Geeni
VHL
von Hippel-Lindau tumor suppressor
- HGNC 12687↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000134086↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 7428↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3p25.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 10 141 778–10 153 667 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 11,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 213 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- VHL1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000256474.3NM_000551.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue VHL ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Perinnöllinen feokromosytooma ja paragangliooma
- Perinnöllinen feokromosytoomaAutosomaalinen dominantti
Perinnöllinen alttius lisämunuaisytimen katekoliamiineja tuottaville kasvaimille.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Biokemiallinen seulonta ja kuvantaminen mahdollistavat kasvainten löytämisen ja poistamisen varhaisessa vaiheessa.
Munuaissyöpä
Munuaisen ensisijainen tai etäpesäkkeinen pahanlaatuinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Polysytemia
- Tšuvassin polysytemiaAutosomaalinen resessiivinen
Tšuvassin erytrosytoosi on harvinainen, geneettinen, synnynnäinen toissijainen polysytemiaa aiheuttava sairaus. Sitä luonnehtii kohonnut hemoglobiini-, hematokriitti- ja seerumin erytropoietiinipitoisuus sekä normaali hapen affiniteetti. Oireina ilmenee yleensä päänsärkyä, huimausta, hengenahdistusta ja/tai kasvojen punoitusta. Potilailla on kohonnut verenvuodon, tromboosin ja varhaisen kuoleman riski.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Virtsateiden ja munuaisten kasvain
- Virtsaelimistön kasvain
Virtsaelimistöön liittyvä hyvänlaatuinen tai pahanlaatuinen, ensisijainen tai etäpesäkkeinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Von Hippel-Lindaun tauti
- Autosomaalinen dominantti
VHL-geeniin liittyvä kasvainalttiusoireyhtymä, johon kuuluvat hemangioblastoomat, munuaisen solukarsinooma, feokromosytooma ja haiman neuroendokriiniset kasvaimet.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Elinikäinen usean elimen seuranta, munuaisia säästävä leikkaus, belzutifani (HIF-2α:n estäjä), kaskadiseulonta, synnytystä edeltävä neuvonta
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
VHL-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,4 kb geenin 11,9 kb:stä; 642 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä VHL
251
VHL-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 3 (1,2 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (3 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Kokogenomi kattaa kaikki 11,9 kb geenistä VHL, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 4,4 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (129)
Tässä ovat VHL-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| c.341-2A>G | Introni 1 | 10 146 512 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.463+1G>A | Introni 2 | 10 146 637 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| E70X | c.208G>T | Eksoni 1 | 10 142 055 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| E160Sfs*10 | c.477del | Eksoni 3 | 10 149 797 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| F136Lfs*23 | c.408del | Eksoni 2 | 10 146 578 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| K196X | c.586A>T | Eksoni 3 | 10 149 909 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| N78S | c.233A>G | Eksoni 1 | 10 142 080 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| N141Kfs*3 | c.422dup | Eksoni 2 | 10 146 593 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| P86L | c.257C>T | Eksoni 1 | 10 142 104 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| Q195X | c.583C>T | Eksoni 3 | 10 149 906 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BYhteisiä sairauksia: 3
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Yhteisiä sairauksia: 2
- FLCNfolliculinYhteisiä sairauksia: 2
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
- PAX6paired box 6Yhteisiä sairauksia: 2
- RETret proto-oncogeneYhteisiä sairauksia: 2
- TP53tumor protein p53Yhteisiä sairauksia: 2
- TRIM28tripartite motif containing 28Yhteisiä sairauksia: 2
- MAXMYC associated transcriptional regulator XYhteinen sairaus: 1
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AYhteinen sairaus: 1
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin VHL liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita VHL voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the cardiovascular system
- Increased blood pressure in blood vessels of lungs
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
Näytä 18 piirrettä lisää
- Sinus tachycardia
- Abnormal heart rate
- Abnormal left ventricular function
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Disease of the heart muscle
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Stroke
- Heart attack
- Elevated heart rate
- Hepatic hemangioma
- Intermittent high blood pressure
- Low blood pressure
- Narrowing of kidney artery
- Pulmonary capillary hemangiomatosis
- Strawberry mark
- Varicose veins
Abnormality of the nervous system
- Headache
- Cerebellar hemangioblastoma
- Episodic paroxysmal anxiety
- Recurrent paroxysmal headache
- Anxiety
- Cranial nerve compression
- Inability to move vocal cords
- Panic attack
Näytä 3 piirrettä lisää
Laboratory abnormality
- Elevated urinary catecholamines
- Elevated urinary dopamine
- Elevated urinary epinephrine level
- Elevated urinary norepinephrine level
- High blood calcium levels
- High urine protein levels
- Blood in urine
- Elevated calcitonin
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). VHL-geeni: von Hippel-Lindau tumor suppressor. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vhl
Dante Labs. VHL-geeni: von Hippel-Lindau tumor suppressor [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vhl
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa