Gen
BACH2
BACH transcriptional regulator 2
- HGNC 14078↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000112182↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 60468↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 6q15
- Souřadnice
- Chromozom 6: 89 926 528–90 296 843 (GRCh38)
- Exony
- 9 exonů na 370,3 kb
- Protein
- 841 aminokyselin
- Další názvy
- BTBD25
- Transkript MANE Select
- ENST00000257749.9NM_021813.4
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/bach2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si BACH2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
IPEX Syndrome and Other Tregopathies
- BACH2-related immunodeficiency (immunodeficiency 60)Autozomálně dominantní
Colitis, lymphoproliferation, low antibodies and infections caused by a single changed copy of BACH2.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- ClinGen hodnotí souvislost jako střední
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je BACH2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 9,2 kb z 370,3 kb genu; 2 526 těchto bází kódují protein.
Sekvenování BACH2
1Nízká
Jak obtížně se BACH2 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází BACH2 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.5,8 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.6,2 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADAadenosine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AK2adenylate kinase 2Sdílí 1 onemocnění
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BSdílí 1 onemocnění
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Sdílí 1 onemocnění
- ATMATM serine/threonine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
- B2Mbeta-2-microglobulinSdílí 1 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 1 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 1 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 1 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s BACH2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit BACH2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen BACH2: BACH transcriptional regulator 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/bach2
Dante Labs. Gen BACH2: BACH transcriptional regulator 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/bach2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů