Gén
PTEN
phosphatase and tensin homolog
- HGNC 9588↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000171862↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 5728↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 10q23.31
- Koordináták
- 10. kromoszóma: 87 863 625–87 971 930 (GRCh38)
- Exonok
- 9 exon, összesen 108,3 kb
- Fehérje
- 403 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális domináns
- Más néven ismert
- MMAC1, TEP1, PTEN1
- Korábbi jelölések
- BZS, MHAM
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000371953.8NM_000314.8
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a PTEN-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Cowden Syndrome (PTEN hamartoma tumour syndrome)
- Cowden Syndrome 1Autoszomális domináns
Any Cowden disease in which the cause of the disease is a mutation in the PTEN gene.
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
- Lhermitte-Duclos diseaseAutoszomális domináns
A benign overgrowth of the cerebellum (dysplastic gangliocytoma) that in adults is strongly associated with PTEN variants.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Its finding prompts PTEN testing and cancer surveillance for PTEN hamartoma tumour syndrome.
- Macrocephaly-autism syndromeAutoszomális domináns
PTEN variants presenting with a large head size and autism spectrum disorder or developmental delay.
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Children and adults with a PTEN variant need the same cancer surveillance as in Cowden syndrome.
- PTEN hamartoma tumour syndromeAutoszomális domináns
The spectrum of PTEN-related conditions, including Cowden and Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndromes, with hamartomas and raised risks of breast, thyroid, endometrial, kidney and other cancers.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Regular breast, thyroid, endometrial, kidney, bowel and skin surveillance, and testing of relatives.
Öröklődési mód
- Autoszomális domináns
- Egy megváltozott másolat bármelyik szülőtől is származik, elegendő. Az a szülő, akinek van ilyen másolata, minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
A PTEN felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 108,3 kb-jából 8,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1212 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) PTEN gént
743
pozíció a(z) PTEN génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 128 (17%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (125 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (23 hely)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genom a PTEN gén mind a 108,3 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 8,5 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (238)
Az itt található, oldallal rendelkező PTEN variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A34P | c.100G>C | 2. exon | 87 894 045 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A39T | c.115G>A | 2. exon | 87 894 060 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A39V | c.116C>T | 2. exon | 87 894 061 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| A148Hfs*5 | c.441_442delinsA | 5. exon | 87 933 200 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| c.1A>G | 1. exon | 87 864 470 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.80-1G>C | 1. intron | 87 894 024 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.106G>A | 2. exon | 87 894 051 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.165-1G>A | 2. intron | 87 925 512 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.165-1G>C | 2. intron | 87 925 512 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.209+1_209+4del | 3. exon | 87 925 557 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
A(z) PTEN génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PTEN gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Postnatal macrocephaly
- Abnormally large tongue
- Benign eye tumor
- Big calvaria
- Conjunctival hamartoma
- Open bite
- Abnormal facial shape
- Adenoma sebaceum
Még 24 tulajdonság megjelenítése
- Big lower jaw
- Depressed nasal bridge
- Eye folds
- Grooved tongue
- High palate
- Large forehead
- Midface retrusion
- Prominent forehead
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Frontal bossing
- High, narrow palate
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Narrow mouth
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Short chin
- Short nose
- Wide nose
- Broad forehead
- Decreased size of maxilla
- Decreased width of the skull
- Progressively abnormally enlarging cranium
Abnormality of the nervous system
- Autism
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Oligodendroglioma
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cranial nerve paralysis
- Enlarged cerebellum
- Epilepsy
Még 23 tulajdonság megjelenítése
- Headache
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Rise in pressure inside skull
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Cognitive impairment
- Communicating hydrocephalus
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Motor delay
- Short attention span
- Speech apraxia
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of the cerebellum
- Delayed motor skills
- Hemangioblastoma
- Intellectual disability, mild
- Paralysis or weakness of one side of body
- Tumors of the central nervous system
- Attention deficit
- Dysplastic gangliocytoma of the cerebellum
- Hemimegalencephaly
- Intention tremor
Abnormality of the cardiovascular system
- Arteriovenous malformation
- Lymphangioma
- Poorly functioning veins
- Strawberry birthmark
- Strawberry mark
- Visceral angiomatosis
- Collection of dilated blood vessels that forms mass
- Dilation of Virchow-Robin spaces
Még 12 tulajdonság megjelenítése
- Mucosal telangiectasiae
- Abnormality of the heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Angina pectoris
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
- Cardiac failure
- Cutis marmorata
- Enlarged thymus
- Increased spleen size
- Patent ductus arteriosus
- Spider veins
- Abnormality of the vasculature
Abnormality of the musculoskeletal system
- Bone overgrowth
- Fatty lump
- Double-Jointed
- Formation of new noncancerous bone on top of existing bone
- Funnel chest
- Low muscle tone
- Low solidness and mass of the bones
- Scoliosis
Még 12 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the endocrine system
- Enlarged thyroid gland in neck
- Abnormality of the parathyroid gland
- Abnormality of the thyroid gland
- Neoplasm of the thyroid gland
- Follicular thyroid carcinoma
- Hashimoto thyroiditis
- Neoplasm of the adrenal cortex
- Thyroid carcinoma
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Gastrointestinal bleeding
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Black feces
- Bleeding below the skin
- Bleeding tendency
- Rectal bleeding
- Refractory anemia
- Bleeding within the skull
Még 3 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PTEN gén: phosphatase and tensin homolog. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pten
Dante Labs. PTEN gén: phosphatase and tensin homolog [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pten
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt