Geeni
TRIM28
tripartite motif containing 28
- HGNC 16384↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000130726↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 10155↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 19q13.43
- Koordinaatit
- Kromosomi 19: 58 544 064–58 550 715 (GRCh38)
- Eksonit
- 17 eksonia 6,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 835 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- TIF1B, KAP1, TF1B, RNF96, PPP1R157, KAP-1, TIF1-beta, TIF1beta
- MANE Select -transkripti
- ENST00000253024.10NM_005762.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue TRIM28 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Munuaissyöpä
Munuaisen ensisijainen tai etäpesäkkeinen pahanlaatuinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Virtsateiden ja munuaisten kasvain
- Virtsaelimistön kasvain
Virtsaelimistöön liittyvä hyvänlaatuinen tai pahanlaatuinen, ensisijainen tai etäpesäkkeinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
TRIM28-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 6,7 kb:stä; 2 508 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä TRIM28
4
TRIM28-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 6,7 kb geenistä TRIM28, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,4 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Yhteisiä sairauksia: 2
- FLCNfolliculinYhteisiä sairauksia: 2
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
- PAX6paired box 6Yhteisiä sairauksia: 2
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BYhteisiä sairauksia: 2
- TP53tumor protein p53Yhteisiä sairauksia: 2
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorYhteisiä sairauksia: 2
- RETret proto-oncogeneYhteinen sairaus: 1
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AYhteinen sairaus: 1
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin TRIM28 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita TRIM28 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). TRIM28-geeni: tripartite motif containing 28. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/trim28
Dante Labs. TRIM28-geeni: tripartite motif containing 28 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/trim28
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa