Genas
PTEN
phosphatase and tensin homolog
- HGNC 9588↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000171862↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 5728↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 10q23.31
- Koordinatės
- Chromosoma 10: 87 863 625–87 971 930 (GRCh38)
- Eksonai
- 9 eksonų per 108,3 kb
- Baltymas
- 403 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Taip pat žinomas kaip
- MMAC1, TEP1, PTEN1
- Ankstesni simboliai
- BZS, MHAM
- MANE Select transkriptas
- ENST00000371953.8NM_000314.8
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite PTEN ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Kaudeno sindromas (PTEN hamartomų auglių sindromas)
- Kaudeno sindromas 1Autosominis dominantinis
Bet koks Kaudeno liga, kurios priežastis – PTEN geno mutacija.
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
- Lhermitte-Duclos ligaAutosominis dominantinis
Gerybinis smegenėlių perauglis (displastinė gangliocitoma), kuris suaugusiems stipriai siejamas su PTEN variantais.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Jos nustatymas skatina atlikti PTEN tyrimą ir vykdyti vėžio stebėseną dėl PTEN hamartominių navikų sindromo.
- Makrocefalijos ir autizmo sindromasAutosominis dominantinis
PTEN variantai, pasireiškiantys didele galvos apimtimi ir autizmo spektro sutrikimu arba vystymosi vėlavimu.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Vaikams ir suaugusiems, turintiems PTEN variantą, reikia tokios pačios vėžio stebėsenos, kaip ir sergant Cowden sindromu.
- PTEN hamartominių navikų sindromasAutosominis dominantinis
PTEN genu sukeliamų būklių spektras, įskaitant Cowden ir Bannayan-Riley-Ruvalcaba sindromus, kuriems būdingos hamartomos ir padidėjusi krūties, skydliaukės, endometriumo, inkstų ir kitų vėžių rizika.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Reguliari krūties, skydliaukės, endometriumo, inkstų, žarnyno ir odos stebėsena bei giminaičių tyrimas.
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas PTEN
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 8,5 kb iš 108,3 kb geno; 1 212 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito PTEN
743
PTEN geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 128 (17 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (125 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (23 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 108,3 kb PTEN geno, įskaitant intronus, o ne tik 8,5 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (238)
Čia pateikiami PTEN variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A34P | c.100G>C | Eksonas 2 | 87 894 045 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A39T | c.115G>A | Eksonas 2 | 87 894 060 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A39V | c.116C>T | Eksonas 2 | 87 894 061 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A148Hfs*5 | c.441_442delinsA | Eksonas 5 | 87 933 200 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.1A>G | Eksonas 1 | 87 864 470 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.80-1G>C | Intronas 1 | 87 894 024 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.106G>A | Eksonas 2 | 87 894 051 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.165-1G>A | Intronas 2 | 87 925 512 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.165-1G>C | Intronas 2 | 87 925 512 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.209+1_209+4del | Eksonas 3 | 87 925 557 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
Savybės, susijusios su PTEN
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PTEN, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of head or neck
- Postnatal macrocephaly
- Abnormally large tongue
- Benign eye tumor
- Big calvaria
- Conjunctival hamartoma
- Open bite
- Abnormal facial shape
- Adenoma sebaceum
Rodyti dar 24 savybių
- Big lower jaw
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Grooved tongue
- High palate
- Large forehead
- Midface retrusion
- Prominent forehead
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Narrow mouth
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Short chin
- Short nose
- Wide nose
- Broad forehead
- Decreased size of maxilla
- Decreased width of the skull
- Progressively abnormally enlarging cranium
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Oligodendroglioma
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cranial nerve paralysis
- Enlarged cerebellum
- Epilepsy
Rodyti dar 23 savybių
- Headache
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Cognitive impairment
- Communicating hydrocephalus
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Motor delay
- Short attention span
- Speech apraxia
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of the cerebellum
- Delayed motor skills
- Hemangioblastoma
- Intellectual disability, mild
- Paralysis or weakness of one side of body
- Tumors of the central nervous system
- Attention deficit
- Dysplastic gangliocytoma of the cerebellum
- Hemimegalencephaly
- Intention tremor
Abnormality of the cardiovascular system
- Arteriovenous malformation
- Lymphangioma
- Poorly functioning veins
- Strawberry birthmark
- Strawberry mark
- Visceral angiomatosis
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Dilation of Virchow-Robin spaces
Rodyti dar 12 savybių
- Mucosal telangiectasiae
- Abnormality of the heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Angina pectoris
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Cutis marmorata
- Enlarged thymus
- Increased spleen size
- Patent ductus arteriosus
- Spider veins
- Abnormality of the vasculature
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Gastrointestinal bleeding
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Black feces
- Bleeding below the skin
- Bleeding tendency
- Rectal bleeding
- Refractory anemia
- Bleeding within the skull
Rodyti dar 3 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PTEN genas: phosphatase and tensin homolog. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/pten
Dante Labs. PTEN genas: phosphatase and tensin homolog [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/pten
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites