Gen
ATP1A2
ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2
- HGNC 800↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000018625↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 477↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 1q23.2
- Współrzędne
- Chromosom 1: 160 115 759–160 143 591 (GRCh38)
- Eksony
- 23 eksonów na odcinku 27,8 kb
- Białko
- 1020 aminokwasów
- Znany również jako
- FHM2
- Poprzednie symbole
- MHP2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000361216.8NM_000702.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp1a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj ATP1A2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Rodzinna migrena hemiplegiczna
- Spektrum hemiplegicznej migreny – rozwojowej i padaczkowej encefalopatii
Spektrum, w którym u osób mogą występować fenotypy od hemiplegicznej migreny bez padaczki po rozwojową i padaczkową encefalopatię, z lub bez epizodycznego porażenia połowiczego albo innych postaci niedowładu. Objawy i ich nasilenie mogą się różnić w obrębie tej samej rodziny.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 1 podmiot w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
- Migrena rodzinna hemiplegiczna, 2Autosomalne dominujące
Każda rodzinna lub sporadyczna migrena hemiplegiczna, której przyczyną jest mutacja w genie ATP1A2.
- 5 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
- Autosomalne dominujące
Zaburzenie migrenowe charakteryzujące się indywidualnym i rodzinnym wywiadem aury obejmującej osłabienie motoryczne.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 6 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
- Rodzinna lub sporadyczna migrena hemiplegicznaAutosomalne dominujące
Migrena hemiplegiczna (HM) to rzadka odmiana migreny z aurą, charakteryzująca się występowaniem osłabienia motorycznego podczas aury. Migrena hemiplegiczna występuje w dwóch głównych postaciach, zależnie od historii rodzinnej: u pacjentów, u których co najmniej jeden krewny pierwszego lub drugiego stopnia ma aurę obejmującą osłabienie motoryczne, rozpoznaje się rodzinną migrenę hemiplegiczną (FHM); u pacjentów bez takiego obciążenia rodzinnego rozpoznaje się sporadyczną migrenę hemiplegiczną (SHM).
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 6 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Płodowa akinezja, polimikrogyria związana z ATP1A2
- Płodowa akinezja, niewydolność oddechowa, mikrocefalia, polimikrogyria i dysmorficzne rysy twarzyAutosomalne recesywne
FARIMPD jest spowodowana zmianami w obu kopiach genu ATP1A2, który koduje część pompy sodowo-potasowej w komórkach mózgu i mięśni; opisywane zmiany znoszą funkcję tego genu. Zmiana w jednej kopii genu ATP1A2 powoduje inną chorobę, rodzinną hemiplegiczną migrenę.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Leczenie ma charakter wspomagający i koncentruje się na komforcie oraz wsparciu oddechowym; decyzje podejmuje się wspólnie z rodziną. Poradnictwo genetyczne jest ważne: rodzice są zazwyczaj nosicielami, a każda kolejna ciąża wiąże się z ryzykiem wystąpienia choroby; można omówić badanie prenatalne lub preimplantacyjne.
Szersze grupy
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu ATP1A2
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 5,4 kb z 27,8 kb genu; 3063 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie ATP1A2
2Łatwy
Stopień trudności sekwencjonowania genu ATP1A2 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niemal wszystkie eksony genu ATP1A2 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu ATP1A2 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.2,2%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 15%.1,9%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.4,7%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu ATP1A2 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
121
pozycje w ATP1A2, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Z nich 6 (5%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (6 miejsc)
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 27,8 kb genu ATP1A2, łącznie z intronami, a nie tylko 5,4 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (125)
The ATP1A2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 72
- Prawdopodobnie patogenny 53
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_000702.4(ATP1A2):c.1091C>T (p.Thr364Met) (opens in a new tab) | migraine, familial hemiplegic, 2 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.2563G>A (p.Gly855Arg) (opens in a new tab) | alternating hemiplegia of childhood 1 and 4 others | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.2936C>T (p.Pro979Leu) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine and 1 other | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.36dup (p.Ala13fs) (opens in a new tab) | alternating hemiplegia of childhood 1 and 3 others | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.188del (p.Asn63fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.524del (p.Lys175fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.580G>T (p.Gly194Ter) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.605G>A (p.Arg202Gln) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.659C>T (p.Ser220Leu) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine and 1 other | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.720_721del (p.Ile240fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.736_739del (p.Asn246fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.788C>T (p.Thr263Met) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy 98 and 2 others | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.855dup (p.Ile286fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.869_872del (p.Ile290fs) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.879C>G (p.Ile293Met) (opens in a new tab) | alternating hemiplegia of childhood 1 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.889G>A (p.Ala297Thr) (opens in a new tab) | alternating hemiplegia of childhood 1 and 2 others | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.901G>A (p.Gly301Arg) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine and 1 other | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.953C>A (p.Ala318Glu) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.970G>A (p.Gly324Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy 98 and 2 others | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.988G>A (p.Val330Met) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.991C>G (p.Pro331Ala) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.1096G>A (p.Gly366Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy 98 and 1 other | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.1097G>T (p.Gly366Val) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.1124A>G (p.Lys375Arg) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000702.4(ATP1A2):c.1127C>T (p.Thr376Met) (opens in a new tab) | familial hemiplegic migraine | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
See all 125 with every other ATP1A2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 AWspólnych schorzeń: 3
- SCN1Asodium voltage-gated channel alpha subunit 1Wspólnych schorzeń: 3
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem ATP1A2
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać ATP1A2. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal cortical gyration
- Aplasia/Hypoplasia of the pyramidal tract
- Difficulty finding words
- Episodic hemiplegia
- Episodic quadriplegia
- Migraine
- More grooves in brain
- Weakness of one side of body
Pokaż jeszcze 87 cech
- Abnormal speech pattern
- Confusion
- EEG abnormality
- Encephalopathy
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Migraine with aura
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormality of coordination
- Ataxia
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Coma
- Complex febrile seizure
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Involuntary movements
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Pins and needles feeling
- Progressive gait ataxia
- Refractory status epilepticus
- Seizure affecting one half of brain
- Tetraparesis
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Alien limb phenomenon
- Attention deficit
- Autism
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brain degeneration
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Chorea
- Choreoathetosis
- Clonic seizure
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with burst suppression
- EEG with generalized sharp slow waves
- Headache
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Language impairment
- Mental deterioration
- Paralysis on one side of body
- Paroxysmal dyskinesia
- Pauses in breathing while sleeping
- Perisylvian polymicrogyria
- Poor eye contact
- Repeated seizures without recovery between them
- Spontaneous pain sensation
- Thick corpus callosum
- Thin corpus callosum
- Tremor
- Unsteady walk
- Worsening neurological symptoms
- EEG with focal sharp waves
- Apraxia
- Brain imaging abnormality
- Drowsiness
- Episodic ataxia
Abnormality of the digestive system
- Nausea
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Inguinal hernia
Pokaż jeszcze 5 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-18: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-8b139e39.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen ATP1A2: ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/atp1a2
Dante Labs. Gen ATP1A2: ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/atp1a2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni