Gen
SCN1A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 1
- HGNC 10585↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000144285↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6323↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2q24.3
- Współrzędne
- Chromosom 2: 165 985 813–166 128 020 (GRCh38)
- Eksony
- 29 eksonów na odcinku 142,2 kb
- Białko
- 2009 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- Nav1.1, GEFSP2, HBSCI, NAC1, SMEI
- Poprzednie symbole
- SCN1, FEB3
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000674923.1NM_001165963.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SCN1A oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Zespół Dravet
- Autosomalne dominujące
Zespół Dravet jest kanałopatią z padaczką, która pojawia się w pierwszym roku życia, zwykle w 4.–5. miesiącu, i charakteryzuje się stanem padaczkowym oraz różnymi trudnymi do opanowania napadami, często wywoływanymi gorączką. Występuje u wcześniej zdrowych dzieci i często prowadzi do upośledzenia funkcji poznawczych i ruchowych. Zespół Dravet różni się od innych kanałopatii zazwyczaj mutacją w genie SCN1A.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Walproinian, klobazam, topiramat, stirypentol; fenfluramina (Fintepla) i kannabidiol (Epidiolex) w przypadkach opornych na leczenie; blokery kanałów sodowych (lamotrygina, karbamazepina, okskarbazepina) są PRZECIWWSKAZANE u pacjentów z wariantem SCN1A
Rodzinna migrena hemiplegiczna
- Migrena rodzinna hemiplegiczna, 3Autosomalne dominujące
Każda rodzinna lub sporadyczna migrena hemiplegiczna, której przyczyną jest mutacja w genie SCN1A.
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Autosomalne dominujące
Zaburzenie migrenowe charakteryzujące się indywidualnym i rodzinnym wywiadem aury obejmującej osłabienie motoryczne.
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Rodzinna lub sporadyczna migrena hemiplegicznaAutosomalne dominujące
Migrena hemiplegiczna (HM) to rzadka odmiana migreny z aurą, charakteryzująca się występowaniem osłabienia motorycznego podczas aury. Migrena hemiplegiczna występuje w dwóch głównych postaciach, zależnie od historii rodzinnej: u pacjentów, u których co najmniej jeden krewny pierwszego lub drugiego stopnia ma aurę obejmującą osłabienie motoryczne, rozpoznaje się rodzinną migrenę hemiplegiczną (FHM); u pacjentów bez takiego obciążenia rodzinnego rozpoznaje się sporadyczną migrenę hemiplegiczną (SHM).
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Szersze grupy
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu SCN1A
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 11,9 kb z 142,2 kb genu; 6030 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SCN1A
720
pozycje w SCN1A, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
49 z nich (6,8%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (49 miejsc)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 142,2 kb genu SCN1A, łącznie z intronami, a nie tylko 11,9 kb eksonów.
Warianty z podstroną (12)
Warianty SCN1A z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A420V | c.1259C>T | Ekson 12 | 166 046 888 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| G908R | c.2722G>C | Ekson 18 | 166 038 000 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| P768L | c.2303C>T | Ekson 16 | 166 041 343 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| P1838Lfs*20 | c.5511del | Ekson 29 | 165 991 763 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R219G | c.655A>G | Ekson 8 | 166 052 891 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R219T | c.656G>C | Ekson 8 | 166 052 890 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R931H | c.2792G>A | Ekson 18 | 166 037 930 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| R1639P | c.4916G>C | Ekson 29 | 165 992 359 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| S570N | c.1709G>A | Ekson 14 | 166 044 003 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| T1210M | c.3629C>T | Ekson 21 | 166 013 820 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólnych schorzeń: 3
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 AWspólnych schorzeń: 3
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SCN1A
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SCN1A. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- IQ less than 20
- Migraine with aura
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Abnormal speech pattern
Pokaż jeszcze 132 cech
- Absent speech development
- Ataxia
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Fear of loud sounds
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (>3.5 Hz)
- Epilepsia partialis continua
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Falls
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Pins and needles feeling
- Slow movements
- Small hippocampus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Action tremor
- Alien limb phenomenon
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Brisk reflexes
- Chorea
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Incoordination
- Lack of feeling, emotion, interest
- Language impairment
- Myoclonic absence seizure
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Poor social interactions
- Psychosis
- Repetitive movements
- Short attention span
- Simple febrile seizure
- Spontaneous pain sensation
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- EEG with focal sharp waves
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Motor delay
- Visually-induced seizure
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN1A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/scn1a
Dante Labs. Gen SCN1A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/scn1a
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni