Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000149311↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 472↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 11q22.3
- Souřadnice
- Chromozom 11: 108 223 067–108 369 102 (GRCh38)
- Exony
- 63 exonů na 146 kb
- Protein
- 3 056 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní Autozomálně recesivní
- Další názvy
- TEL1, TELO1
- Předchozí symboly
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Transkript MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si ATM i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Ataxia-Telangiectasia
- Autozomálně recesivní
Progressive cerebellar ataxia, telangiectasia, immunodeficiency and cancer predisposition caused by biallelic ATM changes.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 8 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Diagnosis guides infection prevention and immunoglobulin replacement, minimising exposure to ionising radiation, cancer and lung monitoring, and carrier testing in relatives.
Female Infertility
Diminished or absent ability of a female to achieve conception.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 8 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- ATM-related cancer predispositionAutozomálně dominantní
A single variant in ATM moderately raises the risk of breast cancer and is linked to pancreatic and prostate cancer.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Enhanced breast screening is generally recommended; carriers with a partner who also carries an ATM variant may wish to know the risk of ataxia-telangiectasia in their children.
- Hereditary breast cancerAutozomálně dominantní
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 8 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je ATM uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 12,9 kb z 146 kb genu; 9 171 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte ATM
2 935
pozic v genu ATM, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 11 (0,4 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (11 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Celý genom pokrývá všech 146 kb genu ATM, včetně intronů, nikoli jen 12,9 kb exonů.
Varianty se stránkou (808)
Varianty genu ATM se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exon 18 | 108 268 501 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.2T>C | Exon 2 | 108 227 626 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108 235 669 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108 235 839 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.1122_1123del | Exon 9 | 108 248 987 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108 251 073 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108 257 479 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108 257 477 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108 259 080 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108 268 386 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ADAadenosine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 1 onemocnění
- AK2adenylate kinase 2Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Sdílí 1 onemocnění
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BSdílí 1 onemocnění
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Sdílí 1 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 1 onemocnění
- B2Mbeta-2-microglobulinSdílí 1 onemocnění
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Sdílí 1 onemocnění
- BARD1BRCA1 associated RING domain 1Sdílí 1 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 1 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s ATM
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ATM. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Zobrazit ještě 29 rysů
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Zobrazit ještě 3 rysů
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ATM: ATM serine/threonine kinase. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/atm
Dante Labs. Gen ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/atm
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů