Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

HSPG2

heparan sulfate proteoglycan 2

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
1p36.12
Koordinater
Kromosom 1: 21 822 244–21 937 310 (GRCh38)
Eksoner
97 eksoner over 115,1 kb
Protein
4 391 aminosyrer
Også kjent som
perlecan, PRCAN
Tidligere symboler
SJS1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000374695.8NM_005529.7
Lokustype
Protein-coding

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser HSPG2 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er HSPG2 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 1, med en parentes der HSPG2 står. HSPG2 og 11 gener i nærheten på kromosom 1, fra 21 379 777 til 22 379 776.Kromosom 11p36.12p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4421,4 Mb21,6 Mb21,8 Mb22 Mb22,2 MbNBPF3: 21 439 853–21 485 005, fremover-strengNBPF3ALPL: 21 508 813–21 579 441, fremover-strengALPL: 21 547 404–21 554 002, fremover-strengRAP1GAP: 21 596 215–21 669 846, bakover-strengRAP1GAPUSP48: 21 675 521–21 783 618, bakover-strengUSP48LDLRAD2: 21 812 265–21 825 225, fremover-strengLDLRAD2HSPG2: 21 822 244–21 937 310, bakover-strengHSPG2CELA3B: 21 977 022–21 998 642, fremover-strengCELA3BCELA3A: 22 001 657–22 012 542, fremover-strengCELA3A: 22 025 142–22 092 943, fremover-strengCDC42: 22 052 627–22 101 360, fremover-strengCDC42WNT4: 22 117 313–22 143 969, bakover-strengWNT4Diagram av HSPG2: 97 eksoner på bakover-strengen til kromosom 1Ekson 97: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 86: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 79: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 74: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 68: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 50: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 49: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 43: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 42: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 41: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 33: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 32: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 27: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 25: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 22: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 15: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 11: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 10: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 9: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 8: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 97: 21 822 244–21 823 488, 1 245 baserEkson 96: 21 823 616–21 823 719, 104 baserEkson 95: 21 824 121–21 824 204, 84 baserEkson 94: 21 824 306–21 824 376, 71 baserEkson 93: 21 824 537–21 824 615, 79 baserEkson 92: 21 824 704–21 824 779, 76 baserEkson 91: 21 827 863–21 827 919, 57 baserEkson 90: 21 828 030–21 828 152, 123 baserEkson 89: 21 828 255–21 828 426, 172 baserEkson 88: 21 828 835–21 829 079, 245 baserEkson 87: 21 829 383–21 829 604, 222 baserEkson 86: 21 829 993–21 830 091, 99 baserEkson 85: 21 830 982–21 831 090, 109 baserEkson 84: 21 831 215–21 831 324, 110 baserEkson 83: 21 831 463–21 831 562, 100 baserEkson 82: 21 831 652–21 831 796, 145 baserEkson 81: 21 832 495–21 832 606, 112 baserEkson 80: 21 833 268–21 833 384, 117 baserEkson 79: 21 833 467–21 833 614, 148 baserEkson 78: 21 833 816–21 833 925, 110 baserEkson 77: 21 834 679–21 834 945, 267 baserEkson 76: 21 835 540–21 835 637, 98 baserEkson 75: 21 836 802–21 837 006, 205 baserEkson 74: 21 838 825–21 839 085, 261 baserEkson 73: 21 839 371–21 839 550, 180 baserEkson 72: 21 839 822–21 840 017, 196 baserEkson 71: 21 841 101–21 841 285, 185 baserEkson 70: 21 841 539–21 841 673, 135 baserEkson 69: 21 842 002–21 842 142, 141 baserEkson 68: 21 842 239–21 842 380, 142 baserEkson 67: 21 842 770–21 842 921, 152 baserEkson 66: 21 843 297–21 843 438, 142 baserEkson 65: 21 844 148–21 844 299, 152 baserEkson 64: 21 846 108–21 846 255, 148 baserEkson 63: 21 846 448–21 846 599, 152 baserEkson 62: 21 847 354–21 847 492, 139 baserEkson 61: 21 847 689–21 847 840, 152 baserEkson 60: 21 847 958–21 848 093, 136 baserEkson 59: 21 848 643–21 848 794, 152 baserEkson 58: 21 848 893–21 849 031, 139 baserEkson 57: 21 850 041–21 850 192, 152 baserEkson 56: 21 850 363–21 850 498, 136 baserEkson 55: 21 851 546–21 851 697, 152 baserEkson 54: 21 851 791–21 851 926, 136 baserEkson 53: 21 852 088–21 852 233, 146 baserEkson 52: 21 852 700–21 852 832, 133 baserEkson 51: 21 852 919–21 853 070, 152 baserEkson 50: 21 854 193–21 854 343, 151 baserEkson 49: 21 854 611–21 854 765, 155 baserEkson 48: 21 854 848–21 854 983, 136 baserEkson 47: 21 855 304–21 855 446, 143 baserEkson 46: 21 855 523–21 855 675, 153 baserEkson 45: 21 855 787–21 855 912, 126 baserEkson 44: 21 857 015–21 857 195, 181 baserEkson 43: 21 857 285–21 857 385, 101 baserEkson 42: 21 859 566–21 859 676, 111 baserEkson 41: 21 859 835–21 860 002, 168 baserEkson 40: 21 860 177–21 860 235, 59 baserEkson 39: 21 861 757–21 861 843, 87 baserEkson 38: 21 861 988–21 862 115, 128 baserEkson 37: 21 864 100–21 864 213, 114 baserEkson 36: 21 864 843–21 865 073, 231 baserEkson 35: 21 865 285–21 865 365, 81 baserEkson 34: 21 865 717–21 865 809, 93 baserEkson 33: 21 872 186–21 872 377, 192 baserEkson 32: 21 872 620–21 872 760, 141 baserEkson 31: 21 872 997–21 873 091, 95 baserEkson 30: 21 873 375–21 873 424, 50 baserEkson 29: 21 873 925–21 874 011, 87 baserEkson 28: 21 874 406–21 874 533, 128 baserEkson 27: 21 874 616–21 874 729, 114 baserEkson 26: 21 874 891–21 875 002, 112 baserEkson 25: 21 875 629–21 875 747, 119 baserEkson 24: 21 875 863–21 876 042, 180 baserEkson 23: 21 876 229–21 876 405, 177 baserEkson 22: 21 876 512–21 876 652, 141 baserEkson 21: 21 878 186–21 878 253, 68 baserEkson 20: 21 878 433–21 878 491, 59 baserEkson 19: 21 878 577–21 878 663, 87 baserEkson 18: 21 878 994–21 879 121, 128 baserEkson 17: 21 880 107–21 880 254, 148 baserEkson 16: 21 880 363–21 880 559, 197 baserEkson 15: 21 880 656–21 880 835, 180 baserEkson 14: 21 881 339–21 881 502, 164 baserEkson 13: 21 884 528–21 884 674, 147 baserEkson 12: 21 884 767–21 884 918, 152 baserEkson 11: 21 885 013–21 885 157, 145 baserEkson 10: 21 885 320–21 885 451, 132 baserEkson 9: 21 887 215–21 887 334, 120 baserEkson 8: 21 887 420–21 887 674, 255 baserEkson 7: 21 887 938–21 888 066, 129 baserEkson 6: 21 889 981–21 890 141, 161 baserEkson 5: 21 890 427–21 890 485, 59 baserEkson 4: 21 890 585–21 890 694, 110 baserEkson 3: 21 895 922–21 895 966, 45 baserEkson 2: 21 896 175–21 896 310, 136 baserEkson 1: 21 937 155–21 937 310, 156 baser9790807060504030201015′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 14,3 kb av genets 115,1 kb, og 13 176 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av HSPG2

40

posisjoner i HSPG2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.

En helgenomsekvensering dekker alle 115,1 kb av HSPG2, inkludert introner, ikke bare de 14,3 kb med eksoner.

Egenskaper knyttet til HSPG2

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene HSPG2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Abnormality of the musculoskeletal system

Vis 43 egenskaper til

Abnormality of head or neck

Vis 34 egenskaper til

Eksterne lenker

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.17-8666dff2.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). HSPG2-genet: heparan sulfate proteoglycan 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hspg2

Vancouver

Dante Labs. HSPG2-genet: heparan sulfate proteoglycan 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hspg2

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test