Gen
SCO2
synthesis of cytochrome C oxidase 2
- HGNC 10604↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000284194↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 9997↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 22q13.33
- Souřadnice
- Chromozom 22: 50 523 568–50 525 598 (GRCh38)
- Exony
- 2 exonů na 2 kb
- Protein
- 266 aminokyselin
- Další názvy
- SCO1L
- Předchozí symboly
- MYP6
- Transkript MANE Select
- ENST00000395693.8NM_005138.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SCO2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Charcot-Marie-Tooth Disease
Jeden z 62 genů spojených s touto vazbou
A group of inherited peripheral neuropathies causing progressive weakness and wasting of the distal muscles and loss of sensation, mainly in the feet and hands.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: střední
Co přináší znalost
Genetic counseling, subtype-specific monitoring, physical therapy, orthotics, neurotoxic drug avoidance, gene-specific clinical trials, surveillance for associated features
Leigh Syndrome
Jeden z 69 genů spojených s touto vazbou
A progressive neurological disease defined by specific neuropathological features associating brainstem and basal ganglia lesions.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Primary Mitochondrial Disease
- Mitochondrial Respiratory Chain Complex Deficiency
Jeden z 61 genů spojených s touto vazbou
Isolated deficiencies of complex I, II, III, IV or V, caused by variants in nuclear or mitochondrial genes, which can affect the brain, muscles, heart, liver and other energy-demanding organs.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing can end a diagnostic search and guide surveillance of affected organs and avoidance of drugs toxic to mitochondria.
Jak je SCO2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1 kb z 2 kb genu; 801 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SCO2
33
pozic v genu SCO2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 2 kb genu SCO2, včetně intronů, nikoli jen 1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- SURF1SURF1 cytochrome c oxidase assembly factorSdílí 3 onemocnění
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Sdílí 2 onemocnění
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Sdílí 2 onemocnění
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Sdílí 2 onemocnění
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingSdílí 2 onemocnění
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s SCO2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SCO2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal brainstem MRI signal intensity
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal shape of brainstem
- Absent reflexes
- Ataxia
- Basal ganglia gliosis
Zobrazit ještě 50 rysů
- Brisk reflexes
- Cerebellar vermis atrophy
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed CNS myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse white matter abnormalities
- Encephalopathy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Gliosis
- High stepping
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to move vocal cords
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Lack of feeling, emotion, interest
- Loss of brain cells
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Mixed demyelinating and axonal polyneuropathy
- Motor axonal neuropathy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Positive Romberg sign
- Tremor
- Brain degeneration
- Decreased reflex response
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Clumsiness
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Facial-lingual fasciculations
- Focal cortical dysplasia
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Impaired vibratory sensation
- Intellectual disability, mild
- Lethargy
- Limb dystonia
- Loss of ability to walk
- Motor delay
- Motor polyneuropathy
- Muscle twitch
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Ventriculomegaly
- Intellectual disability
- Leukoencephalopathy
- Neuronal loss in basal ganglia
Laboratory abnormality
- High urine lactic acid levels
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Malignant hyperthermia
- Metabolic acidosis
- Persistent fever
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Abnormal copper levels
Zobrazit ještě 10 rysů
- Abnormal levels of creatine kinase in blood
- Elevated lactate:pyruvate ratio
- Increased circulating pyruvate concentration
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Increased hepatocellular lipid droplets
- Increased intramyocellular lipid droplets
- Renal Fanconi syndrome
Abnormality of head or neck
- Abnormal facial shape
- Abnormality of cranium
- Small retruded chin
- Wide nasal bridge
- Depressed nasal bridge
- Facial diplegia
- High palate
- Long, narrow head
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Cardiorespiratory arrest
- Increased respiratory rate or depth of breathing
- Noisy breathing
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Breathing difficulties
- Inspiratory stridor
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of limbs
- Hand muscle degeneration
- High-arched foot
- Increased muscle tone of arm or leg
- Limited ankle dorsiflexion
- Upper limb hypertonia
- Absent ankle reflexes
- Dropped arches
- Foot drop
Zobrazit ještě 1 rys
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged heart
- Heart murmur
- Cardiac failure
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart stops beating
- Myofiber disarray
- Right ventricular hypertrophy
- Slow heartbeats
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SCO2: synthesis of cytochrome C oxidase 2. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/sco2
Dante Labs. Gen SCO2: synthesis of cytochrome C oxidase 2 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/sco2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů