Gen
SCO2
synthesis of cytochrome C oxidase 2
- HGNC 10604↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000284194↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 9997↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 22q13.33
- Koordinater
- Kromosom 22: 50 523 568–50 525 598 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner på 2 kb
- Protein
- 266 aminosyror
- Även känd som
- SCO1L
- Tidigare symboler
- MYP6
- MANE Select-transkript
- ENST00000395693.8NM_005138.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SCO2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Charcot-Marie-Tooth-sjukdom
En av 62 gener kopplade till den
En grupp ärftliga perifera neuropatier som orsakar progressiv svaghet och muskelnedbrytning i de distala musklerna samt känselbortfall, främst i fötter och händer.
- ClinGen bedömer kopplingen som måttlig
Vad kunskapen förändrar
Genetisk rådgivning, undertypsspecifik uppföljning, sjukgymnastik, ortoser, undvikande av neurotoxiska läkemedel, genspecifika kliniska prövningar, bevakning av associerade kännetecken
Leighs syndrom
En av 69 gener kopplade till den
En progressiv neurologisk sjukdom som definieras av specifika neuropatologiska drag, med skador i hjärnstammen och basala ganglier.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Primär mitokondriell sjukdom
- Brist på mitokondriella andningskedjekomplex
En av 61 gener kopplade till den
Isolerad brist på komplex I, II, III, IV eller V, orsakad av varianter i kärngener eller mitokondriella gener. Den kan påverka hjärnan, musklerna, hjärtat, levern och andra organ med högt energibehov.
- 3 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Kunskapen kan avsluta en diagnostisk sökning och vägleda uppföljning av drabbade organ och undvikande av läkemedel som är toxiska för mitokondrierna.
Så är SCO2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1 kb av genens 2 kb, och 801 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SCO2
33
positioner i SCO2 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 2 kb av SCO2, med introner inräknade, inte bara de 1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- SURF1SURF1 cytochrome c oxidase assembly factorDelar 3 tillstånd
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Delar 2 tillstånd
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Delar 2 tillstånd
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Delar 2 tillstånd
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingDelar 2 tillstånd
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Delar 2 tillstånd
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Delar 2 tillstånd
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Delar 2 tillstånd
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Delar 2 tillstånd
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Delar 2 tillstånd
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Delar 2 tillstånd
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till SCO2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SCO2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal brainstem MRI signal intensity
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal shape of brainstem
- Absent reflexes
- Ataxia
- Basal ganglia gliosis
Visa ytterligare 50 egenskaper
- Brisk reflexes
- Cerebellar vermis atrophy
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed CNS myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse white matter abnormalities
- Encephalopathy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Gliosis
- High stepping
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to move vocal cords
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Lack of feeling, emotion, interest
- Loss of brain cells
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Mixed demyelinating and axonal polyneuropathy
- Motor axonal neuropathy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Positive Romberg sign
- Tremor
- Brain degeneration
- Decreased reflex response
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Clumsiness
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Facial-lingual fasciculations
- Focal cortical dysplasia
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Impaired vibratory sensation
- Intellectual disability, mild
- Lethargy
- Limb dystonia
- Loss of ability to walk
- Motor delay
- Motor polyneuropathy
- Muscle twitch
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Ventriculomegaly
- Intellectual disability
- Leukoencephalopathy
- Neuronal loss in basal ganglia
Laboratory abnormality
- High urine lactic acid levels
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Malignant hyperthermia
- Metabolic acidosis
- Persistent fever
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Abnormal copper levels
Visa ytterligare 10 egenskaper
- Abnormal levels of creatine kinase in blood
- Elevated lactate:pyruvate ratio
- Increased circulating pyruvate concentration
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Increased hepatocellular lipid droplets
- Increased intramyocellular lipid droplets
- Renal Fanconi syndrome
Abnormality of head or neck
- Abnormal facial shape
- Abnormality of cranium
- Small retruded chin
- Wide nasal bridge
- Depressed nasal bridge
- Facial diplegia
- High palate
- Long, narrow head
Visa ytterligare 2 egenskaper
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Cardiorespiratory arrest
- Increased respiratory rate or depth of breathing
- Noisy breathing
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Breathing difficulties
- Inspiratory stridor
Visa ytterligare 2 egenskaper
Abnormality of limbs
- Hand muscle degeneration
- High-arched foot
- Increased muscle tone of arm or leg
- Limited ankle dorsiflexion
- Upper limb hypertonia
- Absent ankle reflexes
- Dropped arches
- Foot drop
Visa ytterligare 1 egenskap
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged heart
- Heart murmur
- Cardiac failure
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart stops beating
- Myofiber disarray
- Right ventricular hypertrophy
- Slow heartbeats
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SCO2-genen: synthesis of cytochrome C oxidase 2. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sco2
Dante Labs. SCO2-genen: synthesis of cytochrome C oxidase 2 [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sco2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor