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Gène

HSPG2

heparan sulfate proteoglycan 2

Résumé

Localisation cytogénétique
1p36.12
Coordonnées
Chromosome 1 : 21 822 244–21 937 310 (GRCh38)
Exons
97 exons sur 115,1 kb
Protéine
4 391 acides aminés
Aussi appelé
perlecan, PRCAN
Symboles précédents
SJS1
Transcrit MANE Select
ENST00000374695.8NM_005529.7
Type de locus
gene with protein product

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HSPG2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HSPG2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de HSPG2. HSPG2 et 11 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 21 379 777 à 22 379 776.Chromosome 11p36.12p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4421,4 Mb21,6 Mb21,8 Mb22 Mb22,2 MbNBPF3 : 21 439 853–21 485 005, brin directNBPF3ALPL : 21 508 813–21 579 441, brin directALPL : 21 547 404–21 554 002, brin directRAP1GAP : 21 596 215–21 669 846, brin inverseRAP1GAPUSP48 : 21 675 521–21 783 618, brin inverseUSP48LDLRAD2 : 21 812 265–21 825 225, brin directLDLRAD2HSPG2 : 21 822 244–21 937 310, brin inverseHSPG2CELA3B : 21 977 022–21 998 642, brin directCELA3BCELA3A : 22 001 657–22 012 542, brin directCELA3A : 22 025 142–22 092 943, brin directCDC42 : 22 052 627–22 101 360, brin directCDC42WNT4 : 22 117 313–22 143 969, brin inverseWNT4Schéma de HSPG2 : 97 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 97 : 1 site connu associé à une maladieExon 86 : 1 site connu associé à une maladieExon 79 : 1 site connu associé à une maladieExon 74 : 2 sites connus associés à une maladieExon 68 : 1 site connu associé à une maladieExon 50 : 1 site connu associé à une maladieExon 49 : 1 site connu associé à une maladieExon 43 : 1 site connu associé à une maladieExon 42 : 1 site connu associé à une maladieExon 41 : 1 site connu associé à une maladieExon 33 : 1 site connu associé à une maladieExon 32 : 1 site connu associé à une maladieExon 27 : 1 site connu associé à une maladieExon 25 : 1 site connu associé à une maladieExon 22 : 1 site connu associé à une maladieExon 15 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 2 sites connus associés à une maladieExon 10 : 2 sites connus associés à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 1 site connu associé à une maladieExon 97 : 21 822 244–21 823 488, 1 245 basesExon 96 : 21 823 616–21 823 719, 104 basesExon 95 : 21 824 121–21 824 204, 84 basesExon 94 : 21 824 306–21 824 376, 71 basesExon 93 : 21 824 537–21 824 615, 79 basesExon 92 : 21 824 704–21 824 779, 76 basesExon 91 : 21 827 863–21 827 919, 57 basesExon 90 : 21 828 030–21 828 152, 123 basesExon 89 : 21 828 255–21 828 426, 172 basesExon 88 : 21 828 835–21 829 079, 245 basesExon 87 : 21 829 383–21 829 604, 222 basesExon 86 : 21 829 993–21 830 091, 99 basesExon 85 : 21 830 982–21 831 090, 109 basesExon 84 : 21 831 215–21 831 324, 110 basesExon 83 : 21 831 463–21 831 562, 100 basesExon 82 : 21 831 652–21 831 796, 145 basesExon 81 : 21 832 495–21 832 606, 112 basesExon 80 : 21 833 268–21 833 384, 117 basesExon 79 : 21 833 467–21 833 614, 148 basesExon 78 : 21 833 816–21 833 925, 110 basesExon 77 : 21 834 679–21 834 945, 267 basesExon 76 : 21 835 540–21 835 637, 98 basesExon 75 : 21 836 802–21 837 006, 205 basesExon 74 : 21 838 825–21 839 085, 261 basesExon 73 : 21 839 371–21 839 550, 180 basesExon 72 : 21 839 822–21 840 017, 196 basesExon 71 : 21 841 101–21 841 285, 185 basesExon 70 : 21 841 539–21 841 673, 135 basesExon 69 : 21 842 002–21 842 142, 141 basesExon 68 : 21 842 239–21 842 380, 142 basesExon 67 : 21 842 770–21 842 921, 152 basesExon 66 : 21 843 297–21 843 438, 142 basesExon 65 : 21 844 148–21 844 299, 152 basesExon 64 : 21 846 108–21 846 255, 148 basesExon 63 : 21 846 448–21 846 599, 152 basesExon 62 : 21 847 354–21 847 492, 139 basesExon 61 : 21 847 689–21 847 840, 152 basesExon 60 : 21 847 958–21 848 093, 136 basesExon 59 : 21 848 643–21 848 794, 152 basesExon 58 : 21 848 893–21 849 031, 139 basesExon 57 : 21 850 041–21 850 192, 152 basesExon 56 : 21 850 363–21 850 498, 136 basesExon 55 : 21 851 546–21 851 697, 152 basesExon 54 : 21 851 791–21 851 926, 136 basesExon 53 : 21 852 088–21 852 233, 146 basesExon 52 : 21 852 700–21 852 832, 133 basesExon 51 : 21 852 919–21 853 070, 152 basesExon 50 : 21 854 193–21 854 343, 151 basesExon 49 : 21 854 611–21 854 765, 155 basesExon 48 : 21 854 848–21 854 983, 136 basesExon 47 : 21 855 304–21 855 446, 143 basesExon 46 : 21 855 523–21 855 675, 153 basesExon 45 : 21 855 787–21 855 912, 126 basesExon 44 : 21 857 015–21 857 195, 181 basesExon 43 : 21 857 285–21 857 385, 101 basesExon 42 : 21 859 566–21 859 676, 111 basesExon 41 : 21 859 835–21 860 002, 168 basesExon 40 : 21 860 177–21 860 235, 59 basesExon 39 : 21 861 757–21 861 843, 87 basesExon 38 : 21 861 988–21 862 115, 128 basesExon 37 : 21 864 100–21 864 213, 114 basesExon 36 : 21 864 843–21 865 073, 231 basesExon 35 : 21 865 285–21 865 365, 81 basesExon 34 : 21 865 717–21 865 809, 93 basesExon 33 : 21 872 186–21 872 377, 192 basesExon 32 : 21 872 620–21 872 760, 141 basesExon 31 : 21 872 997–21 873 091, 95 basesExon 30 : 21 873 375–21 873 424, 50 basesExon 29 : 21 873 925–21 874 011, 87 basesExon 28 : 21 874 406–21 874 533, 128 basesExon 27 : 21 874 616–21 874 729, 114 basesExon 26 : 21 874 891–21 875 002, 112 basesExon 25 : 21 875 629–21 875 747, 119 basesExon 24 : 21 875 863–21 876 042, 180 basesExon 23 : 21 876 229–21 876 405, 177 basesExon 22 : 21 876 512–21 876 652, 141 basesExon 21 : 21 878 186–21 878 253, 68 basesExon 20 : 21 878 433–21 878 491, 59 basesExon 19 : 21 878 577–21 878 663, 87 basesExon 18 : 21 878 994–21 879 121, 128 basesExon 17 : 21 880 107–21 880 254, 148 basesExon 16 : 21 880 363–21 880 559, 197 basesExon 15 : 21 880 656–21 880 835, 180 basesExon 14 : 21 881 339–21 881 502, 164 basesExon 13 : 21 884 528–21 884 674, 147 basesExon 12 : 21 884 767–21 884 918, 152 basesExon 11 : 21 885 013–21 885 157, 145 basesExon 10 : 21 885 320–21 885 451, 132 basesExon 9 : 21 887 215–21 887 334, 120 basesExon 8 : 21 887 420–21 887 674, 255 basesExon 7 : 21 887 938–21 888 066, 129 basesExon 6 : 21 889 981–21 890 141, 161 basesExon 5 : 21 890 427–21 890 485, 59 basesExon 4 : 21 890 585–21 890 694, 110 basesExon 3 : 21 895 922–21 895 966, 45 basesExon 2 : 21 896 175–21 896 310, 136 basesExon 1 : 21 937 155–21 937 310, 156 bases9790807060504030201015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 14,3 kb sur les 115,1 kb du gène ; 13 176 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HSPG2

40

positions dans HSPG2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 115,1 kb de HSPG2, introns compris, et pas seulement les 14,3 kb d'exons.

Traits associés à HSPG2

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que HSPG2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Abnormality of the musculoskeletal system

Afficher 43 traits supplémentaires

Abnormality of head or neck

Afficher 34 traits supplémentaires

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HSPG2 : heparan sulfate proteoglycan 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hspg2

Vancouver

Dante Labs. Gène HSPG2 : heparan sulfate proteoglycan 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hspg2

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