Gene
SCO2
synthesis of cytochrome C oxidase 2
- HGNC 10604↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000284194↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 9997↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 22q13.33
- Coordinate
- Cromosoma 22: 50.523.568–50.525.598 (GRCh38)
- Esoni
- 2 esoni su 2 kb
- Proteina
- 266 amminoacidi
- Noto anche come
- SCO1L
- Simboli precedenti
- MYP6
- Trascritto MANE Select
- ENST00000395693.8NM_005138.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Malattia di Charcot-Marie-Tooth
Uno di 62 geni collegati ad esso
Un gruppo di neuropatie periferiche ereditarie che provocano debolezza e atrofia progressiva dei muscoli distali e perdita della sensibilità, principalmente a livello di piedi e mani.
- ClinGen valuta il legame come moderato
Cosa cambia sapendolo
Consulenza genetica, monitoraggio specifico per sottotipo, fisioterapia, ortesi, prevenzione dell'uso di farmaci neurotossici, studi clinici gene-specifici, sorveglianza delle manifestazioni associate
Sindrome di Leigh
Uno di 69 geni collegati ad esso
Una malattia neurologica progressiva definita da specifiche caratteristiche neuropatologiche associate a lesioni del tronco encefalico e dei gangli della base.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Malattia mitocondriale primaria
- Deficit del complesso della catena respiratoria mitocondriale
Uno di 61 geni collegati ad esso
Deficit isolati dei complessi I, II, III, IV o V, causati da varianti in geni nucleari o mitocondriali, che possono interessare il cervello, i muscoli, il cuore, il fegato e altri organi ad alto consumo energetico.
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere questa condizione può porre fine a una ricerca diagnostica e guidare il monitoraggio degli organi interessati e l'evitamento di farmaci tossici per i mitocondri.
Struttura di SCO2
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 1 kb dei 2 kb del gene; 801 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SCO2
33
posizioni in SCO2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 2 kb di SCO2, introni inclusi, non solo i 1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- SURF1SURF1 cytochrome c oxidase assembly factorCondivide 3 condizioni
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Condivide 2 condizioni
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX10Condivide 2 condizioni
- FOXRED1FAD dependent oxidoreductase domain containing 1Condivide 2 condizioni
- LRPPRCleucine rich pentatricopeptide repeat containingCondivide 2 condizioni
- NDUFA1NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1Condivide 2 condizioni
- NDUFA13NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13Condivide 2 condizioni
- NDUFA2NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A2Condivide 2 condizioni
- NDUFA9NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9Condivide 2 condizioni
- NDUFAF2NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2Condivide 2 condizioni
- NDUFAF5NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5Condivide 2 condizioni
- NDUFAF6NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a SCO2
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SCO2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal brainstem MRI signal intensity
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Abnormal shape of brainstem
- Absent reflexes
- Ataxia
- Basal ganglia gliosis
Mostra altri 50 tratti
- Brisk reflexes
- Cerebellar vermis atrophy
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed CNS myelination
- Difficulty articulating speech
- Diffuse white matter abnormalities
- Encephalopathy
- Focal T2 hyperintense basal ganglia lesion
- Gliosis
- High stepping
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to move vocal cords
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Lack of feeling, emotion, interest
- Loss of brain cells
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Mixed demyelinating and axonal polyneuropathy
- Motor axonal neuropathy
- Peripheral axonal neuropathy
- Peripheral neuropathy
- Positive Romberg sign
- Tremor
- Brain degeneration
- Decreased reflex response
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Clumsiness
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Facial-lingual fasciculations
- Focal cortical dysplasia
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Impaired vibratory sensation
- Intellectual disability, mild
- Lethargy
- Limb dystonia
- Loss of ability to walk
- Motor delay
- Motor polyneuropathy
- Muscle twitch
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Ventriculomegaly
- Intellectual disability
- Leukoencephalopathy
- Neuronal loss in basal ganglia
Laboratory abnormality
- High urine lactic acid levels
- Increased CSF lactate
- Increased lactate in body
- Malignant hyperthermia
- Metabolic acidosis
- Persistent fever
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Abnormal copper levels
Mostra altri 10 tratti
- Abnormal levels of creatine kinase in blood
- Elevated lactate:pyruvate ratio
- Increased circulating pyruvate concentration
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Glucose in urine
- High urine phosphate levels
- High urine protein levels
- Increased hepatocellular lipid droplets
- Increased intramyocellular lipid droplets
- Renal Fanconi syndrome
Abnormality of head or neck
- Abnormal facial shape
- Abnormality of cranium
- Small retruded chin
- Wide nasal bridge
- Depressed nasal bridge
- Facial diplegia
- High palate
- Long, narrow head
Mostra altri 2 tratti
Abnormality of the respiratory system
- Breathing difficulty
- Cardiorespiratory arrest
- Increased respiratory rate or depth of breathing
- Noisy breathing
- Respiratory failure
- Respiratory failure requiring assisted ventilation
- Breathing difficulties
- Inspiratory stridor
Mostra altri 2 tratti
Abnormality of limbs
- Hand muscle degeneration
- High-arched foot
- Increased muscle tone of arm or leg
- Limited ankle dorsiflexion
- Upper limb hypertonia
- Absent ankle reflexes
- Dropped arches
- Foot drop
Mostra altri 1 tratto
Abnormality of the cardiovascular system
- Enlarged heart
- Heart murmur
- Cardiac failure
- Enlarged and thickened heart muscle
- Heart stops beating
- Myofiber disarray
- Right ventricular hypertrophy
- Slow heartbeats
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SCO2: synthesis of cytochrome C oxidase 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sco2
Dante Labs. Gene SCO2: synthesis of cytochrome C oxidase 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sco2
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