Gen
TBX1
T-box transcription factor 1
- HGNC 11592↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000184058↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6899↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 22q11.21
- Souřadnice
- Chromozom 22: 19 760 778–19 767 334 (GRCh38)
- Exony
- 7 exonů na 6,6 kb
- Protein
- 504 aminokyselin
- Další názvy
- CATCH22
- Předchozí symboly
- VCF
- Transkript MANE Select
- ENST00000649276.2NM_001379200.1
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tbx1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si TBX1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
22q11.2 Deletion Syndrome
- 22q11.2 deletion syndrome (DiGeorge / velocardiofacial syndrome)Autozomálně dominantní
A deletion of about 1.5 to 3 million bases on chromosome 22, including the TBX1 gene, that can cause congenital heart disease, low T-cell numbers, low calcium, palate differences and an increased risk of psychiatric conditions including schizophrenia.
- 3 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Established guidelines recommend calcium, immune, cardiac and mental-health monitoring, and each child of a carrier has a 50% chance of inheriting the deletion.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je TBX1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2 kb z 6,6 kb genu; 1 515 těchto bází kódují protein.
Sekvenování TBX1
34
pozic v TBX1, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 6,6 kb genu TBX1, včetně intronů, nikoli jen 2 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADAadenosine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AK2adenylate kinase 2Sdílí 1 onemocnění
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BSdílí 1 onemocnění
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Sdílí 1 onemocnění
- ATMATM serine/threonine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
- B2Mbeta-2-microglobulinSdílí 1 onemocnění
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Sdílí 1 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 1 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 1 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s TBX1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit TBX1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormal facial shape
- Abnormal of nasal shape
- Broad forehead
- Bulbous nose
- Cleft palate
- Corners of eye widely separated
- Eye folds
Zobrazit ještě 45 rysů
- Flattening of the skull base
- Prominent nasal bridge
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Abnormal dentition
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of the skull
- Decreased volume of lip
- Dental cavities
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Flat nose
- Flattened bony protrusion above eyes
- High forehead
- Long face
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Midface retrusion
- Narrow face
- Pit in front of the ear
- Short neck
- Submucous cleft hard palate
- Zygomatic flattening
- Abnormal tooth enamel
- Abnormally small head
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Drooling
- Little lower jaw
- Multiple suture craniosynostosis
- Narrow mouth
- Recurrent sinus disease
- Retinal arteriolar tortuosity
- Short philtrum
- Smooth philtrum
- Tall shaped head
- Wide nose
- Bifid uvula
- High palate
- High, narrow palate
- Narrow eyelid opening
- Narrow opening between the eyelids
- Open mouth
- Pierre-Robin sequence
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Underdeveloped tissue around nostril
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal aortic arch morphology
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal pulmonary valve morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Small thymus
- Tetralogy of Fallot
- Truncus arteriosus
Zobrazit ještě 19 rysů
- Abnormality of the tonsils
- Abnormal aortic valve morphology
- Absent/small thymus
- Double aortic arch
- Hypertensive crisis
- Increased spleen size
- Interrupted aortic arch
- Patent ductus arteriosus
- Pulmonary artery atresia
- Transposition of the great arteries
- Tricuspid atresia
- Underdeveloped left heart
- Varicose veins
- Abnormality of the thymus
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- Narrowing of aorta
- Retinal vascular tortuosity
- Right aortic arch with mirror image branching
Abnormality of the nervous system
- Difficulty finding words
- Intellectual disability
- Abnormal speech pattern
- Anxiety
- Attention deficit
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Global developmental delay
Zobrazit ještě 18 rysů
- Intellectual disability, mild
- Meningocele
- Specific learning disability
- Arrhinencephaly
- Autism
- Behavioral abnormality
- Bipolar disorder
- Depression
- Obsessive compulsive behavior
- Parkinsonism
- Repetitive movements
- Schizophrenia
- Split spine
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Weakness of one side of body
- Aggressive behavior
- Can't control feelings
- Paranoia
Abnormality of the digestive system
- Anorectal anomaly
- Constipation
- Absent anus
- Acid reflux
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Feeding difficulties in infancy
- Gallstones
- Inguinal hernia
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of limbs
- Curvature of little finger
- Short fingers or toes
- Long slender fingers
- Club feet
- Dislocated kneecap
- Duplication of bones of the toes
- Extra finger
- Talipes
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the ear
- Conductive deafness
- Low-set ears
- Chronic infections of the middle ear
- Hearing impairment
- Overfolded ears
- Recurrent middle ear infection
- Small earlobe
- Earlobe crease
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen TBX1: T-box transcription factor 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/tbx1
Dante Labs. Gen TBX1: T-box transcription factor 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/tbx1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů