Gen
BAP1
BRCA1 associated deubiquitinase 1
- HGNC 950↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000163930↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 8314↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 3p21.1
- Koordinatlar
- Kromozom 3: 52.401.008–52.410.008 (GRCh38)
- Eksonlar
- 9 kb boyunca 17 ekson
- Protein
- 729 amino asit
- Diğer adları
- hucep-6, KIAA0272, UCHL2
- MANE Select transkripti
- ENST00000460680.6NM_004656.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/bap1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameBAP1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
BAP1 Tümör Predispozisyon Sendromu
- Otozomal dominant
Uveal ve kütanöz melanom, mezotelyoma, renal hücreli karsinom ve diğer tümör risklerini artıran BAP1 varyantları.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 5 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Asbeste maruz kalmaktan kaçınmanın yanı sıra yıllık göz, cilt ve böbrek kontrolleri önerilir; yakınlarınıza test yapılması teklif edilebilir.
Böbrek Kanseri
Böbreği tutan primer veya metastatik malign neoplazi.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
Üriner ve Renal Sistem Tümörü
- Üriner Sistem Neoplazisi
Üriner sistemi etkileyen, iyi huylu veya kötü huylu, primer veya metastatik bir neoplazi.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
BAP1 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 9 kb uzunluğunun 3,6 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.190 tanesi proteini kodlar.
BAP1 dizilemesi
2Düşük
100 üzerinden, BAP1 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, BAP1 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%1,4
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%18
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
359
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin BAP1 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, BAP1 genin tamamı olan 9 kb'yi kapsar; yalnızca 3,6 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 42 durumu paylaşıyor
- FLCNfolliculin2 durumu paylaşıyor
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase2 durumu paylaşıyor
- PAX6paired box 62 durumu paylaşıyor
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B2 durumu paylaşıyor
- TP53tumor protein p532 durumu paylaşıyor
- TRIM28tripartite motif containing 282 durumu paylaşıyor
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressor2 durumu paylaşıyor
- RETret proto-oncogene1 durumu paylaşıyor
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A1 durumu paylaşıyor
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 21 durumu paylaşıyor
BAP1 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, BAP1 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intracranial meningioma
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
- Attention deficit
- Epilepsy
- Focal T2 hypointense thalamic lesion
- Headache
26 özellik daha göster
- Motor delay
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal central motor function
- Abnormal central sensory function
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of the cerebellum
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Fourth cranial nerve palsy
- Memory impairment
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Rise in pressure inside skull
- Spinal meningioma
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Trigeminal neuralgia
- Weakness of one side of body
- Abnormal speech pattern
- Brain stem compression
- Can't control feelings
- Excessive daytime sleepiness
- Spasms on one side of the face
- Transient global amnesia
- Intellectual disability
Abnormality of the endocrine system
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating prolactin concentration
- Low blood cortisol level
8 özellik daha göster
Abnormality of the integument
- Mole
- Abnormality of the hair
- Dry skin
- Freckling
- Cutaneous melanoma
- Excessive hair growth
- Hair loss
- Neurofibroma
2 özellik daha göster
Abnormality of the respiratory system
- Abnormal pleura morphology
- Breathing difficulties
- Breathing difficulty
- Cough
- Abnormality of lung structure
- Functional respiratory abnormality
- Lung adenocarcinoma
- Abnormality on pulmonary function testing
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). BAP1 geni: BRCA1 associated deubiquitinase 1. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/bap1
Dante Labs. BAP1 geni: BRCA1 associated deubiquitinase 1 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/bap1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde