Gen
ATP6AP1
ATPase H+ transporting accessory protein 1
- HGNC 868↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000071553↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 537↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xq28
- Souřadnice
- Chromozom X: 154 428 677–154 436 516 (GRCh38)
- Exony
- 10 exonů na 7,8 kb
- Protein
- 470 aminokyselin
- Další názvy
- ORF, XAP-3, VATPS1, 16A, Ac45, XAP3, CF2
- Předchozí symboly
- ATP6S1, ATP6IP1
- Transkript MANE Select
- ENST00000369762.7NM_001183.6
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si ATP6AP1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Congenital Disorders of Glycosylation
- Congenital Disorders of Glycosylation (CDG)
Jeden z 98 genů spojených s touto vazbou
A large group of inherited conditions in which sugar chains (glycans) are not correctly built or attached to proteins and lipids, often affecting the brain, liver, blood clotting, growth and many other body systems. Most are autosomal recessive, but some are X-linked or autosomal dominant.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je ATP6AP1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,1 kb z 7,8 kb genu; 1 413 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte ATP6AP1
8
pozic v genu ATP6AP1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 7,8 kb genu ATP6AP1, včetně intronů, nikoli jen 2,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 2 onemocnění
- BCL11BBCL11 transcription factor BSdílí 2 onemocnění
- BLNKB cell linkerSdílí 2 onemocnění
- BTKBruton tyrosine kinaseSdílí 2 onemocnění
- C1QAcomplement C1q A chainSdílí 2 onemocnění
- C1QBcomplement C1q B chainSdílí 2 onemocnění
- C1QCcomplement C1q C chainSdílí 2 onemocnění
- C1Scomplement C1sSdílí 2 onemocnění
- C2complement C2Sdílí 2 onemocnění
- C3complement C3Sdílí 2 onemocnění
- C4Acomplement C4A (Chido/Rodgers blood group)Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s ATP6AP1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ATP6AP1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Abnormal protein N-linked glycosylation
- Copper deficiency
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated serum cholesterol
- High liver enzymes
- Type II transferrin isoform profile
- Abnormal protein O-linked glycosylation
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ATP6AP1: ATPase H+ transporting accessory protein 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/atp6ap1
Dante Labs. Gen ATP6AP1: ATPase H+ transporting accessory protein 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/atp6ap1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů