Gen
SCN1A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 1
- HGNC 10585↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000144285↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 6323↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 2q24.3
- Koordinaten
- Chromosom 2: 165.985.813–166.128.020 (GRCh38)
- Exons
- 29 Exons über 142,2 kb
- Protein
- 2.009 Aminosäuren
- Vererbung
- Autosomal-dominant
- Auch bekannt als
- Nav1.1, GEFSP2, HBSCI, NAC1, SMEI
- Frühere Symbole
- SCN1, FEB3
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000674923.1NM_001165963.4
- Locus-Typ
- gene with protein product
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
ReferenzgenomGRCh38hg38
Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.
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Meinen Genome Test bestellenKuratierte Berichte zu diesem Gen
Dravet-Syndrom
- Autosomal-dominant
Das Dravet-Syndrom ist eine Kanalopathie mit Epilepsie, die im ersten Lebensjahr – typischerweise im Alter von 4 bis 5 Monaten – bei zuvor gesunden Kindern auftritt. Es ist gekennzeichnet durch einen Status epilepticus und eine Vielzahl therapieresistenter, häufig fieberinduzierter Anfälle, die oft zu kognitiven und motorischen Beeinträchtigungen führen. Das Dravet-Syndrom unterscheidet sich von anderen Kanalopathien meist durch eine Mutation im Gen SCN1A.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 2 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Was das Wissen verändert
Valproat, Clobazam, Topiramat, Stiripentol; Fenfluramin (Fintepla) und Cannabidiol (Epidiolex) bei therapieresistenten Verläufen; Natriumkanalblocker (Lamotrigin, Carbamazepin, Oxcarbazepin) sind bei SCN1A-positiven Patienten KONTRAINDIZIERT
Familiäre hemiplegische Migräne
- Familiäre hemiplegische Migräne, Typ 3Autosomal-dominant
Jede familiäre oder sporadische hemiplegische Migräne, die durch eine Mutation im SCN1A-Gen verursacht wird.
- 2 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
- Autosomal-dominant
Eine Migräneerkrankung, die durch eine persönliche und familiäre Vorgeschichte von Auren mit motorischer Schwäche gekennzeichnet ist.
- 2 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
- Familiäre oder sporadische hemiplegische MigräneAutosomal-dominant
Die hemiplegische Migräne (HM) ist eine seltene Form der Migräne mit Aura, die durch das Auftreten einer motorischen Schwäche während der Auraphase gekennzeichnet ist. Je nach familiärer Vorbelastung werden zwei Hauptformen unterschieden: Patientinnen und Patienten mit mindestens einem Verwandten ersten oder zweiten Grades, bei dem ebenfalls Auren mit motorischer Schwäche auftreten, leiden an der familiären hemiplegischen Migräne (FHM). Liegt keine solche familiäre Vorbelastung vor, spricht man von einer sporadischen hemiplegischen Migräne (SHM).
- 2 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Übergeordnete Gruppen
Epilepsie (Komplettpanel)
- Epilepsie
Eines von 171 Genen, die damit verknüpft sind
Eine Erkrankung des Gehirns, die durch Episoden abnorm gesteigerter neuronaler Entladungen gekennzeichnet ist. Diese führen zu vorübergehenden sensorischen, motorischen oder psychischen Funktionsstörungen und können mit oder ohne Bewusstseinsverlust oder Krämpfe auftreten.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 6 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Vererbung
- Autosomal-dominant
- Eine veränderte Kopie von einem der beiden Elternteile reicht aus. Ein Elternteil, das eine solche Kopie hat, gibt sie mit einer Wahrscheinlichkeit von eins zu zwei an jedes Kind weiter.
Aufbau von SCN1A
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
- Varianten mit Seite
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 11,9 kb der 142,2 kb des Gens aus; 6.030 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest SCN1A
720
Positionen in SCN1A, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
49 davon (6,8 %) liegen in Bereichen, die Short Reads schwer erfassen.
- Low mappability (49 Stellen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 142,2 kb von SCN1A, einschließlich der Introns, und nicht nur die 11,9 kb Exons.
Varianten mit Seite (12)
Die SCN1A-Varianten mit Seite hier, zuerst die mit den meisten Review-Sternen. Jede Seite beschreibt den öffentlichen Eintrag von ClinVar zur Variante, niemals ein Ergebnis.
| Variante | HGVS c. | Exon oder Intron | Position (GRCh38) | ClinVar-Klassifikation | Überprüfungsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A420V | c.1259C>T | Exon 12 | 166.046.888 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| G908R | c.2722G>C | Exon 18 | 166.038.000 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| P768L | c.2303C>T | Exon 16 | 166.041.343 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| P1838Lfs*20 | c.5511del | Exon 29 | 165.991.763 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| R219G | c.655A>G | Exon 8 | 166.052.891 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| R219T | c.656G>C | Exon 8 | 166.052.890 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| R931H | c.2792G>A | Exon 18 | 166.037.930 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| R1639P | c.4916G>C | Exon 29 | 165.992.359 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| S570N | c.1709G>A | Exon 14 | 166.044.003 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| T1210M | c.3629C>T | Exon 21 | 166.013.820 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
Gene mit denselben Erkrankungen
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Teilt 3 Erkrankungen
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ATeilt 3 Erkrankungen
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Teilt 1 Erkrankung
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseTeilt 1 Erkrankung
- ACTL6Bactin like 6BTeilt 1 Erkrankung
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Teilt 1 Erkrankung
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Teilt 1 Erkrankung
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitTeilt 1 Erkrankung
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Teilt 1 Erkrankung
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Teilt 1 Erkrankung
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorTeilt 1 Erkrankung
- ARXaristaless related homeoboxTeilt 1 Erkrankung
Mit SCN1A verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die SCN1A verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- IQ less than 20
- Migraine with aura
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Abnormal speech pattern
132 weitere Merkmale anzeigen
- Absent speech development
- Ataxia
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Fear of loud sounds
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (>3.5 Hz)
- Epilepsia partialis continua
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Falls
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Pins and needles feeling
- Slow movements
- Small hippocampus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Action tremor
- Alien limb phenomenon
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Brisk reflexes
- Chorea
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Incoordination
- Lack of feeling, emotion, interest
- Language impairment
- Myoclonic absence seizure
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Poor social interactions
- Psychosis
- Repetitive movements
- Short attention span
- Simple febrile seizure
- Spontaneous pain sensation
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- EEG with focal sharp waves
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Motor delay
- Visually-induced seizure
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). SCN1A-Gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/scn1a
Dante Labs. SCN1A-Gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/scn1a
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