Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

HSPG2

heparan sulfate proteoglycan 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p36.12
Koordinaadid
Kromosoom 1: 21 822 244–21 937 310 (GRCh38)
Eksonid
97 eksonit, ulatus 115,1 kb
Valk
4391 aminohapet
Tuntud ka kui
perlecan, PRCAN
Varasemad tähised
SJS1
MANE Select transkript
ENST00000374695.8NM_005529.7
Lookuse tüüp
gene with protein product

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HSPG2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HSPG2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub HSPG2. HSPG2 ja sellele lähedal asuvad 11 geeni kromosoomil 1, vahemikus 21 379 777 kuni 22 379 776.Kromosoom 11p36.12p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4421,4 Mb21,6 Mb21,8 Mb22 Mb22,2 MbNBPF3: 21 439 853–21 485 005, otsene ahelNBPF3ALPL: 21 508 813–21 579 441, otsene ahelALPL: 21 547 404–21 554 002, otsene ahelRAP1GAP: 21 596 215–21 669 846, pöördne ahelRAP1GAPUSP48: 21 675 521–21 783 618, pöördne ahelUSP48LDLRAD2: 21 812 265–21 825 225, otsene ahelLDLRAD2HSPG2: 21 822 244–21 937 310, pöördne ahelHSPG2CELA3B: 21 977 022–21 998 642, otsene ahelCELA3BCELA3A: 22 001 657–22 012 542, otsene ahelCELA3A: 22 025 142–22 092 943, otsene ahelCDC42: 22 052 627–22 101 360, otsene ahelCDC42WNT4: 22 117 313–22 143 969, pöördne ahelWNT4HSPG2 skeem: 97 eksonit kromosoomi 1 pöördne ahelalEkson 97: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 86: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 79: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 74: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 68: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 50: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 49: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 43: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 42: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 41: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 33: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 32: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 27: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 25: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 22: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 11: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 10: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 8: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 97: 21 822 244–21 823 488, 1245 alustEkson 96: 21 823 616–21 823 719, 104 alustEkson 95: 21 824 121–21 824 204, 84 alustEkson 94: 21 824 306–21 824 376, 71 alustEkson 93: 21 824 537–21 824 615, 79 alustEkson 92: 21 824 704–21 824 779, 76 alustEkson 91: 21 827 863–21 827 919, 57 alustEkson 90: 21 828 030–21 828 152, 123 alustEkson 89: 21 828 255–21 828 426, 172 alustEkson 88: 21 828 835–21 829 079, 245 alustEkson 87: 21 829 383–21 829 604, 222 alustEkson 86: 21 829 993–21 830 091, 99 alustEkson 85: 21 830 982–21 831 090, 109 alustEkson 84: 21 831 215–21 831 324, 110 alustEkson 83: 21 831 463–21 831 562, 100 alustEkson 82: 21 831 652–21 831 796, 145 alustEkson 81: 21 832 495–21 832 606, 112 alustEkson 80: 21 833 268–21 833 384, 117 alustEkson 79: 21 833 467–21 833 614, 148 alustEkson 78: 21 833 816–21 833 925, 110 alustEkson 77: 21 834 679–21 834 945, 267 alustEkson 76: 21 835 540–21 835 637, 98 alustEkson 75: 21 836 802–21 837 006, 205 alustEkson 74: 21 838 825–21 839 085, 261 alustEkson 73: 21 839 371–21 839 550, 180 alustEkson 72: 21 839 822–21 840 017, 196 alustEkson 71: 21 841 101–21 841 285, 185 alustEkson 70: 21 841 539–21 841 673, 135 alustEkson 69: 21 842 002–21 842 142, 141 alustEkson 68: 21 842 239–21 842 380, 142 alustEkson 67: 21 842 770–21 842 921, 152 alustEkson 66: 21 843 297–21 843 438, 142 alustEkson 65: 21 844 148–21 844 299, 152 alustEkson 64: 21 846 108–21 846 255, 148 alustEkson 63: 21 846 448–21 846 599, 152 alustEkson 62: 21 847 354–21 847 492, 139 alustEkson 61: 21 847 689–21 847 840, 152 alustEkson 60: 21 847 958–21 848 093, 136 alustEkson 59: 21 848 643–21 848 794, 152 alustEkson 58: 21 848 893–21 849 031, 139 alustEkson 57: 21 850 041–21 850 192, 152 alustEkson 56: 21 850 363–21 850 498, 136 alustEkson 55: 21 851 546–21 851 697, 152 alustEkson 54: 21 851 791–21 851 926, 136 alustEkson 53: 21 852 088–21 852 233, 146 alustEkson 52: 21 852 700–21 852 832, 133 alustEkson 51: 21 852 919–21 853 070, 152 alustEkson 50: 21 854 193–21 854 343, 151 alustEkson 49: 21 854 611–21 854 765, 155 alustEkson 48: 21 854 848–21 854 983, 136 alustEkson 47: 21 855 304–21 855 446, 143 alustEkson 46: 21 855 523–21 855 675, 153 alustEkson 45: 21 855 787–21 855 912, 126 alustEkson 44: 21 857 015–21 857 195, 181 alustEkson 43: 21 857 285–21 857 385, 101 alustEkson 42: 21 859 566–21 859 676, 111 alustEkson 41: 21 859 835–21 860 002, 168 alustEkson 40: 21 860 177–21 860 235, 59 alustEkson 39: 21 861 757–21 861 843, 87 alustEkson 38: 21 861 988–21 862 115, 128 alustEkson 37: 21 864 100–21 864 213, 114 alustEkson 36: 21 864 843–21 865 073, 231 alustEkson 35: 21 865 285–21 865 365, 81 alustEkson 34: 21 865 717–21 865 809, 93 alustEkson 33: 21 872 186–21 872 377, 192 alustEkson 32: 21 872 620–21 872 760, 141 alustEkson 31: 21 872 997–21 873 091, 95 alustEkson 30: 21 873 375–21 873 424, 50 alustEkson 29: 21 873 925–21 874 011, 87 alustEkson 28: 21 874 406–21 874 533, 128 alustEkson 27: 21 874 616–21 874 729, 114 alustEkson 26: 21 874 891–21 875 002, 112 alustEkson 25: 21 875 629–21 875 747, 119 alustEkson 24: 21 875 863–21 876 042, 180 alustEkson 23: 21 876 229–21 876 405, 177 alustEkson 22: 21 876 512–21 876 652, 141 alustEkson 21: 21 878 186–21 878 253, 68 alustEkson 20: 21 878 433–21 878 491, 59 alustEkson 19: 21 878 577–21 878 663, 87 alustEkson 18: 21 878 994–21 879 121, 128 alustEkson 17: 21 880 107–21 880 254, 148 alustEkson 16: 21 880 363–21 880 559, 197 alustEkson 15: 21 880 656–21 880 835, 180 alustEkson 14: 21 881 339–21 881 502, 164 alustEkson 13: 21 884 528–21 884 674, 147 alustEkson 12: 21 884 767–21 884 918, 152 alustEkson 11: 21 885 013–21 885 157, 145 alustEkson 10: 21 885 320–21 885 451, 132 alustEkson 9: 21 887 215–21 887 334, 120 alustEkson 8: 21 887 420–21 887 674, 255 alustEkson 7: 21 887 938–21 888 066, 129 alustEkson 6: 21 889 981–21 890 141, 161 alustEkson 5: 21 890 427–21 890 485, 59 alustEkson 4: 21 890 585–21 890 694, 110 alustEkson 3: 21 895 922–21 895 966, 45 alustEkson 2: 21 896 175–21 896 310, 136 alustEkson 1: 21 937 155–21 937 310, 156 alust9790807060504030201015′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 14,3 kb kogupikkusega 115,1 kb; neist 13 176 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse HSPG2

40

kohad geenis HSPG2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HSPG2 115,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (14,3 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HSPG2 geen: heparan sulfate proteoglycan 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hspg2

Vancouver

Dante Labs. HSPG2 geen: heparan sulfate proteoglycan 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hspg2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test