Geeni
TP53
tumor protein p53
- HGNC 11998↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000141510↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7157↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 17p13.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 17: 7 668 421–7 687 490 (GRCh38)
- Eksonit
- 11 eksonia 19,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 393 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- p53, LFS1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000269305.9NM_000546.6
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TP53 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Munuaissyöpä
Munuaisen ensisijainen tai etäpesäkkeinen pahanlaatuinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Li-Fraumeni-oireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
TP53-geeniin liittyvä syöpäalttiusoireyhtymä, jossa esiintyy varhain alkavia sarkoomia, rintasyöpää, aivokasvaimia, lisämunuaiskuoren karsinoomaa ja leukemiaa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Koko kehon MRI-seuranta, säteilyaltistuksen minimointi, lisämunuaiskuoren syövän seulonta, kaskadimainen sukulaistestaus, sikiödiagnostiikka ja preimplantaatiogeneettinen diagnostiikka
Pahanlaatuinen endokriininen kasvain
Pahanlaatuinen kasvain, joka kohdistuu endokriinisiin rauhasiin. Esimerkkeinä ovat kilpirauhasen karsinooma, lisäkilpirauhasen karsinooma, aivolisäkkeen karsinooma ja lisämunuaiskuoren karsinooma.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Virtsateiden ja munuaisten kasvain
- Virtsaelimistön kasvain
Virtsaelimistöön liittyvä hyvänlaatuinen tai pahanlaatuinen, ensisijainen tai etäpesäkkeinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
TP53-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 19,1 kb:stä; 1 182 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TP53
596
TP53-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 19,1 kb geenistä TP53, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,5 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (162)
Tässä ovat TP53-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A138P | c.412G>C | Eksoni 5 | 7 675 200 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A138V | c.413C>T | Eksoni 5 | 7 675 199 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A161_Y163delinsD | c.482_487del | Eksoni 5 | 7 675 124 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A347D | c.1040C>A | Eksoni 10 | 7 670 669 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.-29+1G>T | Introni 1 | 7 687 376 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.97-1G>A | Introni 3 | 7 676 273 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.375+5G>A | Introni 4 | 7 675 989 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.919+1G>A | Introni 8 | 7 673 700 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.993+1del | Introni 9 | 7 673 533 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| C124X | c.372C>A | Eksoni 4 | 7 675 997 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Yhteisiä sairauksia: 2
- FLCNfolliculinYhteisiä sairauksia: 2
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
- PAX6paired box 6Yhteisiä sairauksia: 2
- RETret proto-oncogeneYhteisiä sairauksia: 2
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AYhteisiä sairauksia: 2
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Yhteisiä sairauksia: 2
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BYhteisiä sairauksia: 2
- TRIM28tripartite motif containing 28Yhteisiä sairauksia: 2
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorYhteisiä sairauksia: 2
- CDC73cell division cycle 73Yhteinen sairaus: 1
Geeniin TP53 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TP53 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Choroid plexus carcinoma
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Pins and needles feeling
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Anxiety
- Behavioral abnormality
Näytä 22 piirrettä lisää
- Can't control feelings
- Difficulty staying or falling asleep
- Grand mal seizures
- Headache
- Irritability
- Migraine
- Panic attack
- Astrocytoma
- Cognitive impairment
- Depression
- Ependymoma
- Epilepsy
- Glioblastoma multiforme
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Psychotic episodes
- Suicidal ideation
- Tumors of the central nervous system
- Dementia
- Medulloblastoma
- Paranoia
- Psychosis
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Erythroid hypoplasia
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Pure red cell aplasia
- Abnormal shape of platelets
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bone marrow disease
- Increased megakaryocyte count
Näytä 21 piirrettä lisää
- Increased number of platelets in blood
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Bleeding tendency
- Bruising susceptibility
- Decreased blood lymphocyte number
- Decreased total eosinophil count
- Elevated white blood count
- Acute blood cancer
- Blood cancer
- Blood clot in liver vein
- Blood spots
- Cancer of lymphatic system
- Ecchymosis
- Myelodysplasia
- Myelofibrosis
- Acute lymphoblastic leukemia
- Acute myeloid leukemia
- Hodgkin lymphoma
- Non-Hodgkin lymphoma
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal pain
- Anorexia
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
Näytä 19 piirrettä lisää
- Intestinal pseudo-obstruction
- Jaundice
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Colorectal polyposis
- Gastrointestinal tract tumor
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Nausea and vomiting
- Peritoneal abscess
- Stomach cancer
- Rectal tumor
- Hepatocellular carcinoma
- Hereditary nonpolyposis colorectal carcinoma
- Micronodular cirrhosis
- Nausea
- Stomach tumor
- Subacute progressive viral hepatitis
- Vomiting
Abnormality of the endocrine system
- Adrenocortical carcinoma
- Decreased activity of gonads
- Increased circulating cortisol level
- Paradoxical increased cortisol secretion on dexamethasone suppression test
- Pituitary corticotropic cell adenoma
- Abnormal circulating dehydroepiandrosterone concentration
- Adrenocorticotropic hormone deficiency
- Elevated plasma aldosterone
Abnormality of the integument
- Choroid plexus papilloma
- Reticular hyperpigmentation
- Buffalo hump
- Excessive hair growth
- Excessive hairiness
- Excessive sweating
- Patchy darkened skin
- Plethora
Näytä 6 piirrettä lisää
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of the cerebral blood vessels
- Heart attack
- Abnormality of the cardiovascular system
- Capillary fragility
- High blood pressure
- Increased spleen size
- Palpitations
- Swollen lymph nodes
Näytä 4 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TP53-geeni: tumor protein p53. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/tp53
Dante Labs. TP53-geeni: tumor protein p53 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/tp53
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa