Gen
SCN1A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 1
- HGNC 10585↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000144285↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 6323↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 2q24.3
- Koordinatlar
- Kromozom 2: 165.985.813–166.128.020 (GRCh38)
- Eksonlar
- 142,2 kb boyunca 29 ekson
- Protein
- 2.009 amino asit
- Kalıtım
- Otozomal dominant
- Diğer adları
- Nav1.1, GEFSP2, HBSCI, NAC1, SMEI
- Önceki semboller
- SCN1, FEB3
- MANE Select transkripti
- ENST00000674923.1NM_001165963.4
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
SCN1A ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Dravet Sendromu
- Otozomal dominant
Dravet sendromu, hayatın ilk yılı içinde, tipik olarak 4-5. aylarda başlayan, status epileptikus ve ateşle sıklıkla tetiklenen, ilaçlara dirençli çeşitli nöbetlerle karakterize bir kanalopatidir. Daha önce sağlıklı olan çocuklarda görülür ve sıklıkla bilişsel ve motor gerilemeye yol açar. Dravet, diğer kanalopatilerden genellikle SCN1A genindeki bir mutasyon nedeniyle ayrılır.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 2 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Bilmenin neleri değiştirdiği
Valproat, klobazam, topiramat, stiripentol; ilaca dirençli olgularda fenfluramin (Fintepla) ve kannabidiol (Epidiolex); sodyum kanalı blokerleri (lamotrijin, karbamazepin, okskarbazepin) SCN1A pozitif hastalarda KONTRENDİKEDİR.
Ailevi Hemipleji Migreni
- Migren, Ailevi Hemipleji, 3Otozomal dominant
Hastalığın nedeninin SCN1A geninde mutasyon olduğu, ailesel veya sporadik her türlü hemipleji migreni.
- 2 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
- Otozomal dominant
Motor güçsüzlüğü içeren aura öyküsünün bireysel ve ailesel öykü ile karakterize olduğu bir migren bozukluğu.
- 2 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
- Ailesel veya Sporadik Hemipleji MigreniOtozomal dominant
Hemipleji migreni (HM), aura sırasında motor güçsüzlük bulunmasıyla karakterize, nadir görülen bir aura eşlikli migren türüdür. Hemipleji migreni, aile öyküsüne bağlı olarak iki ana forma sahiptir: motor güçsüzlük içeren aurası olan en az bir birinci veya ikinci derece akrabası bulunan hastalarda ailesel hemipleji migreni (FHM) görülür; bu tür aile öyküsü olmayan hastalarda ise sporadik hemipleji migreni (SHM) görülür.
- 2 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Daha geniş gruplar
Epilepsi (Tam Panel)
- Epilepsi
Buna bağlı 171 gen arasından biri
Nöronal deşarjın anormal şekilde artmasıyla ortaya çıkan, geçici duyusal veya motor nörolojik işlev bozukluğu ya da psişik işlev bozukluğuyla seyreden bir beyin hastalığıdır. Bu nöbetler bilinç kaybı veya konvülsiyonlarla birlikte olabilir ya da olmayabilir.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 6 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Kalıtım
- Otozomal dominant
- Ebeveynlerden birinden gelen tek bir değişmiş kopya yeterlidir. Değişmiş kopyaya sahip bir ebeveyn, bunu her çocuğuna ikide bir olasılıkla aktarır.
SCN1A geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 142,2 kb uzunluğunun 11,9 kb'sini oluşturur; bu bazların 6.030 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi SCN1A genini nasıl okur
720
SCN1A içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların 49 tanesi (%6,8), kısa okumaların zorlandığı bölgelere düşüyor.
- Low mappability (49 konum)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Tam genom, SCN1A genindeki 142,2 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 11,9 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Sayfası olan varyantlar (12)
Burada sayfası bulunan SCN1A varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| A420V | c.1259C>T | Ekzon 12 | 166.046.888 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| G908R | c.2722G>C | Ekzon 18 | 166.038.000 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| P768L | c.2303C>T | Ekzon 16 | 166.041.343 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| P1838Lfs*20 | c.5511del | Ekzon 29 | 165.991.763 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R219G | c.655A>G | Ekzon 8 | 166.052.891 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R219T | c.656G>C | Ekzon 8 | 166.052.890 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R931H | c.2792G>A | Ekzon 18 | 166.037.930 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| R1639P | c.4916G>C | Ekzon 29 | 165.992.359 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| S570N | c.1709G>A | Ekzon 14 | 166.044.003 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| T1210M | c.3629C>T | Ekzon 21 | 166.013.820 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 23 durumu paylaşıyor
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 A3 durumu paylaşıyor
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 durumu paylaşıyor
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 durumu paylaşıyor
- ACTL6Bactin like 6B1 durumu paylaşıyor
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 durumu paylaşıyor
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 durumu paylaşıyor
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 durumu paylaşıyor
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 durumu paylaşıyor
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 durumu paylaşıyor
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulator1 durumu paylaşıyor
- ARXaristaless related homeobox1 durumu paylaşıyor
SCN1A ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, SCN1A geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- IQ less than 20
- Migraine with aura
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Abnormal speech pattern
132 özellik daha göster
- Absent speech development
- Ataxia
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Fear of loud sounds
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (>3.5 Hz)
- Epilepsia partialis continua
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Falls
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Pins and needles feeling
- Slow movements
- Small hippocampus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Action tremor
- Alien limb phenomenon
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Brisk reflexes
- Chorea
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Incoordination
- Lack of feeling, emotion, interest
- Language impairment
- Myoclonic absence seizure
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Poor social interactions
- Psychosis
- Repetitive movements
- Short attention span
- Simple febrile seizure
- Spontaneous pain sensation
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- EEG with focal sharp waves
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Motor delay
- Visually-induced seizure
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). SCN1A geni: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/scn1a
Dante Labs. SCN1A geni: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/scn1a
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde