Gen
ASXL1
ASXL transcriptional regulator 1
- HGNC 18318↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000171456↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 171023↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 20q11.21
- Souřadnice
- Chromozom 20: 32 358 331–32 439 319 (GRCh38)
- Exony
- 13 exonů na 81 kb
- Protein
- 1 541 aminokyselin
- Další názvy
- KIAA0978
- Transkript MANE Select
- ENST00000375687.10NM_015338.6
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/asxl1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si ASXL1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 6 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je ASXL1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 7,1 kb z 81 kb genu; 4 626 těchto bází kódují protein.
Sekvenování ASXL1
70
pozic v ASXL1, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 81 kb genu ASXL1, včetně intronů, nikoli jen 7,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADKadenosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxSdílí 1 onemocnění
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Sdílí 1 onemocnění
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Sdílí 1 onemocnění
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ANK3ankyrin 3Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s ASXL1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ASXL1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Facial hemangioma
- Triangular head shape
- Wide gum ridges
- Decreased facial muscle tone
- Depressed nasal bridge
- Full cheeks
- Low frontal hairline
Zobrazit ještě 20 rysů
- Monobrow
- Nasal tip, upturned
- Prominent metopic ridge
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Cleft lip
- Cleft palate
- Dandy-Walker malformation
- Eye folds
- Little lower jaw
- Narrow mouth
- One sided cleft palate
- Prominent palatine ridges
- Receding chin
- Right and left cleft palate
- Cleft upper lip
- Long face
- Narrow forehead
- Narrow palate
- Prominent forehead
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Abnormal mast cell morphology
- Blood tumor
- Myeloid leukemia
- Bone marrow hypercellularity
- Elevated white blood count
- High blood eosinophil count
- Increased CD25+ mast cell proportion
- Low platelet count
Zobrazit ještě 17 rysů
- Myeloproliferative disorder
- Normochromic anemia
- Normocytic anemia
- Acute myeloid leukemia
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Chronic myelomonocytic leukemia
- Gastrointestinal bleeding
- Granulocytic hyperplasia
- Increased blood neutrophil counts
- Increased total basophil count
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Myelodysplasia
- Chronic lymphatic leukemia
- Multiple myeloma
Abnormality of the nervous system
- IQ less than 20
- Neurodevelopmental delay
- Agenesis of corpus callosum
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Happy demeanor
- Headache
- Inability to walk
Zobrazit ještě 11 rysů
Abnormality of the integument
- Excessive hair growth
- port-wine stain
- Flushing
- Itching
- Paleness
- Port-wine stain on eyelid
- Spinal dimple
- Abnormal blistering of the skin
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Close sighted
- Cross-eyed
- Notched pupil
- Optic atrophy
- Retinal atrophy
- Wide-set eyes
- Severe near sightedness
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ASXL1: ASXL transcriptional regulator 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/asxl1
Dante Labs. Gen ASXL1: ASXL transcriptional regulator 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/asxl1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů