Gene
PTEN
phosphatase and tensin homolog
- HGNC 9588↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000171862↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 5728↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 10q23.31
- Coordinate
- Cromosoma 10: 87.863.625–87.971.930 (GRCh38)
- Esoni
- 9 esoni su 108,3 kb
- Proteina
- 403 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Noto anche come
- MMAC1, TEP1, PTEN1
- Simboli precedenti
- BZS, MHAM
- Trascritto MANE Select
- ENST00000371953.8NM_000314.8
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Sindrome di Cowden (sindrome dei tumori amartomatosi associati a PTEN)
- Sindrome di Cowden 1Autosomica dominante
Qualsiasi forma di malattia di Cowden in cui la causa sia una mutazione nel gene PTEN.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
- Malattia di Lhermitte-DuclosAutosomica dominante
Un'escrescenza benigna del cervelletto (gangliocitoma displastico) che negli adulti è fortemente associata a varianti di PTEN.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Il suo riscontro porta a eseguire il test di PTEN e la sorveglianza oncologica per la sindrome da tumore hamartomatoso di PTEN.
- Sindrome da macrocefalia e autismoAutosomica dominante
Varianti di PTEN che si manifestano con una circonferenza cranica aumentata e disturbo dello spettro autistico o ritardo dello sviluppo.
- 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Bambini e adulti con una variante di PTEN necessitano della stessa sorveglianza oncologica prevista per la sindrome di Cowden.
- Sindrome da tumore hamartomatoso di PTENAutosomica dominante
Lo spettro delle condizioni correlate a PTEN, comprendenti le sindromi di Cowden e di Bannayan-Riley-Ruvalcaba, con amartomi e aumentato rischio di tumori della mammella, della tiroide, dell'endometrio, del rene e di altri organi.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Controlli periodici di mammella, tiroide, endometrio, rene, intestino e cute, e test sui familiari.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
Struttura di PTEN
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 8,5 kb dei 108,3 kb del gene; 1212 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PTEN
743
posizioni in PTEN in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
128 di esse (17%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Low mappability (125 siti)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (23 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma intero copre tutti i 108,3 kb di PTEN, introni inclusi, non solo i 8,5 kb di esoni.
Varianti con una pagina (238)
Le varianti PTEN con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A34P | c.100G>C | Esone 2 | 87.894.045 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| A39T | c.115G>A | Esone 2 | 87.894.060 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| A39V | c.116C>T | Esone 2 | 87.894.061 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| A148Hfs*5 | c.441_442delinsA | Esone 5 | 87.933.200 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| c.1A>G | Esone 1 | 87.864.470 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.80-1G>C | Introne 1 | 87.894.024 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.106G>A | Esone 2 | 87.894.051 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.165-1G>A | Introne 2 | 87.925.512 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.165-1G>C | Introne 2 | 87.925.512 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.209+1_209+4del | Esone 3 | 87.925.557 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Geni associati alle stesse condizioni
Tratti collegati a PTEN
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PTEN può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of head or neck
- Postnatal macrocephaly
- Abnormally large tongue
- Benign eye tumor
- Big calvaria
- Conjunctival hamartoma
- Open bite
- Abnormal facial shape
- Adenoma sebaceum
Mostra altri 24 tratti
- Big lower jaw
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Grooved tongue
- High palate
- Large forehead
- Midface retrusion
- Prominent forehead
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Narrow mouth
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Short chin
- Short nose
- Wide nose
- Broad forehead
- Decreased size of maxilla
- Decreased width of the skull
- Progressively abnormally enlarging cranium
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Oligodendroglioma
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cranial nerve paralysis
- Enlarged cerebellum
- Epilepsy
Mostra altri 23 tratti
- Headache
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Cognitive impairment
- Communicating hydrocephalus
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Motor delay
- Short attention span
- Speech apraxia
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of the cerebellum
- Delayed motor skills
- Hemangioblastoma
- Intellectual disability, mild
- Paralysis or weakness of one side of body
- Tumors of the central nervous system
- Attention deficit
- Dysplastic gangliocytoma of the cerebellum
- Hemimegalencephaly
- Intention tremor
Abnormality of the cardiovascular system
- Arteriovenous malformation
- Lymphangioma
- Poorly functioning veins
- Strawberry birthmark
- Strawberry mark
- Visceral angiomatosis
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Dilation of Virchow-Robin spaces
Mostra altri 12 tratti
- Mucosal telangiectasiae
- Abnormality of the heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Angina pectoris
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Cutis marmorata
- Enlarged thymus
- Increased spleen size
- Patent ductus arteriosus
- Spider veins
- Abnormality of the vasculature
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Gastrointestinal bleeding
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Black feces
- Bleeding below the skin
- Bleeding tendency
- Rectal bleeding
- Refractory anemia
- Bleeding within the skull
Mostra altri 3 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PTEN: phosphatase and tensin homolog. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pten
Dante Labs. Gene PTEN: phosphatase and tensin homolog [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pten
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