Gen
ALOX12B
arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type
- HGNC 430↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000179477↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 242↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 17p13.1
- Koordinatlar
- Kromozom 17: 8.072.636–8.087.716 (GRCh38)
- Eksonlar
- 15,1 kb boyunca 15 ekson
- Protein
- 701 amino asit
- Diğer adları
- 12R-LOX
- MANE Select transkripti
- ENST00000647874.1NM_001139.3
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/alox12b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameALOX12B ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Kalıtsal İhtiyozlar
- Otozomal resesif konjenital iktiyozOtozomal resesif
Genellikle doğumda görülen, çoğunlukla kollodiyon zarı ile birlikte bulunan ve harlequin iktiyozu ile lamellar iktiyozu da içeren resesif iktiyoz grubudur.
- 4 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Erken tanı, yenidoğan bakımına, emolyent ve keratolitik tedavi rejimlerine ile ısı intoleransına karşı alınacak önlemlere yol gösterir.
ALOX12B geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 15,1 kb uzunluğunun 2,5 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.106 tanesi proteini kodlar.
ALOX12B dizilemesi
4Düşük
100 üzerinden, ALOX12B genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, ALOX12B geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%1,6
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%38
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
43
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin ALOX12B içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, ALOX12B genin tamamı olan 15,1 kb'yi kapsar; yalnızca 2,5 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ABCA12ATP binding cassette subfamily A member 121 durumu paylaşıyor
- ALOXE3arachidonate epidermal lipoxygenase 31 durumu paylaşıyor
- CERS3ceramide synthase 31 durumu paylaşıyor
- CSTAcystatin A1 durumu paylaşıyor
- CYP4F22cytochrome P450 family 4 subfamily F member 221 durumu paylaşıyor
- KRT2keratin 21 durumu paylaşıyor
- LIPNlipase family member N1 durumu paylaşıyor
- NIPAL4NIPA like domain containing 41 durumu paylaşıyor
- PNPLA1patatin like domain 1, omega-hydroxyceramide transacylase1 durumu paylaşıyor
- SDR9C7short chain dehydrogenase/reductase family 9C member 71 durumu paylaşıyor
- SERPINB8serpin family B member 81 durumu paylaşıyor
- ST14ST14 transmembrane serine protease matriptase1 durumu paylaşıyor
ALOX12B ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, ALOX12B geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). ALOX12B geni: arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/alox12b
Dante Labs. ALOX12B geni: arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/alox12b
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde