Gen
SURF1
SURF1 cytochrome c oxidase assembly factor
- HGNC 11474↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000148290↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6834↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 9q34.2
- Souřadnice
- Chromozom 9: 133 351 758–133 356 487 (GRCh38)
- Exony
- 9 exonů na 4,7 kb
- Protein
- 300 aminokyselin
- Další názvy
- SHY1
- Transkript MANE Select
- ENST00000371974.8NM_003172.4
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/surf1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si SURF1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Charcot-Marie-Tooth Disease
Jeden z 62 genů spojených s touto vazbou
A group of inherited peripheral neuropathies causing progressive weakness and wasting of the distal muscles and loss of sensation, mainly in the feet and hands.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Genetic counseling, subtype-specific monitoring, physical therapy, orthotics, neurotoxic drug avoidance, gene-specific clinical trials, surveillance for associated features
Leigh Syndrome
Jeden z 69 genů spojených s touto vazbou
A progressive neurological disease defined by specific neuropathological features associating brainstem and basal ganglia lesions.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Primary Mitochondrial Disease
- Mitochondrial Respiratory Chain Complex Deficiency
Jeden z 61 genů spojených s touto vazbou
Isolated deficiencies of complex I, II, III, IV or V, caused by variants in nuclear or mitochondrial genes, which can affect the brain, muscles, heart, liver and other energy-demanding organs.
- 2 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Knowing can end a diagnostic search and guide surveillance of affected organs and avoidance of drugs toxic to mitochondria.
Jak je SURF1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,1 kb z 4,7 kb genu; 903 těchto bází kódují protein.
Sekvenování SURF1
136
pozic v SURF1, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 4,7 kb genu SURF1, včetně intronů, nikoli jen 1,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- SCO2synthesis of cytochrome C oxidase 2Sdílí 3 onemocnění
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Sdílí 2 onemocnění
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Sdílí 2 onemocnění
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Sdílí 2 onemocnění
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingSdílí 2 onemocnění
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Sdílí 2 onemocnění
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Sdílí 2 onemocnění
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Sdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s SURF1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SURF1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Increased lactate in body
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased CSF lactate
- Increased hepatocellular lipid droplets
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SURF1: SURF1 cytochrome c oxidase assembly factor. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/surf1
Dante Labs. Gen SURF1: SURF1 cytochrome c oxidase assembly factor [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/surf1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů