Gen
TBX1
T-box transcription factor 1
- HGNC 11592↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000184058↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6899↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 22q11.21
- Koordinater
- Kromosom 22: 19 760 778–19 767 334 (GRCh38)
- Exoner
- 7 exoner på 6,6 kb
- Protein
- 504 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- CATCH22
- Tidigare symboler
- VCF
- MANE Select-transkript
- ENST00000649276.2NM_001379200.1
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs TBX1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
22q11.2-deletionssyndrom
- 22q11.2-deletionssyndrom (DiGeorge / velokardiofacialt syndrom)Autosomalt dominant
En deletion på cirka 1,5 till 3 miljoner baser på kromosom 22, som omfattar genen TBX1. Den kan orsaka medfött hjärtfel, lågt antal T-celler, lågt kalcium, skillnader i gommen och en ökad risk för psykiatriska tillstånd, inklusive schizofreni.
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Etablerade riktlinjer rekommenderar uppföljning av kalcium, immunsystem, hjärta och psykisk hälsa. Varje barn till en bärare har dessutom 50 % chans att ärva deletionen.
Bredare grupperingar
Andra medfödda immunbristsjukdomar
- Immunbristsjukdom
En av 170 gener kopplade till den
Sjukdom där det finns en brist eller defekt i immunförsvarets mekanismer, antingen cellulära eller humorala.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
HSCT vid SCID och allvarliga PID; immunglobulinersättning (IVIG/SCIG) vid antikroppsbrist; leniolisib (Joenja, FDA 2023) vid APDS; genterapi vid ADA-SCID; abatacept vid CTLA4- och LRBA-brist; profylaktiska antibiotika; G-CSF vid CGD
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är TBX1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2 kb av genens 6,6 kb, och 1 515 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest TBX1
34
positioner i TBX1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 6,6 kb av TBX1, med introner inräknade, inte bara de 2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ADAadenosine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseDelar 1 tillstånd
- AK2adenylate kinase 2Delar 1 tillstånd
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BDelar 1 tillstånd
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Delar 1 tillstånd
- ATMATM serine/threonine kinaseDelar 1 tillstånd
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Delar 1 tillstånd
- B2Mbeta-2-microglobulinDelar 1 tillstånd
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Delar 1 tillstånd
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorDelar 1 tillstånd
- BCL11BBCL11 transcription factor BDelar 1 tillstånd
- BLNKB cell linkerDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till TBX1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TBX1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Velopharyngeal incompetence
- Abnormal facial shape
- Abnormal of nasal shape
- Broad forehead
- Bulbous nose
- Cleft palate
- Corners of eye widely separated
- Eye folds
Visa ytterligare 45 egenskaper
- Flattening of the skull base
- Prominent nasal bridge
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Abnormal dentition
- Abnormality of the eyelid
- Abnormality of the skull
- Decreased volume of lip
- Dental cavities
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Flat nose
- Flattened bony protrusion above eyes
- High forehead
- Long face
- Long philtrum
- Long, narrow head
- Midface retrusion
- Narrow face
- Pit in front of the ear
- Short neck
- Submucous cleft hard palate
- Zygomatic flattening
- Abnormal tooth enamel
- Abnormally small head
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Drooling
- Little lower jaw
- Multiple suture craniosynostosis
- Narrow mouth
- Recurrent sinus disease
- Retinal arteriolar tortuosity
- Short philtrum
- Smooth philtrum
- Tall shaped head
- Wide nose
- Bifid uvula
- High palate
- High, narrow palate
- Narrow eyelid opening
- Narrow opening between the eyelids
- Open mouth
- Pierre-Robin sequence
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Underdeveloped tissue around nostril
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal aortic arch morphology
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal pulmonary valve morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Small thymus
- Tetralogy of Fallot
- Truncus arteriosus
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Abnormality of the tonsils
- Abnormal aortic valve morphology
- Absent/small thymus
- Double aortic arch
- Hypertensive crisis
- Increased spleen size
- Interrupted aortic arch
- Patent ductus arteriosus
- Pulmonary artery atresia
- Transposition of the great arteries
- Tricuspid atresia
- Underdeveloped left heart
- Varicose veins
- Abnormality of the thymus
- Complete atrioventricular canal defect
- Double outlet right ventricle
- Narrowing of aorta
- Retinal vascular tortuosity
- Right aortic arch with mirror image branching
Abnormality of the nervous system
- Difficulty finding words
- Intellectual disability
- Abnormal speech pattern
- Anxiety
- Attention deficit
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Global developmental delay
Visa ytterligare 18 egenskaper
- Intellectual disability, mild
- Meningocele
- Specific learning disability
- Arrhinencephaly
- Autism
- Behavioral abnormality
- Bipolar disorder
- Depression
- Obsessive compulsive behavior
- Parkinsonism
- Repetitive movements
- Schizophrenia
- Split spine
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Weakness of one side of body
- Aggressive behavior
- Can't control feelings
- Paranoia
Abnormality of the digestive system
- Anorectal anomaly
- Constipation
- Absent anus
- Acid reflux
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Feeding difficulties in infancy
- Gallstones
- Inguinal hernia
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of limbs
- Curvature of little finger
- Short fingers or toes
- Long slender fingers
- Club feet
- Dislocated kneecap
- Duplication of bones of the toes
- Extra finger
- Talipes
Visa ytterligare 3 egenskaper
Abnormality of the ear
- Conductive deafness
- Low-set ears
- Chronic infections of the middle ear
- Hearing impairment
- Overfolded ears
- Recurrent middle ear infection
- Small earlobe
- Earlobe crease
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TBX1-genen: T-box transcription factor 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tbx1
Dante Labs. TBX1-genen: T-box transcription factor 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tbx1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor