Gen
SCN1A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 1
- HGNC 10585↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000144285↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6323↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2q24.3
- Koordinater
- Kromosom 2: 165.985.813–166.128.020 (GRCh38)
- Exoner
- 29 exoner fordelt over 142,2 kb
- Protein
- 2.009 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Også kendt som
- Nav1.1, GEFSP2, HBSCI, NAC1, SMEI
- Tidligere symboler
- SCN1, FEB3
- MANE Select-transkript
- ENST00000674923.1NM_001165963.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs SCN1A og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Dravet-syndrom
- Autosomal dominant
Dravet-syndrom er en kanalopati med epilepsi, der debuterer i det første leveår, typisk i 4.-5. levemåned, og kendetegnes ved status epilepticus og en række lægemiddelresistente anfald, ofte fremkaldt af feber. Det optræder hos tidligere raske børn og fører ofte til kognitiv og motorisk svækkelse. Dravet adskiller sig fra andre kanalopatier ved oftest at skyldes en mutation i SCN1A.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Valproat, clobazam, topiramat, stiripentol; fenfluramin (Fintepla) og cannabidiol (Epidiolex) ved lægemiddelresistente tilfælde; natriumkanalblokkere (lamotrigin, carbamazepin, oxcarbazepin) er KONTRAINDICEREDE hos SCN1A-positive patienter
Familiær hemiplegisk migræne
- Migræne, familiær hemiplegisk, 3Autosomal dominant
Enhver familiær eller sporadisk hemiplegisk migræne, hvor årsagen til sygdommen er en mutation i SCN1A-genet.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Autosomal dominant
En migrænelidelse kendetegnet ved individuel og familiemæssig forekomst af aura, der omfatter motorisk svaghed.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Familiær eller sporadisk hemiplegisk migræneAutosomal dominant
Hemiplegisk migræne (HM) er en sjælden variant af migræne med aura, kendetegnet ved motorisk svaghed under auraen. Hemiplegisk migræne har to hovedformer, afhængigt af familiehistorien: Patienter med mindst én første- eller andengradsslægtning, der har aura med motorisk svaghed, har familiær hemiplegisk migræne (FHM). Patienter uden en sådan familiehistorie har sporadisk hemiplegisk migræne (SHM).
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Epilepsi (fuld panel)
- Epilepsi
Et af 171 gener, der er knyttet til det
En hjernelidelse, kendetegnet ved episoder med unormalt øget neuronal aktivitet, som giver midlertidige episoder med sensoriske eller motoriske neurologiske funktionsforstyrrelser eller psykiske funktionsforstyrrelser. Disse episoder kan ledsages af bevidsthedstab eller krampeanfald, men behøver ikke.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er SCN1A opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 11,9 kb af genets 142,2 kb; 6.030 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest SCN1A
720
positioner i SCN1A, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
49 af dem (6,8 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (49 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalyse dækker alle 142,2 kb af SCN1A, inklusive introner, og ikke kun de 11,9 kb eksoner.
Varianter med en side (12)
Her vises de SCN1A-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A420V | c.1259C>T | Exon 12 | 166.046.888 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| G908R | c.2722G>C | Exon 18 | 166.038.000 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| P768L | c.2303C>T | Exon 16 | 166.041.343 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| P1838Lfs*20 | c.5511del | Exon 29 | 165.991.763 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R219G | c.655A>G | Exon 8 | 166.052.891 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R219T | c.656G>C | Exon 8 | 166.052.890 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R931H | c.2792G>A | Exon 18 | 166.037.930 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| R1639P | c.4916G>C | Exon 29 | 165.992.359 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| S570N | c.1709G>A | Exon 14 | 166.044.003 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| T1210M | c.3629C>T | Exon 21 | 166.013.820 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deler 3 sygdomme
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeler 3 sygdomme
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 1 sygdom
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeler 1 sygdom
- ACTL6Bactin like 6BDeler 1 sygdom
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deler 1 sygdom
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deler 1 sygdom
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 sygdom
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeler 1 sygdom
- ARXaristaless related homeoboxDeler 1 sygdom
Træk knyttet til SCN1A
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SCN1A kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- IQ less than 20
- Migraine with aura
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Abnormal speech pattern
Vis 132 træk mere
- Absent speech development
- Ataxia
- Cognitive impairment
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- EEG with focal spike waves
- Encephalopathy
- Fear of loud sounds
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Generalized myoclonic-atonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Degeneration of cerebrum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- EEG with polyspike wave complexes
- EEG with spike-wave complexes (>3.5 Hz)
- Epilepsia partialis continua
- Epilepsy
- Epileptic spasm
- Falls
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal emotional seizure with laughing
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized clonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hyperactive movements
- Intellectual disability, severe
- Interictal epileptiform activity
- Involuntary movements
- IQ between 34 and 49
- Irritability
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Mental deterioration
- More active than typical
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Personality disorder
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Pins and needles feeling
- Slow movements
- Small hippocampus
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tonic seizure
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal emotional state
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Action tremor
- Alien limb phenomenon
- Atypical absence status epilepticus
- Autism
- Brain degeneration
- Brain imaging abnormality
- Brisk reflexes
- Chorea
- Coma
- Cortical dysplasia
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- EEG with generalized slow activity
- EEG with irregular generalized spike and wave complexes
- EEG with spike-wave complexes
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Incoordination
- Lack of feeling, emotion, interest
- Language impairment
- Myoclonic absence seizure
- Paralysis on one side of body
- Poor fine motor coordination
- Poor social interactions
- Psychosis
- Repetitive movements
- Short attention span
- Simple febrile seizure
- Spontaneous pain sensation
- Tremor
- Unsteady walk
- Abnormal pyramidal sign
- EEG with focal sharp waves
- Epileptic encephalopathy
- Repeated seizures without recovery between them
- Motor delay
- Visually-induced seizure
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SCN1A-genet: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/scn1a
Dante Labs. SCN1A-genet: sodium voltage-gated channel alpha subunit 1 [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/scn1a
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger