Gen
PTEN
phosphatase and tensin homolog
- HGNC 9588↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000171862↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 5728↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 10q23.31
- Coordenadas
- Cromosoma 10: 87.863.625–87.971.930 (GRCh38)
- Exones
- 9 exones en 108,3 kb
- Proteína
- 403 aminoácidos
- Herencia
- Autosómica dominante
- También conocido como
- MMAC1, TEP1, PTEN1
- Símbolos anteriores
- BZS, MHAM
- Transcrito MANE Select
- ENST00000371953.8NM_000314.8
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.
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Síndrome de Cowden (síndrome de tumores hamartomatosos asociados a PTEN)
- Síndrome de Cowden 1Autosómica dominante
Cualquier caso de enfermedad de Cowden cuya causa sea una mutación en el gen PTEN.
- 4 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- En la lista de hallazgos secundarios del ACMG
- Enfermedad de Lhermitte-DuclosAutosómica dominante
Un crecimiento benigno del cerebelo (gangliocitoma displásico) que en adultos está fuertemente asociado con variantes de PTEN.
- 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
Su hallazgo justifica la realización de pruebas de PTEN y la vigilancia del cáncer en el síndrome de tumores hamartomatosos por PTEN.
- Síndrome de macrocefalia y autismoAutosómica dominante
Variantes de PTEN que se manifiestan con un perímetro craneal grande y trastorno del espectro autista o retraso del desarrollo.
- 2 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
Los niños y adultos con una variante de PTEN necesitan la misma vigilancia del cáncer que en el síndrome de Cowden.
- Síndrome de tumores hamartomatosos por PTENAutosómica dominante
El espectro de afecciones relacionadas con PTEN, incluidos los síndromes de Cowden y de Bannayan-Riley-Ruvalcaba, con hamartomas y un mayor riesgo de cáncer de mama, tiroides, endometrio, riñón y otros tipos de cáncer.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
Vigilancia periódica de mama, tiroides, endometrio, riñón, intestino y piel, y realización de pruebas a sus familiares.
Herencia
- Autosómica dominante
- Basta con una copia alterada, procedente de cualquiera de los progenitores. Un progenitor que la tenga la transmite a cada hijo con una probabilidad de uno entre dos.
Estructura de PTEN
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
- Variantes con una página
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 8,5 kb de los 108,3 kb del gen; 1212 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen PTEN
743
posiciones en PTEN donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
128 de ellas (17 %) caen en regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
- Low mappability (125 sitios)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (23 sitios)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma completo cubre los 108,3 kb de PTEN, incluidos los intrones, y no solo los 8,5 kb de exones.
Variantes con una página (238)
Las variantes de PTEN con una página aquí, primero las de más estrellas de revisión. Cada página describe el registro público de ClinVar sobre la variante, nunca un resultado.
| Variante | HGVS c. | Exón o intrón | Posición (GRCh38) | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|---|---|
| A34P | c.100G>C | Exón 2 | 87.894.045 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| A39T | c.115G>A | Exón 2 | 87.894.060 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| A39V | c.116C>T | Exón 2 | 87.894.061 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| A148Hfs*5 | c.441_442delinsA | Exón 5 | 87.933.200 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| c.1A>G | Exón 1 | 87.864.470 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.80-1G>C | Intrón 1 | 87.894.024 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.106G>A | Exón 2 | 87.894.051 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.165-1G>A | Intrón 2 | 87.925.512 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.165-1G>C | Intrón 2 | 87.925.512 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.209+1_209+4del | Exón 3 | 87.925.557 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
Genes vinculados a las mismas afecciones
Rasgos asociados a PTEN
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que PTEN puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of head or neck
- Postnatal macrocephaly
- Abnormally large tongue
- Benign eye tumor
- Big calvaria
- Conjunctival hamartoma
- Open bite
- Abnormal facial shape
- Adenoma sebaceum
Mostrar 24 rasgos más
- Big lower jaw
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Grooved tongue
- High palate
- Large forehead
- Midface retrusion
- Prominent forehead
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Narrow mouth
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Short chin
- Short nose
- Wide nose
- Broad forehead
- Decreased size of maxilla
- Decreased width of the skull
- Progressively abnormally enlarging cranium
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Oligodendroglioma
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cranial nerve paralysis
- Enlarged cerebellum
- Epilepsy
Mostrar 23 rasgos más
- Headache
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Cognitive impairment
- Communicating hydrocephalus
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Motor delay
- Short attention span
- Speech apraxia
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of the cerebellum
- Delayed motor skills
- Hemangioblastoma
- Intellectual disability, mild
- Paralysis or weakness of one side of body
- Tumors of the central nervous system
- Attention deficit
- Dysplastic gangliocytoma of the cerebellum
- Hemimegalencephaly
- Intention tremor
Abnormality of the cardiovascular system
- Arteriovenous malformation
- Lymphangioma
- Poorly functioning veins
- Strawberry birthmark
- Strawberry mark
- Visceral angiomatosis
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Dilation of Virchow-Robin spaces
Mostrar 12 rasgos más
- Mucosal telangiectasiae
- Abnormality of the heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Angina pectoris
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Cutis marmorata
- Enlarged thymus
- Increased spleen size
- Patent ductus arteriosus
- Spider veins
- Abnormality of the vasculature
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Gastrointestinal bleeding
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Black feces
- Bleeding below the skin
- Bleeding tendency
- Rectal bleeding
- Refractory anemia
- Bleeding within the skull
Mostrar 3 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen PTEN: phosphatase and tensin homolog. Consultado el 16 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/pten
Dante Labs. Gen PTEN: phosphatase and tensin homolog [Internet]. [citado 16 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/pten
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