Geeni
BAP1
BRCA1 associated deubiquitinase 1
- HGNC 950↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000163930↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 8314↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 3p21.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 3: 52 401 008–52 410 008 (GRCh38)
- Eksonit
- 17 eksonia 9 kb:n alueella
- Proteiini
- 729 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- hucep-6, KIAA0272, UCHL2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000460680.6NM_004656.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue BAP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
BAP1-kasvainalttiusoireyhtymä
- Autosomaalinen dominantti
BAP1-variantit, jotka lisäävät riskiä sairastua uveaaliseen ja ihomelanoomaan, mesotelioomaan, munuaissolusyöpään ja muihin kasvaimiin.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Silmän, ihon ja munuaisten vuotuisia tarkastuksia suositellaan, ja asbestialtistumista kannattaa välttää. Sukulaisille voidaan tarjota testausta.
Munuaissyöpä
Munuaisen ensisijainen tai etäpesäkkeinen pahanlaatuinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Virtsateiden ja munuaisten kasvain
- Virtsaelimistön kasvain
Virtsaelimistöön liittyvä hyvänlaatuinen tai pahanlaatuinen, ensisijainen tai etäpesäkkeinen kasvain.
- 1 GenCC-arvioija arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
BAP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,6 kb geenin 9 kb:stä; 2 190 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä BAP1
359
BAP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 9 kb geenistä BAP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Yhteisiä sairauksia: 2
- FLCNfolliculinYhteisiä sairauksia: 2
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
- PAX6paired box 6Yhteisiä sairauksia: 2
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BYhteisiä sairauksia: 2
- TP53tumor protein p53Yhteisiä sairauksia: 2
- TRIM28tripartite motif containing 28Yhteisiä sairauksia: 2
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorYhteisiä sairauksia: 2
- RETret proto-oncogeneYhteinen sairaus: 1
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AYhteinen sairaus: 1
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin BAP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita BAP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intracranial meningioma
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
- Attention deficit
- Epilepsy
- Focal T2 hypointense thalamic lesion
- Headache
Näytä 26 piirrettä lisää
- Motor delay
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal central motor function
- Abnormal central sensory function
- Abnormal gait
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of the cerebellum
- Ataxia
- Autism spectrum disorder
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Fourth cranial nerve palsy
- Memory impairment
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Rise in pressure inside skull
- Spinal meningioma
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Trigeminal neuralgia
- Weakness of one side of body
- Abnormal speech pattern
- Brain stem compression
- Can't control feelings
- Excessive daytime sleepiness
- Spasms on one side of the face
- Transient global amnesia
- Intellectual disability
Abnormality of the endocrine system
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating prolactin concentration
- Low blood cortisol level
Näytä 8 piirrettä lisää
Abnormality of the integument
- Mole
- Abnormality of the hair
- Dry skin
- Freckling
- Cutaneous melanoma
- Excessive hair growth
- Hair loss
- Neurofibroma
Näytä 2 piirrettä lisää
Abnormality of the respiratory system
- Abnormal pleura morphology
- Breathing difficulties
- Breathing difficulty
- Cough
- Abnormality of lung structure
- Functional respiratory abnormality
- Lung adenocarcinoma
- Abnormality on pulmonary function testing
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). BAP1-geeni: BRCA1 associated deubiquitinase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/bap1
Dante Labs. BAP1-geeni: BRCA1 associated deubiquitinase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/bap1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa