Geeni
SDHB
succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B
- HGNC 10681↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000117118↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6390↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1p36.13
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 17 018 722–17 054 032 (GRCh38)
- Eksonit
- 8 eksonia 35,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 280 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Aiemmat symbolit
- SDH1, SDH
- MANE Select -transkripti
- ENST00000375499.8NM_003000.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SDHB ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Perinnöllinen feokromosytooma ja paragangliooma
- Carney-Stratakisin oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
Paragangliooman ja maha-suolikanavan stroomakasvaimen (GIST) yhdistelmä, jonka aiheuttavat variantit geeneissä SDH.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Seuranta kattaa sekä paragangliooma- että maha-suolikanavan stroomakasvaimet.
- Perinnöllinen feokromosytoomaAutosomaalinen dominantti
Perinnöllinen alttius lisämunuaisytimen katekoliamiineja tuottaville kasvaimille.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Biokemiallinen seulonta ja kuvantaminen mahdollistavat kasvainten löytämisen ja poistamisen varhaisessa vaiheessa.
- Perinnöllinen feokromosytooma-paraganglioomaAutosomaalinen dominantti
Oireyhmä (PPGL-tyypit 1–7, TMEM127- ja MAX-liittyvät), jossa SDHB-, SDHD-, SDHC-, SDHA-, SDHAF2-, MAX- tai TMEM127-geenin variantit lisäävät feokromosytooman ja paragangliooman riskiä.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Mitä tieto muuttaa
Säännöllinen metanefriinien seulonta veri- tai virtsanäytteestä sekä ajoittainen koko kehon MRI-tutkimus auttavat löytämään kasvaimet varhain, ennen kuin ne aiheuttavat verenpainekriisejä. Sukulaisille voidaan tarjota testausta.
Munuaissyöpä
Munuaisen ensisijainen tai etäpesäkkeinen pahanlaatuinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Pahanlaatuinen endokriininen kasvain
- Paragangliooma 4Autosomaalinen dominantti
Mikä tahansa paragangliooma, jonka sairauden aiheuttaa SDHB-geenin mutaatio.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Virtsateiden ja munuaisten kasvain
- Virtsaelimistön kasvain
Virtsaelimistöön liittyvä hyvänlaatuinen tai pahanlaatuinen, ensisijainen tai etäpesäkkeinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
SDHB-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 1 kb geenin 35,3 kb:stä; 843 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SDHB
235
SDHB-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 35,3 kb geenistä SDHB, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 1 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (87)
Tässä ovat SDHB-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A15Hfs*4 | c.42_43insCACTCTCCTTGAGGCGCCGGTTGCCG | Eksoni 1 | 17 053 977 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| A15Sfs*3 | c.19_41dup | Eksoni 1 | 17 053 978 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| A25Gfs*38 | c.71dup | Eksoni 1 | 17 053 948 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
| c.1A>G | Eksoni 1 | 17 054 019 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.3G>A | Eksoni 1 | 17 054 017 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.72+1G>T | Introni 1 | 17 053 947 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.73-2A>C | Introni 1 | 17 044 890 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.73-2A>T | Introni 1 | 17 044 890 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.200+1G>A | Introni 2 | 17 044 760 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja | |
| c.201-2A>C | Introni 2 | 17 033 147 | Patogeeninen | ★★★★2 tähteä neljästä kriteerit annettu, useita lähettäjiä, ei ristiriitoja |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- SDHDsuccinate dehydrogenase complex subunit DYhteisiä sairauksia: 3
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorYhteisiä sairauksia: 3
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Yhteisiä sairauksia: 2
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Yhteisiä sairauksia: 2
- FLCNfolliculinYhteisiä sairauksia: 2
- MAXMYC associated transcriptional regulator XYhteisiä sairauksia: 2
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
- PAX6paired box 6Yhteisiä sairauksia: 2
- RETret proto-oncogeneYhteisiä sairauksia: 2
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AYhteisiä sairauksia: 2
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Yhteisiä sairauksia: 2
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin SDHB liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SDHB voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to stand
- Delayed ability to walk
- Elevated brain lactate level by MRS
- Falls
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Irritability
- Leukodystrophy
Näytä 29 piirrettä lisää
- Loss of developmental milestones
- Ataxia
- Babinski sign
- Brisk knee jerk
- Cranial nerve paralysis
- Dystonia
- Episodic paroxysmal anxiety
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Motor delay
- Progressive degeneration of movement
- Progressive psychomotor deterioration
- Recurrent paroxysmal headache
- Upper limb hyperreflexia
- Cancer of early nerve cells
- Communication delay
- Cranial nerve compression
- Delayed ability to sit
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal myoclonic seizure
- Headache
- Inability to move vocal cords
- Moderate global developmental delay
- Panic attack
- Tremor
- Dementia
- Loss of ability to walk
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal left ventricular function
- Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Elevated heart rate
- Enlarged and thickened heart muscle
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
Näytä 16 piirrettä lisää
- Hypertensive retinopathy
- Left ventricular hypertrophy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Abnormal atrioventricular conduction
- Abnormal heart rate
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Disease of the heart muscle
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Noncompaction cardiomyopathy
- Swollen lymph nodes
- Hives
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased urine alpha-ketoglutarate concentration
- Elevated urinary dopamine
- Elevated urinary epinephrine level
- Elevated urinary norepinephrine level
- High blood calcium levels
- High urine protein levels
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the endocrine system
- Adrenal pheochromocytoma
- Extraadrenal pheochromocytoma
- Paraganglioma
- Pheochromocytoma
- Adrenal overactivity
- Adrenocortical adenoma
- Paraganglioma of head and neck
- Chemodectoma
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SDHB-geeni: succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/sdhb
Dante Labs. SDHB-geeni: succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/sdhb
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa