Myelodysplasia
- Myelofibrosis
- Acute lymphoblastic leukemia
- Acute myeloid leukemia
- Hodgkin lymphoma
- Non-Hodgkin lymphoma
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
19 özellik daha göster
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Colorectal polyposis
- Gastrointestinal tract tumor
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Stomach cancer
- Rectal tumor
- Hepatocellular carcinoma
- Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
- Micronodular cirrhosis
- Nausea
- Stomach tumor
- Subacute progressive viral hepatitis
- Vomiting
Abnormality of the endocrine system
- Adrenocortical carcinoma
- Decreased activity of gonads
- Increased circulating cortisol level
- Paradoxical increased cortisol secretion on dexamethasone suppression test
- Pituitary corticotropic cell adenoma
- Abnormal circulating dehydroepiandrosterone concentration
- Adrenocorticotropic hormone deficiency
- Elevated plasma aldosterone
Abnormality of the integument
- Choroid plexus papilloma
- Reticular hyperpigmentation
- Buffalo hump
- Excessive hair growth
- Excessive hairiness
- Excessive sweating
- Patchy darkened skin
- Plethora
6 özellik daha göster
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of the cerebral blood vessels
- Heart attack
- Abnormality of the cardiovascular system
- Capillary fragility
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Palpitations
- Swollen lymph nodes
4 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.18-e609d43e.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). TP53 geni: tumor protein p53. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/tp53
Dante Labs. TP53 geni: tumor protein p53 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/tp53
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde