Gen
SCN1A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 1
- HGNC 10585↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000144285↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6323↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q24.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 165.985.813–166.128.020 (GRCh38)
- Exons
- 29 exons over 142,2 kb
- Eiwit
- 2.009 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- Nav1.1, GEFSP2, HBSCI, NAC1, SMEI
- Eerdere symbolen
- SCN1, FEB3
- MANE Select-transcript
- ENST00000674923.1NM_001165963.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SCN1A en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Dravet-syndroom
- Autosomaal dominant
Het Dravet-syndroom is een channelopathie met epilepsie die in het eerste levensjaar begint, meestal rond de leeftijd van 4 tot 5 maanden. Het kenmerkt zich door status epilepticus en diverse medicijnresistente aanvallen die vaak door koorts worden uitgelokt. Het treedt op bij voorheen gezonde kinderen en leidt vaak tot cognitieve en motorische beperkingen. Het Dravet-syndroom verschilt van andere channelopathieën doorgaans door een mutatie in SCN1A.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Valproaat, clobazam, topiramaat, stiripentol; fenfluramine (Fintepla) en cannabidiol (Epidiolex) voor gevallen met therapieresistentie; natriumkanaalblokkers (lamotrigine, carbamazepine, oxcarbazepine) zijn CONTRAINDICATIE bij patiënten met een SCN1A-positieve uitslag
Familiaire hemiplegische migraine
- Migraine, familiaire hemiplegisch, 3Autosomaal dominant
Elke familiaire of sporadische hemiplegische migraine waarbij de oorzaak van de aandoening een mutatie in het SCN1A-gen is.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Autosomaal dominant
Een migraineaandoening die wordt gekenmerkt door een persoonlijke en familiegeschiedenis van aura met motorische zwakte.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Familiaire of sporadische hemiplegische migraineAutosomaal dominant
Hemiplegische migraine (HM) is een zeldzame variant van migraine met aura, gekenmerkt door motorische zwakte tijdens de aura. Hemiplegische migraine kent twee hoofdvormen, afhankelijk van de familiegeschiedenis: patiënten met ten minste één eerste- of tweedegraads familielid met aura inclusief motorische zwakte hebben familiaire hemiplegische migraine (FHM); patiënten zonder zo'n familiegeschiedenis hebben sporadische hemiplegische migraine (SHM).
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Epilepsie (volledig panel)
- Epilepsie
Een van 171 genen die hiermee verband houden
Een hersenaandoening die wordt gekenmerkt door episodes van abnormaal verhoogde neuronale ontlading, die leiden tot tijdelijke episodes van sensorische of motorische neurologische stoornissen, of psychische stoornissen. Deze episodes kunnen al dan niet gepaard gaan met bewustzijnsverlies of convulsies.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van SCN1A
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 11,9 kb van de 142,2 kb van het gen; 6.030 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SCN1A leest
720
posities in SCN1A waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
49 daarvan (6,8%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Low mappability (49 posities)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een volledig genoom dekt alle 142,2 kb van SCN1A, inclusief introns, en niet alleen de 11,9 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (12)
De SCN1A-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A420V | c.1259C>T | Exon 12 | 166.046.888 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| G908R | c.2722G>C | Exon 18 | 166.038.000 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| P768L | c.2303C>T | Exon 16 | 166.041.343 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| P1838Lfs*20 | c.5511del | Exon 29 | 165.991.763 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R219G | c.655A>G | Exon 8 | 166.052.891 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R219T | c.656G>C | Exon 8 | 166.052.890 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R931H | c.2792G>A | Exon 18 | 166.037.930 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| R1639P | c.4916G>C | Exon 29 | 165.992.359 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| S570N | c.1709G>A | Exon 14 | 166.044.003 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| T1210M | c.3629C>T | Exon 21 | 166.013.820 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deelt 3 aandoeningen
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeelt 3 aandoeningen
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deelt 1 aandoening
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeelt 1 aandoening
- ACTL6Bactin like 6BDeelt 1 aandoening
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deelt 1 aandoening
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deelt 1 aandoening
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deelt 1 aandoening
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deelt 1 aandoening
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeelt 1 aandoening
- ARXaristaless related homeoboxDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SCN1A
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SCN1A kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- IQ less than 20
- Migraine with aura
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Abnormal speech pattern
Toon 132 kenmerken meer
- Absent speech development
- Ataxia
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Fear of loud sounds
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (>3.5 Hz)
- Epilepsia partialis continua
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Falls
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Pins and needles feeling
- Slow movements
- Small hippocampus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Action tremor
- Alien limb phenomenon
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Brisk reflexes
- Chorea
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Incoordination
- Lack of feeling, emotion, interest
- Language impairment
- Myoclonic absence seizure
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Poor social interactions
- Psychosis
- Repetitive movements
- Short attention span
- Simple febrile seizure
- Spontaneous pain sensation
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- EEG with focal sharp waves
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Motor delay
- Visually-induced seizure
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SCN1A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/scn1a
Dante Labs. SCN1A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/scn1a
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken